More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_5120 on replicon NC_013747
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013747  Htur_5120  type II secretion system protein E  100 
 
 
648 aa  1257    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0155589  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0015  type II secretion system protein E  60.76 
 
 
644 aa  702    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.529162  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3057  type II secretion system protein E  52.68 
 
 
617 aa  494  9.999999999999999e-139  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.901701  normal  0.440204 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0195  type II secretion system protein E  47.46 
 
 
650 aa  445  1e-123  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.617369 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3710  hypothetical protein  40.18 
 
 
932 aa  277  4e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.384037  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0047  type II secretion system protein E  37.77 
 
 
514 aa  263  8e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2814  type II secretion system protein E  29.74 
 
 
556 aa  117  6.9999999999999995e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2386  type II secretion system protein E  26.94 
 
 
692 aa  117  7.999999999999999e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.934402  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1344  type II secretion system protein E  31.96 
 
 
491 aa  115  3e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.286284 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1064  type II secretion system protein E  29.17 
 
 
591 aa  114  8.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1500  type II secretion system protein E  27.84 
 
 
682 aa  111  4.0000000000000004e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0597313  normal  0.0634104 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1204  type II secretion system protein E  27.79 
 
 
519 aa  110  6e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.431618  hitchhiker  0.000463314 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0997  type II secretion system protein E  27.81 
 
 
546 aa  110  9.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1870  type II secretion system protein E  30.1 
 
 
492 aa  109  1e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0816791  normal  0.90316 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  30.1 
 
 
492 aa  110  1e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0948  type II secretion system protein E  27.06 
 
 
546 aa  109  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0975  type II secretion system protein E  27.03 
 
 
546 aa  109  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.844334  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  31.2 
 
 
452 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0424  type II secretion system protein E  28.31 
 
 
489 aa  108  4e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.983223 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0439  type II secretion system protein E  27.79 
 
 
671 aa  107  8e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0267  type II secretion system protein E  25.56 
 
 
543 aa  106  2e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1732  type II secretion system protein E  26.26 
 
 
546 aa  105  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1537  aminoacyl-tRNA hydrolase  25.52 
 
 
583 aa  105  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20083  hitchhiker  0.0017261 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3170  type II secretion system protein E  28.19 
 
 
609 aa  105  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35920  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  34.53 
 
 
395 aa  104  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2148  type II secretion system protein E  27.95 
 
 
831 aa  104  5e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0453138 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  29.59 
 
 
510 aa  104  5e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2540  type II/IV secretion system protein  31.52 
 
 
446 aa  103  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511754  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0104  type II secretion system protein E  26.76 
 
 
620 aa  103  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  29.65 
 
 
483 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  30.52 
 
 
449 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  32.57 
 
 
454 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1655  type II secretion system protein E  31.66 
 
 
469 aa  102  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0949  type II secretion system protein E  29.03 
 
 
617 aa  102  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0134957  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1944  type II/IV secretion system protein  31.52 
 
 
447 aa  102  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000254156  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  29.32 
 
 
485 aa  102  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1791  type II/IV secretion system protein  31.52 
 
 
447 aa  102  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.24079  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1445  type II secretion system protein E  33.14 
 
 
455 aa  102  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314248  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  31.2 
 
 
450 aa  102  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2796  putative type II/IV secretion ATPase protein, TadA  31.44 
 
 
469 aa  102  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178047  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2721  type II secretion system protein E  29.24 
 
 
542 aa  102  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.261716 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1770  type II/IV secretion system protein  31.52 
 
 
447 aa  102  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3137  type II secretion system protein E  27.07 
 
 
1319 aa  101  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446325  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1318  type II secretion system protein E  29.47 
 
 
547 aa  101  4e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.101894  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2859  type II secretion system protein E  28.76 
 
 
847 aa  101  4e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0352  type II secretion system protein E  26.83 
 
