More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0195 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0195  type II secretion system protein E  100 
 
 		 650 aa  1252    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.617369 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3057  type II secretion system protein E  53.6 
 
 		 617 aa  481  1e-134  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.901701  normal  0.440204 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0015  type II secretion system protein E  45.95 
 
 		 644 aa  460  9.999999999999999e-129  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.529162  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5120  type II secretion system protein E  47.46 
 
 		 648 aa  442  1e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0155589  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3710  hypothetical protein  36.12 
 
 		 932 aa  257  4e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.384037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0047  type II secretion system protein E  35.5 
 
 		 514 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1537  aminoacyl-tRNA hydrolase  25.59 
 
 		 583 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20083  hitchhiker  0.0017261 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  30.63 
 
 		 467 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  29.5 
 
 		 482 aa  108  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  30.03 
 
 		 490 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  29.91 
 
 		 433 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  29.88 
 
 		 483 aa  106  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1204  type II secretion system protein E  28.11 
 
 		 519 aa  104  4e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.431618  hitchhiker  0.000463314 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2859  type II secretion system protein E  29.93 
 
 		 847 aa  105  4e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  29.61 
 
 		 484 aa  104  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  28.77 
 
 		 482 aa  103  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0314  type II secretion system protein E  25.45 
 
 		 991 aa  103  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.281088  normal  0.2578 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  28.18 
 
 		 488 aa  103  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  29.61 
 
 		 489 aa  103  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  29.5 
 
 		 500 aa  103  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1500  type II secretion system protein E  25 
 
 		 682 aa  102  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0597313  normal  0.0634104 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1032  type II secretion system protein E  25.73 
 
 		 551 aa  102  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.621216  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  26.51 
 
 		 441 aa  102  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  30.28 
 
 		 476 aa  102  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1252  type II secretion system protein E  31.73 
 
 		 435 aa  102  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.877808  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  30.49 
 
 		 449 aa  101  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2814  type II secretion system protein E  29.53 
 
 		 556 aa  101  4e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1197  type II secretion system protein E  28.44 
 
 		 483 aa  101  4e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.585907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2148  type II secretion system protein E  28.33 
 
 		 831 aa  101  5e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0453138 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0214  component of type IV pilus  28.77 
 
 		 492 aa  100  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  26.8 
 
 		 508 aa  100  7e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  29.24 
 
 		 442 aa  100  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  29.64 
 
 		 485 aa  100  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  28.61 
 
 		 482 aa  100  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1064  type II secretion system protein E  28.12 
 
 		 591 aa  100  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  28.61 
 
 		 482 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  28.61 
 
 		 485 aa  99.4  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  28.4 
 
 		 488 aa  99  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  31.18 
 
 		 451 aa  98.2  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0104  type II secretion system protein E  26.77 
 
 		 620 aa  98.2  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  30.25 
 
 		 477 aa  97.8  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  27.19 
 
 		 491 aa  97.4  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  31.52 
 
 		 481 aa  97.1  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  29.25 
 
 		 477 aa  97.4  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0726  type II secretion system protein E  29.25 
 
 		 492 aa  97.1  9e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50497  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  29.71 
 
 		 457 aa  96.7  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0537  type II secretion system protein E  32.05 
 
 		 440 aa  96.7  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0448  type II secretion system protein E  25.46 
 
 		 797 aa  96.7  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  29.12 
 
 		 438 aa  95.9  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  27.57 
 
 		 624 aa  95.9  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  28.71 
 
 		 480 aa  96.3  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2687  type II secretion system protein E  25.11 
 
 		 549 aa  95.9  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  28.13 
 
 		 463 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  29.71 
 
 		 454 aa  95.5  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0949  type II secretion system protein E  26.07 
 
 		 617 aa  95.9  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0134957  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2355  type II secretion system protein E  25.33 
 
 		 628 aa  95.5  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.692167  normal  0.583317 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  28.48 
 
 		 478 aa  95.1  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  29.05 
 
 		 482 aa  94.4  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2400  type II secretion system protein E  23.96 
 
 		 549 aa  94.7  5e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1906  type II secretion system protein E  26.13 
 
 		 749 aa  94.7  5e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124978  normal  0.483962 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3170  type II secretion system protein E  27.9 
 
 		 609 aa  94.4  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  27.19 
 
 		 491 aa  94.4  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  27.73 
 
 		 428 aa  94  7e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  25.94 
 
 		 478 aa  94  8e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2386  type II secretion system protein E  27.3 
 
 		 692 aa  94  8e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.934402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3137  type II secretion system protein E  28.48 
 
 		 1319 aa  94  9e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446325  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  28.71 
 
 		 472 aa  93.6  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1344  type II secretion system protein E  32.5 
 
 		 491 aa  93.6  1e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.286284 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  24.27 
 
 		 428 aa  93.6  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  24.27 
 
 		 428 aa  93.6  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000662566  hitchhiker  0.0000000763288 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  24.27 
 
 		 428 aa  93.6  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  29.91 
 
 		 452 aa  93.2  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  26.98 
 
 		 445 aa  93.6  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  29.7 
 
 		 450 aa  92.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4190  type II secretion system protein E  27.35 
 
 		 504 aa  92.4  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0978  type II secretion system protein E  26.33 
 
 		 1255 aa  93.2  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.742375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0946  type II secretion system protein E  26.85 
 
 		 1335 aa  92.8  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  26.95 
 
 		 412 aa  92.8  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  28.14 
 
 		 472 aa  92  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0009  type II secretion system protein E  27.65 
 
 		 547 aa  92.4  3e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  28.1 
 
 		 479 aa  91.3  5e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  28.14 
 
 		 472 aa  91.3  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1109  type II secretion system protein E  27.62 
 
 		 608 aa  91.3  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.280352  normal  0.0921606 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2721  type II secretion system protein E  27.3 
 
 		 542 aa  91.3  5e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.261716 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  30.24 
 
 		 453 aa  90.9  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  28.22 
 
 		 474 aa  91.3  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0503  type II secretion system protein E  27.76 
 
 		 411 aa  90.9  7e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.731601  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  30.24 
 
 		 468 aa  90.9  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  29.09 
 
 		 455 aa  90.5  8e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  27.27 
 
 		 473 aa  90.5  9e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  25.77 
 
 		 460 aa  89.7  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  28.66 
 
 		 455 aa  89.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1172  type II secretion system protein E  25.23 
 
 		 640 aa  90.1  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00958345  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  28.79 
 
 		 455 aa  89.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  28.79 
 
 		 455 aa  89.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0439  type II secretion system protein E  25.73 
 
 		 671 aa  89.4  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2363  type II/IV secretion system protein  28.16 
 
 		 560 aa  89  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.158902  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35920  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  33.98 
 
 		 395 aa  89  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0424  type II secretion system protein E  27.69 
 
 		 489 aa  88.2  4e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.983223 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3536  type II secretion system protein E  26.79 
 
 		 612 aa  88.2  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>