More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3710 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3710  hypothetical protein  100 
 
 		 932 aa  1905    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.384037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0047  type II secretion system protein E  60.44 
 
 		 514 aa  688    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0015  type II secretion system protein E  41.71 
 
 		 644 aa  279  2e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.529162  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5120  type II secretion system protein E  41.01 
 
 		 648 aa  272  2e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0155589  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0195  type II secretion system protein E  36.12 
 
 		 650 aa  257  6e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.617369 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3057  type II secretion system protein E  36.65 
 
 		 617 aa  249  2e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.901701  normal  0.440204 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  30.54 
 
 		 492 aa  134  7.999999999999999e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1870  type II secretion system protein E  30.2 
 
 		 492 aa  130  1.0000000000000001e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0816791  normal  0.90316 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1344  type II secretion system protein E  33.09 
 
 		 491 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.286284 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1500  type II secretion system protein E  27.34 
 
 		 682 aa  128  5e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0597313  normal  0.0634104 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1204  type II secretion system protein E  27.89 
 
 		 519 aa  126  2e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.431618  hitchhiker  0.000463314 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0424  type II secretion system protein E  26.39 
 
 		 489 aa  122  3.9999999999999996e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.983223 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  31.9 
 
 		 449 aa  122  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1965  flagella related protein FlaI  25.83 
 
 		 604 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  26.33 
 
 		 510 aa  117  7.999999999999999e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  27.25 
 
 		 463 aa  117  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  26.34 
 
 		 458 aa  117  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0448  type II secretion system protein E  25.97 
 
 		 797 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  26.7 
 
 		 455 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2796  putative type II/IV secretion ATPase protein, TadA  30.75 
 
 		 469 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178047  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  28.4 
 
 		 481 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0254  type II secretion system protein E  25.85 
 
 		 654 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0503  type II secretion system protein E  28.37 
 
 		 411 aa  116  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.731601  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1043  type II secretion system protein E  31.38 
 
 		 450 aa  115  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.994378  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  28.09 
 
 		 460 aa  115  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  26.7 
 
 		 455 aa  115  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1523  type II secretion system protein E  31.38 
 
 		 450 aa  115  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.68059  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1499  type II secretion system protein E  31.38 
 
 		 450 aa  115  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000031609 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1655  type II secretion system protein E  30.75 
 
 		 469 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  29.41 
 
 		 454 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  31.99 
 
 		 438 aa  115  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  31.71 
 
 		 440 aa  115  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  29.09 
 
 		 478 aa  114  6e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  29.56 
 
 		 441 aa  115  6e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  29.64 
 
 		 452 aa  114  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  30.56 
 
 		 444 aa  114  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2540  type II/IV secretion system protein  31.49 
 
 		 446 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511754  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1445  type II secretion system protein E  30.03 
 
 		 455 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  26.94 
 
 		 455 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4663  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  30.69 
 
 		 447 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0858858  decreased coverage  0.000709192 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  26.94 
 
 		 455 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0946  type II secretion system protein E  27.65 
 
 		 1335 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1862  type II secretion system protein E  26.91 
 
 		 618 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  26.94 
 
 		 455 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2721  type II secretion system protein E  24.95 
 
 		 542 aa  112  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.261716 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  30.58 
 
 		 472 aa  112  3e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  28.43 
 
 		 455 aa  112  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  28.26 
 
 		 412 aa  112  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1944  type II/IV secretion system protein  31.49 
 
 		 447 aa  112  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000254156  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  29.32 
 
 		 450 aa  112  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1791  type II/IV secretion system protein  31.49 
 
 		 447 aa  112  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.24079  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1770  type II/IV secretion system protein  31.49 
 
 		 447 aa  112  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3170  type II secretion system protein E  24.95 
 
 		 609 aa  111  5e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3137  type II secretion system protein E  27.2 
 
 		 1319 aa  111  5e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446325  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0439  type II secretion system protein E  25.87 
 
 		 671 aa  111  5e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2323  type II secretion system protein E  30.91 
 
 		 449 aa  111  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.935094 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  26.9 
 
 		 455 aa  111  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  27.36 
 
 		 473 aa  111  6e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1730  type II secretion system protein E  29.85 
 
 		 447 aa  111  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000224608 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4360  type II secretion system protein E  30.21 
 
 		 451 aa  111  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4250  type II secretion system protein E  30.21 
 
 		 451 aa  111  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2859  type II secretion system protein E  27.53 
 
 		 847 aa  110  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  31.25 
 
 		 438 aa  110  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0128  type II secretion system protein E  28.21 
 
 		 513 aa  109  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  28.22 
 
 		 454 aa  109  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1906  type II secretion system protein E  23.57 
 
 		 749 aa  109  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124978  normal  0.483962 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0853  type II secretion system protein E  27.48 
 
 		 311 aa  109  2e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0949  type II secretion system protein E  26.84 
 
 		 617 aa  109  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0134957  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0731  type II secretion system protein  24.93 
 
 		 558 aa  109  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2692  type II secretion system protein E  30.03 
 
 		 462 aa  109  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  27.78 
 
 		 483 aa  109  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  28.22 
 
 		 454 aa  109  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  28.22 
 
 		 454 aa  109  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  27.16 
 
 		 462 aa  109  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1318  type II secretion system protein E  29.15 
 
 		 547 aa  109  3e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.101894  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0352  type II secretion system protein E  26.36 
 
 		 610 aa  108  4e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.540636  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1032  type II secretion system protein E  27.31 
 
 		 551 aa  108  4e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.621216  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  27.36 
 
 		 445 aa  108  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  28.15 
 
 		 491 aa  108  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  27.54 
 
 		 479 aa  107  8e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  26.95 
 
 		 485 aa  107  8e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1085  secretion ATPase protein  29.86 
 
 		 450 aa  107  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  28.09 
 
 		 451 aa  107  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0006  type II secretion system protein E  24.41 
 
 		 545 aa  107  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  28.25 
 
 		 445 aa  107  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  27.78 
 
 		 624 aa  107  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  29.32 
 
 		 500 aa  107  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  32.69 
 
 		 440 aa  107  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1325  type II secretion system protein E  28.77 
 
 		 512 aa  107  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00455821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  27.67 
 
 		 488 aa  107  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  30.15 
 
 		 482 aa  106  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  26.95 
 
 		 482 aa  106  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  29.07 
 
 		 455 aa  106  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0196  type II secretion system protein E  29.62 
 
 		 577 aa  105  3e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191118  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1034  type II secretion system protein E  29.29 
 
 		 450 aa  105  3e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4297  type II secretion system protein E  29.18 
 
 		 422 aa  105  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0512015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2814  type II secretion system protein E  27.15 
 
 		 556 aa  105  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  26.74 
 
 		 457 aa  105  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  26.89 
 
 		 472 aa  105  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  26.42 
 
 		 482 aa  105  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.930862 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>