More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1010 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1010  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 73 aa  145  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00899291  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1536  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 357 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.413488  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3743  transcriptional regulator, LuxR family  49.15 
 
 		 286 aa  57.4  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4222  ATP-dependent transcription regulator LuxR  47.54 
 
 		 309 aa  57  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.157864 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06630  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  43.86 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.252447  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0612  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.105579 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1337  regulatory protein, LuxR  52.94 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1565  response regulator receiver protein  49.15 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0799  response regulator receiver protein  52.73 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403434 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1543  LuxR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.24149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38420  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  57.69 
 
 		 226 aa  54.7  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4561  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.55 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4865  response regulator receiver protein  48.28 
 
 		 281 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0959639 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.62 
 
 		 235 aa  54.3  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8304  transcriptional regulator, LuxR family  46.88 
 
 		 1084 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1228  LuxR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 204 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 209 aa  53.9  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1418  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.17 
 
 		 249 aa  53.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4208  ATP-dependent transcription regulator LuxR  50 
 
 		 894 aa  53.9  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4254  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.28 
 
 		 225 aa  53.9  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.867992  normal  0.287586 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4194  LuxR family GAF modulated transcriptional regulator  53.57 
 
 		 285 aa  53.9  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0104113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4820  putative GAF sensor protein  45.76 
 
 		 285 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03860  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  50.88 
 
 		 204 aa  53.5  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0649288  normal  0.281143 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3161  two component response regulator transcription regulator protein  50 
 
 		 231 aa  52.8  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0993  regulatory protein, LuxR  51.72 
 
 		 920 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.962183  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4439  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.09 
 
 		 224 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0808  ATP-dependent transcription regulator LuxR  51.72 
 
 		 905 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4439  ATP-dependent transcription regulator LuxR  45.76 
 
 		 285 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1895  ATP-dependent transcription regulator LuxR  44.26 
 
 		 867 aa  52.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283939  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4896  response regulator receiver  50.91 
 
 		 215 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.446448  normal  0.220667 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4526  putative GAF sensor protein  45.76 
 
 		 285 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1584  regulatory protein, LuxR  42.86 
 
 		 916 aa  52.8  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2693  regulatory protein, LuxR  51.67 
 
 		 891 aa  53.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.602772  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3486  hypothetical protein  49.06 
 
 		 206 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4096  two component LuxR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 237 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.811447  normal  0.807841 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1706  transcriptional regulator  47.54 
 
 		 827 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1000  two component LuxR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 177 aa  52  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00026015 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4026  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 200 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.105506  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  48.15 
 
 		 226 aa  52.4  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5287  transcriptional regulator, LuxR family  51.92 
 
 		 206 aa  52  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4906  response regulator receiver  50 
 
 		 205 aa  52.4  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.275081  normal  0.875639 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0892  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  49.15 
 
 		 896 aa  52.4  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 799 aa  52.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1136  regulatory protein, LuxR  53.57 
 
 		 868 aa  52  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.87643 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3658  regulatory protein, LuxR  52.54 
 
 		 914 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3222  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.46 
 
 		 218 aa  52.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000001545 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0606  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.28 
 
 		 212 aa  52.8  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2158  LuxR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 491 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3193  LuxR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 895 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1005  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.15 
 
 		 211 aa  51.6  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2523  regulatory protein, LuxR  51.72 
 
 		 879 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5287  two component response regulator  50 
 
 		 896 aa  51.6  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318061  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2357  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.38 
 
 		 234 aa  51.2  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0767  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 905 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00210  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  45.45 
 
 		 221 aa  51.6  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.133182 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3423  sensor protein  49.18 
 
 		 496 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2084  LuxR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 288 aa  51.6  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2246  ATP-dependent transcription regulator LuxR  45.61 
 
 		 914 aa  51.2  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.220145  normal  0.0496967 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0447  two component LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 244 aa  51.2  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.013193  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4815  ATP-dependent transcription regulator LuxR  48.33 
 
 		 924 aa  51.6  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4001  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 217 aa  51.2  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.380782  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2289  regulatory protein LuxR  46.55 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301716 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1030  regulatory protein, LuxR  50.94 
 
 		 225 aa  51.2  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.210652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3551  transcriptional regulator, LuxR family  50.94 
 
 		 893 aa  51.6  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0504  transcriptional regulator, LuxR family  49.02 
 
 		 217 aa  51.2  0.000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0705101 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0794  regulatory protein, LuxR  50 
 
 		 905 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 220 aa  51.2  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1734  two component LuxR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 257 aa  51.2  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159279  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4986  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 237 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170484  normal  0.313407 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1051  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.91 
 
 		 211 aa  51.2  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2294  transcriptional regulator, LuxR family  52.83 
 
 		 253 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0925  response regulator receiver protein  46.3 
 
 		 119 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.592282  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 216 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4422  ATP-dependent transcription regulator LuxR  50 
 
 		 905 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0907  ATP-dependent transcription regulator LuxR  46.77 
 
 		 850 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0156  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 230 aa  50.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.379873  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0881  transcriptional regulator, LuxR family  42.37 
 
 		 266 aa  50.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5265  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.17 
 
 		 218 aa  50.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.83 
 
 		 225 aa  50.8  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1151  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 910 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3390  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 226 aa  50.8  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2689  two component LuxR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 224 aa  50.4  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.270095  normal  0.632538 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1186  transcriptional regulator  52.94 
 
 		 906 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2840  LuxR family two component transcriptional regulator  48.15 
 
 		 238 aa  50.4  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33010  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  52.73 
 
 		 223 aa  50.4  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.163463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0160  transcriptional regulator MalT  40.68 
 
 		 903 aa  50.4  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.814727  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13150  putative transcriptional regulator  52.94 
 
 		 906 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.697366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3994  transcriptional regulator MalT  40.68 
 
 		 903 aa  50.4  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38740  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  46.15 
 
 		 250 aa  50.4  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5070  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.83 
 
 		 210 aa  50.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.744929 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1769  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 219 aa  50.4  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221401  normal  0.0578747 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3324  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.51 
 
 		 219 aa  50.1  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0107044  normal  0.345616 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3676  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.82 
 
 		 214 aa  50.4  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0625047  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01100  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  49.09 
 
 		 214 aa  50.4  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4637  transcriptional regulator MalT  40.68 
 
 		 904 aa  50.4  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 208 aa  50.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1910  response regulator receiver protein  46.15 
 
 		 226 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238062  normal  0.36963 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4913  regulatory protein, LuxR  52.94 
 
 		 567 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4926  regulatory protein, LuxR  52.94 
 
 		 574 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2635  response regulator receiver  47.17 
 
 		 207 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>