More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3936 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3936  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 196 aa  370  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1490  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1488  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1512  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  33.11 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  29.87 
 
 		 291 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 191 aa  57  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0034  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.345685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0034  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2034  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.480509  normal  0.0875613 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0132  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.410533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 227 aa  54.7  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  49.02 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10920  transcriptional regulator  32.69 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 271 aa  54.7  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1864  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.370614  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  39.02 
 
 		 241 aa  54.3  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  40.23 
 
 		 246 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4572  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.270475 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 291 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5065  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174952  normal  0.51505 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0780  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 205 aa  53.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00331259  decreased coverage  0.000414604 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4115  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  39.19 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 237 aa  53.1  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3516  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 235 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7149  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 224 aa  52.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  36.23 
 
 		 230 aa  52.8  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 190 aa  52.8  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 207 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2681  transcriptional regulator, TetR family  51.72 
 
 		 209 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.387724  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  33.54 
 
 		 220 aa  52.4  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 200 aa  52.4  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 205 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0736  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 198 aa  52  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1028  regulatory protein TetR  38.96 
 
 		 262 aa  52.4  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190494  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 215 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 205 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 218 aa  52  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 214 aa  52  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 210 aa  52  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1499  TetR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 203 aa  52  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0951967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0620  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 193 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 236 aa  52  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0633  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 193 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0611  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 193 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 226 aa  51.6  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 222 aa  51.6  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2776  transcriptional regulator, TetR family  51.79 
 
 		 209 aa  51.6  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376535  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6216  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 208 aa  51.6  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 200 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1590  transcriptional regulator, TetR family  46 
 
 		 231 aa  51.6  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 183 aa  51.6  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1479  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 190 aa  51.6  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.210194  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 230 aa  51.6  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 219 aa  51.6  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3898  regulatory protein TetR  38.27 
 
 		 200 aa  51.2  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1362  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 211 aa  51.2  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 216 aa  51.2  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 237 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4412  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 252 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  39.53 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1550  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8504  putative transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 225 aa  50.4  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 497 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1981  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 227 aa  50.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0412771  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  39.53 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  33.72 
 
 		 230 aa  50.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5107  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.346129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  35.64 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  40.28 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4472  transcriptional regulator, TetR family  53.7 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.590949  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 202 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02663  transcriptional regulator  34.85 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0806616  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 234 aa  50.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  36.27 
 
 		 210 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1681  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.371055  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3172  transcriptional regulator, TetR family  34.75 
 
 		 198 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 227 aa  50.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>