279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2134 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2134  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
420 aa  833    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0485  TPR repeat-containing protein  75.12 
 
 
418 aa  588  1e-167  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1444  TPR repeat-containing protein  48.56 
 
 
420 aa  390  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3770  TPR domain protein  48.56 
 
 
420 aa  389  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1646  TPR domain-containing protein  48.56 
 
 
420 aa  387  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.804305  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1429  TPR domain-containing protein  48.33 
 
 
420 aa  386  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1401  TPR repeat-containing protein  48.09 
 
 
420 aa  385  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1401  TPR repeat-containing protein  48.56 
 
 
420 aa  387  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0553383  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1613  TPR domain protein  48.33 
 
 
420 aa  386  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.060004 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1541  TPR domain-containing protein  48.33 
 
 
420 aa  386  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1575  TPR domain protein  48.8 
 
 
420 aa  387  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1243  TPR repeat-containing protein  48.56 
 
 
420 aa  387  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.852694  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1682  TPR domain protein  48.33 
 
 
420 aa  386  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.327391  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0755  TPR repeat-containing protein  33.57 
 
 
421 aa  216  8e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0766  TPR repeat-containing protein  31.84 
 
 
421 aa  189  5.999999999999999e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00235749  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1522  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 
414 aa  183  6e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1551  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 
414 aa  183  6e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.261583  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1033  hypothetical protein  29.48 
 
 
414 aa  180  4e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0895  TPR repeat-containing protein  27.6 
 
 
433 aa  154  2e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000900502  hitchhiker  0.000000000000951989 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1193  TPR domain-containing protein  27.98 
 
 
408 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1350  TPR repeat-containing protein  27.45 
 
 
418 aa  133  5e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.182598  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1097  TPR repeat-containing protein  27.88 
 
 
409 aa  126  9e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0987806  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1011  TPR repeat-containing protein  26.23 
 
 
413 aa  114  3e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.534766  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  25.1 
 
 
968 aa  76.3  0.0000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2954  TPR repeat-containing protein  20.88 
 
 
468 aa  71.2  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126198  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.28 
 
 
624 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  20.33 
 
 
577 aa  67.4  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.17 
 
 
810 aa  66.6  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.62 
 
 
2240 aa  66.2  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  23.73 
 
 
586 aa  66.2  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  24.26 
 
 
808 aa  65.5  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  20.05 
 
 
577 aa  64.7  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1530  TPR repeat-containing protein  24.11 
 
 
873 aa  64.3  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0304158  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 
402 aa  63.9  0.000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  24.41 
 
 
505 aa  63.2  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  23.72 
 
 
1056 aa  62.8  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  23.41 
 
 
486 aa  62  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  25.85 
 
 
1276 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  21.67 
 
 
878 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2716  hypothetical protein  24.74 
 
 
905 aa  60.8  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0426299  hitchhiker  0.00105391 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  23.05 
 
 
397 aa  60.5  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  25.5 
 
 
543 aa  60.8  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  25.19 
 
 
4079 aa  60.5  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  25.7 
 
 
568 aa  60.5  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  22.52 
 
 
1764 aa  60.1  0.00000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  23.09 
 
 
638 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  24.21 
 
 
465 aa  58.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  22.5 
 
 
860 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1238  TPR repeat-containing protein  24.61 
 
 
377 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  23.11 
 
 
366 aa  58.5  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3073  TPR repeat-containing protein  22.6 
 
 
886 aa  58.9  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  24.18 
 
 
1069 aa  58.2  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.51 
 
 
645 aa  58.9  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000607684  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  24.38 
 
 
927 aa  58.2  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  23.19 
 
 
754 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.03 
 
 
639 aa  58.2  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.6 
 
 
1056 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  24.63 
 
 
745 aa  57.4  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  24.81 
 
 
804 aa  57.4  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1722  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.23 
 
 
354 aa  57  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  25.94 
 
 
602 aa  56.6  0.0000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  22.31 
 
 
632 aa  56.6  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1745  TPR repeat-containing protein  23.59 
 
 
402 aa  56.6  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  23.28 
 
 
1154 aa  56.6  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1812  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.78 
 
 
406 aa  56.2  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.312909  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0616  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.49 
 
 
647 aa  55.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.1691e-34 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  20.56 
 
 
792 aa  55.8  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  24.88 
 
 
827 aa  55.1  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.04 
 
 
1186 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2755  TPR repeat-containing protein  25.07 
 
 
758 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.202192  normal  0.502255 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  23.43 
 
 
643 aa  54.7  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  23.61 
 
 
573 aa  53.9  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3132  tetratricopeptide repeat protein  33.04 
 
 
1400 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0761546 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0195  TPR repeat-containing protein  23.59 
 
 
931 aa  53.9  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  26.28 
 
 
399 aa  53.9  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  23.27 
 
 
3172 aa  53.9  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  23.68 
 
 
356 aa  53.9  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1976  TPR repeat-containing protein  32.17 
 
 
1400 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0781  TPR domain-containing protein  23.1 
 
 
924 aa  53.1  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.55707  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  20.33 
 
 
750 aa  53.1  0.000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1475  TPR repeat-containing protein  20.73 
 
 
467 aa  53.1  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260545  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.04 
 
 
632 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  21.3 
 
 
562 aa  52.8  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1308  Flp pilus assembly protein TadD  23.27 
 
 
272 aa  53.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.59735e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2013  TPR repeat-containing protein  32.61 
 
 
1402 aa  53.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  24.36 
 
 
405 aa  52.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  22.12 
 
 
2262 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  22.69 
 
 
573 aa  53.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1429  PDZ/DHR/GLGF domain protein  24.03 
 
 
668 aa  52  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000479067  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2240  hypothetical protein  33.02 
 
 
1400 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.274881  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  24.46 
 
 
393 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2185  tetratricopeptide repeat protein  32.17 
 
 
1400 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  21.59 
 
 
635 aa  52  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  22.81 
 
 
754 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6872  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.82 
 
 
1459 aa  52.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.795402 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  24.35 
 
 
1061 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 
767 aa  51.6  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13011  hypothetical protein  22.73 
 
 
737 aa  51.2  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113459 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  22.12 
 
 
573 aa  51.2  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  23.2 
 
 
452 aa  51.2  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>