 
610 aa  101  5e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.540636  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1965  flagella related protein FlaI  24.4 
 
 
604 aa  100  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0254  type II secretion system protein E  28.67 
 
 
654 aa  100  7e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3512  type II secretion system protein E  29.97 
 
 
449 aa  100  7e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.657436  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0946  type II secretion system protein E  27.07 
 
 
1335 aa  100  9e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0276  type II secretion system protein E  33.88 
 
 
372 aa  100  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  28.79 
 
 
482 aa  99.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0537  type II secretion system protein E  31.96 
 
 
440 aa  99.8  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590174  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  28.71 
 
 
482 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4663  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  31.71 
 
 
447 aa  99.8  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0858858  decreased coverage  0.000709192 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1032  type II secretion system protein E  27.6 
 
 
551 aa  99  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.621216  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2408  type II secretion system protein E  27.83 
 
 
407 aa  99.8  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.114072 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0518  type II secretion system protein E  32.47 
 
 
389 aa  99.4  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  29.34 
 
 
485 aa  98.6  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1499  type II secretion system protein E  31.43 
 
 
450 aa  98.6  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000031609 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0314  type II secretion system protein E  25.93 
 
 
991 aa  98.6  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.281088  normal  0.2578 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  26.99 
 
 
428 aa  99  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0448  type II secretion system protein E  27.86 
 
 
797 aa  98.6  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1043  type II secretion system protein E  31.43 
 
 
450 aa  98.6  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.994378  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1523  type II secretion system protein E  31.43 
 
 
450 aa  98.6  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.68059  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  28.48 
 
 
433 aa  99  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  26.99 
 
 
428 aa  99  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000662566  hitchhiker  0.0000000763288 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  26.99 
 
 
428 aa  99  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1730  type II secretion system protein E  32.86 
 
 
447 aa  98.2  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000224608 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1862  type II secretion system protein E  28.34 
 
 
618 aa  98.2  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  28.96 
 
 
476 aa  98.6  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  26.58 
 
 
500 aa  98.2  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  28.48 
 
 
490 aa  97.8  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2673  type II secretion system protein E  28.3 
 
 
407 aa  97.8  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  28.79 
 
 
484 aa  98.2  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  28.39 
 
 
480 aa  97.8  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0196  type II secretion system protein E  27.78 
 
 
577 aa  97.8  6e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191118  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4360  type II secretion system protein E  28.92 
 
 
451 aa  97.8  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4250  type II secretion system protein E  28.92 
 
 
451 aa  97.8  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  29.02 
 
 
482 aa  97.4  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  29.02 
 
 
482 aa  97.4  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  28.18 
 
 
467 aa  97.4  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1034  type II secretion system protein E  31.37 
 
 
450 aa  97.1  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  28.71 
 
 
488 aa  97.1  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1085  secretion ATPase protein  28.92 
 
 
450 aa  96.3  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  28.76 
 
 
491 aa  96.3  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  28.71 
 
 
463 aa  96.3  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1906  type II secretion system protein E  26.45 
 
 
749 aa  95.5  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124978  normal  0.483962 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  29.58 
 
 
482 aa  95.9  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  28.97 
 
 
438 aa  96.3  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4297  type II secretion system protein E  31.82 
 
 
422 aa  95.5  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0512015  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  29.74 
 
 
477 aa  95.5  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0650  type II secretion system protein E  25.71 
 
 
572 aa  95.1  3e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.200962 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0072  type II secretion system protein E  28.26 
 
 
408 aa  94.7  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.928138  normal  0.608061 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20420  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  29.33 
 
 
408 aa  95.1  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.441197  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  28.43 
 
 
491 aa  94.4  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0729  type II secretion system protein E  34.21 
 
 
390 aa  94.4  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0978  type II secretion system protein E  26.71 
 
 
1255 aa  94  7e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.742375  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  27.58 
 
 
489 aa  94  8e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  26.29 
 
 
412 aa  93.2  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>