More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0047 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3710  hypothetical protein  60.44 
 
 		 932 aa  688    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.384037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0047  type II secretion system protein E  100 
 
 		 514 aa  1056    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0015  type II secretion system protein E  38.5 
 
 		 644 aa  272  1e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.529162  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5120  type II secretion system protein E  37.77 
 
 		 648 aa  252  1e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0155589  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0195  type II secretion system protein E  35.5 
 
 		 650 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.617369 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3057  type II secretion system protein E  40.78 
 
 		 617 aa  221  3.9999999999999997e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.901701  normal  0.440204 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0424  type II secretion system protein E  28.09 
 
 		 489 aa  138  2e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.983223 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  32.44 
 
 		 492 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1870  type II secretion system protein E  32.44 
 
 		 492 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0816791  normal  0.90316 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  27.17 
 
 		 510 aa  128  3e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1043  type II secretion system protein E  29.23 
 
 		 450 aa  127  7e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.994378  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1523  type II secretion system protein E  29.23 
 
 		 450 aa  127  7e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.68059  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1499  type II secretion system protein E  29.23 
 
 		 450 aa  127  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000031609 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2540  type II/IV secretion system protein  28.57 
 
 		 446 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511754  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1944  type II/IV secretion system protein  29.12 
 
 		 447 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000254156  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  27.43 
 
 		 481 aa  126  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1770  type II/IV secretion system protein  29.12 
 
 		 447 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1791  type II/IV secretion system protein  29.12 
 
 		 447 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.24079  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4663  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  29.23 
 
 		 447 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0858858  decreased coverage  0.000709192 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  29.23 
 
 		 454 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1500  type II secretion system protein E  26.62 
 
 		 682 aa  125  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0597313  normal  0.0634104 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2796  putative type II/IV secretion ATPase protein, TadA  29.92 
 
 		 469 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178047  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1655  type II secretion system protein E  29.19 
 
 		 469 aa  124  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  28.93 
 
 		 440 aa  123  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  26.89 
 
 		 412 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4360  type II secretion system protein E  28.37 
 
 		 451 aa  121  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4250  type II secretion system protein E  28.37 
 
 		 451 aa  121  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3170  type II secretion system protein E  28.98 
 
 		 609 aa  121  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1445  type II secretion system protein E  28.94 
 
 		 455 aa  121  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1204  type II secretion system protein E  28.64 
 
 		 519 aa  120  3.9999999999999996e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.431618  hitchhiker  0.000463314 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  29.63 
 
 		 438 aa  120  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1344  type II secretion system protein E  31.58 
 
 		 491 aa  119  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.286284 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  28.74 
 
 		 438 aa  119  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0503  type II secretion system protein E  28.9 
 
 		 411 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.731601  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1730  type II secretion system protein E  28.32 
 
 		 447 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000224608 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1085  secretion ATPase protein  27.81 
 
 		 450 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  26.76 
 
 		 478 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3422  type II secretion system protein E  29.53 
 
 		 468 aa  117  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.351074  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2323  type II secretion system protein E  27.79 
 
 		 449 aa  117  6.9999999999999995e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.935094 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  27.91 
 
 		 440 aa  115  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  27.86 
 
 		 463 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1965  flagella related protein FlaI  25.54 
 
 		 604 aa  114  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  27.76 
 
 		 463 aa  115  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1906  type II secretion system protein E  26.02 
 
 		 749 aa  113  6e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124978  normal  0.483962 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  29.41 
 
 		 445 aa  113  7.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1252  type II secretion system protein E  31.77 
 
 		 435 aa  113  7.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.877808  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  29.36 
 
 		 483 aa  113  8.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1537  aminoacyl-tRNA hydrolase  27.46 
 
 		 583 aa  113  9e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20083  hitchhiker  0.0017261 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  28.65 
 
 		 472 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  27.92 
 
 		 508 aa  112  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1862  type II secretion system protein E  26.17 
 
 		 618 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  28.57 
 
 		 482 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  29.13 
 
 		 452 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0254  type II secretion system protein E  24.65 
 
 		 654 aa  111  3e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  28.29 
 
 		 485 aa  111  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  28.29 
 
 		 482 aa  111  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.930862 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0196  type II secretion system protein E  27.06 
 
 		 577 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191118  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  29.13 
 
 		 450 aa  111  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  29.05 
 
 		 482 aa  110  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  30.04 
 
 		 500 aa  110  8.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  27.23 
 
 		 491 aa  109  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  26.49 
 
 		 485 aa  109  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  28.52 
 
 		 449 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0448  type II secretion system protein E  27.15 
 
 		 797 aa  109  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  26.65 
 
 		 458 aa  108  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  26.33 
 
 		 467 aa  108  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2386  type II secretion system protein E  26.22 
 
 		 692 aa  108  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.934402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  28.21 
 
 		 432 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  26.27 
 
 		 455 aa  108  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1325  type II secretion system protein E  25.19 
 
 		 512 aa  108  3e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00455821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1032  type II secretion system protein E  27.64 
 
 		 551 aa  108  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.621216  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2160  type II secretion system protein E  26.63 
 
 		 438 aa  107  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0397447  normal  0.0352451 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  27.58 
 
 		 473 aa  107  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2925  type II secretion system protein E  28.72 
 
 		 471 aa  107  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120672  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0267  type II secretion system protein E  29.43 
 
 		 543 aa  107  4e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2814  type II secretion system protein E  27.41 
 
 		 556 aa  107  5e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2859  type II secretion system protein E  27.37 
 
 		 847 aa  107  5e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  26.14 
 
 		 455 aa  107  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  29.17 
 
 		 476 aa  107  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2648  type II secretion system protein E  27.32 
 
 		 498 aa  107  6e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0537  type II secretion system protein E  32.2 
 
 		 440 aa  107  7e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  26.15 
 
 		 480 aa  106  9e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0949  type II secretion system protein E  25.72 
 
 		 617 aa  106  9e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0134957  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0128  type II secretion system protein E  26.5 
 
 		 513 aa  106  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1064  type II secretion system protein E  28.38 
 
 		 591 aa  106  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  29.25 
 
 		 441 aa  105  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  28.32 
 
 		 474 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  26.97 
 
 		 455 aa  106  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  27.87 
 
 		 433 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2692  type II secretion system protein E  28.87 
 
 		 462 aa  106  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0009  type II secretion system protein E  25.73 
 
 		 547 aa  106  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  25.85 
 
 		 455 aa  106  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  27.32 
 
 		 444 aa  106  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  26.7 
 
 		 491 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0314  type II secretion system protein E  26.28 
 
 		 991 aa  105  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.281088  normal  0.2578 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  27.3 
 
 		 482 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  26.85 
 
 		 442 aa  105  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  25.19 
 
 		 463 aa  105  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  27.52 
 
 		 477 aa  104  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1206  type II secretion system protein E  25.92 
 
 		 742 aa  104  3e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00140506  hitchhiker  0.00000000000153533 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>