48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1097 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1097  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 409 aa  809    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0987806  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1193  TPR domain-containing protein  64.46 
 
 		 408 aa  493  9.999999999999999e-139  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1350  TPR repeat-containing protein  42.2 
 
 		 418 aa  274  3e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.182598  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0766  TPR repeat-containing protein  32.7 
 
 		 421 aa  155  9e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00235749  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0755  TPR repeat-containing protein  30.27 
 
 		 421 aa  153  5.9999999999999996e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0895  TPR repeat-containing protein  31.97 
 
 		 433 aa  150  3e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000900502  hitchhiker  0.000000000000951989 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1444  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 		 420 aa  142  9e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3770  TPR domain protein  27.78 
 
 		 420 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1401  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 		 420 aa  140  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0553383  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1613  TPR domain protein  27.54 
 
 		 420 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.060004 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1646  TPR domain-containing protein  27.54 
 
 		 420 aa  140  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.804305  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1401  TPR repeat-containing protein  27.29 
 
 		 420 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1682  TPR domain protein  27.54 
 
 		 420 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.327391  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1541  TPR domain-containing protein  27.29 
 
 		 420 aa  139  7e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1429  TPR domain-containing protein  27.29 
 
 		 420 aa  139  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1575  TPR domain protein  27.54 
 
 		 420 aa  139  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1243  TPR repeat-containing protein  26.27 
 
 		 420 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.852694  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0485  TPR repeat-containing protein  28.08 
 
 		 418 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2134  TPR repeat-containing protein  27.88 
 
 		 420 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1011  TPR repeat-containing protein  26.9 
 
 		 413 aa  104  3e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.534766  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1033  hypothetical protein  25.55 
 
 		 414 aa  102  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1551  TPR repeat-containing protein  25.77 
 
 		 414 aa  99.8  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.261583  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1522  TPR repeat-containing protein  25.77 
 
 		 414 aa  99.8  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.72 
 
 		 2240 aa  62  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  23.13 
 
 		 1676 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  24.12 
 
 		 577 aa  54.7  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0774  tetratricopeptide TPR_2  24.35 
 
 		 519 aa  51.6  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.169881  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  31.34 
 
 		 745 aa  51.2  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  23.31 
 
 		 577 aa  49.7  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.27 
 
 		 466 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2859  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 607 aa  47.8  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504005  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2717  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 607 aa  47.8  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0254637  normal  0.13639 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 		 402 aa  47.4  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2810  TPR repeat-containing protein  28.43 
 
 		 607 aa  46.6  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2073  TPR domain-containing protein  25 
 
 		 417 aa  46.6  0.0009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0409184  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2185  tetratricopeptide TPR_2  28.43 
 
 		 607 aa  46.6  0.0009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2799  TPR repeat-containing protein  28.43 
 
 		 607 aa  46.6  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414914  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2852  tetratricopeptide TPR_2  29.08 
 
 		 269 aa  46.2  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0516  TPR repeat-containing protein  39.74 
 
 		 607 aa  45.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  23.1 
 
 		 573 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.54 
 
 		 810 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  25.56 
 
 		 543 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  26.03 
 
 		 1297 aa  43.5  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0478  TPR domain-containing protein  40 
 
 		 606 aa  43.5  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1878  hypothetical protein  30.89 
 
 		 158 aa  43.5  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000380113  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2167  tetratricopeptide TPR_2  26.61 
 
 		 1014 aa  43.5  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.796808 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4375  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.63 
 
 		 540 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.352902 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1308  Flp pilus assembly protein TadD  22.76 
 
 		 272 aa  43.1  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.59735e-21  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>