102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1033 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1033  hypothetical protein  100 
 
 		 414 aa  828    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1522  TPR repeat-containing protein  87.65 
 
 		 414 aa  745    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1551  TPR repeat-containing protein  87.65 
 
 		 414 aa  745    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.261583  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0755  TPR repeat-containing protein  30.27 
 
 		 421 aa  198  2.0000000000000003e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0485  TPR repeat-containing protein  30.71 
 
 		 418 aa  176  8e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0766  TPR repeat-containing protein  29.24 
 
 		 421 aa  166  5.9999999999999996e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00235749  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2134  TPR repeat-containing protein  29.48 
 
 		 420 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3770  TPR domain protein  29.53 
 
 		 420 aa  156  8e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1575  TPR domain protein  29.53 
 
 		 420 aa  155  9e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1401  TPR repeat-containing protein  29.02 
 
 		 420 aa  153  5e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1444  TPR repeat-containing protein  28.76 
 
 		 420 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1613  TPR domain protein  28.76 
 
 		 420 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.060004 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1646  TPR domain-containing protein  28.76 
 
 		 420 aa  151  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.804305  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1401  TPR repeat-containing protein  28.76 
 
 		 420 aa  151  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0553383  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1429  TPR domain-containing protein  28.76 
 
 		 420 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1541  TPR domain-containing protein  28.76 
 
 		 420 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1682  TPR domain protein  28.5 
 
 		 420 aa  150  5e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.327391  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1243  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 		 420 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.852694  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1350  TPR repeat-containing protein  29.95 
 
 		 418 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.182598  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0895  TPR repeat-containing protein  27.11 
 
 		 433 aa  125  1e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000900502  hitchhiker  0.000000000000951989 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1097  TPR repeat-containing protein  25.55 
 
 		 409 aa  95.1  2e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0987806  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1011  TPR repeat-containing protein  22.08 
 
 		 413 aa  93.2  8e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.534766  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1193  TPR domain-containing protein  25.99 
 
 		 408 aa  84  0.000000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  21.29 
 
 		 725 aa  60.1  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  22.07 
 
 		 1694 aa  58.9  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.99 
 
 		 572 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.7 
 
 		 566 aa  55.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.41 
 
 		 572 aa  54.7  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0484  TPR repeat-containing protein  20.89 
 
 		 435 aa  53.9  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  26.13 
 
 		 1252 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  20.52 
 
 		 620 aa  53.5  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  26.13 
 
 		 1252 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  23.88 
 
 		 573 aa  53.5  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  20.27 
 
 		 620 aa  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.88 
 
 		 586 aa  52  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  23.11 
 
 		 267 aa  51.6  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  22.16 
 
 		 3172 aa  51.6  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0539  TPR repeat-containing protein  21.32 
 
 		 389 aa  51.6  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0475117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  21.28 
 
 		 878 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.2 
 
 		 624 aa  51.6  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  23.97 
 
 		 632 aa  50.8  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  22.57 
 
 		 1069 aa  50.4  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 402 aa  50.1  0.00008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2981  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.75 
 
 		 383 aa  49.7  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000586322  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  20.63 
 
 		 436 aa  49.3  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  20.75 
 
 		 1486 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  24.12 
 
 		 733 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  24.57 
 
 		 393 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  22.62 
 
 		 3301 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  23.76 
 
 		 884 aa  48.5  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  19.59 
 
 		 562 aa  48.5  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1633  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.37 
 
 		 358 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000383939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  21.84 
 
 		 810 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 356 aa  48.9  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  20.7 
 
 		 955 aa  48.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  24.44 
 
 		 393 aa  47.8  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1463  TPR repeat-containing protein  23.23 
 
 		 329 aa  47.4  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000951693  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  21.96 
 
 		 568 aa  47.4  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3268  TPR repeat-containing protein  27.68 
 
 		 441 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2853  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.68 
 
 		 441 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0260503 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  22.92 
 
 		 1979 aa  47  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  22.31 
 
 		 750 aa  47  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0446  TPR repeat-containing protein  24.39 
 
 		 377 aa  46.6  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.021695 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  21.45 
 
 		 366 aa  46.6  0.0008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  23.74 
 
 		 3145 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  22.45 
 
 		 968 aa  45.8  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0693  TPR repeat-containing protein  23.68 
 
 		 395 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0712051  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  23.1 
 
 		 4079 aa  46.2  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0523  TPR repeat-containing protein  24.09 
 
 		 631 aa  46.2  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0179552  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0002  tetratricopeptide TPR_2  29.13 
 
 		 128 aa  45.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00992655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  21.3 
 
 		 573 aa  45.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1078  TPR repeat-containing protein  23.01 
 
 		 423 aa  45.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.327406  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7095  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.19 
 
 		 354 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.524118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  19.68 
 
 		 465 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  21.77 
 
 		 1297 aa  45.8  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2004  TPR repeat-containing protein  35.37 
 
 		 236 aa  45.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.149426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  23.73 
 
 		 1764 aa  44.7  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0275  TPR repeat-containing protein  20.8 
 
 		 587 aa  44.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00051  Flp pilus assembly protein TadD  21.43 
 
 		 297 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000470033 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  24.02 
 
 		 882 aa  44.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11910  TPR repeat-containing protein  25.1 
 
 		 394 aa  45.1  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000944223  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  21.69 
 
 		 934 aa  44.3  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  20.45 
 
 		 767 aa  44.3  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2764  TPR repeat-containing protein  23.21 
 
 		 683 aa  44.3  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0762539  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0774  tetratricopeptide TPR_2  20.2 
 
 		 519 aa  43.9  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.169881  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  22.36 
 
 		 789 aa  44.3  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.97 
 
 		 988 aa  43.9  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0447  TPR domain-containing protein  21.52 
 
 		 992 aa  43.9  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000620141  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  22.39 
 
 		 1138 aa  43.9  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  21.55 
 
 		 927 aa  43.5  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1502  tetratricopeptide repeat protein  22.57 
 
 		 389 aa  43.9  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000018122  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.22 
 
 		 818 aa  43.5  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1345  TPR repeat-containing protein  23.24 
 
 		 332 aa  43.1  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0531  TPR repeat-containing protein  22.36 
 
 		 287 aa  43.1  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.259397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  23.23 
 
 		 561 aa  43.1  0.009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.04 
 
 		 639 aa  43.1  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3518  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.16 
 
 		 320 aa  43.1  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  27.21 
 
 		 1038 aa  42.7  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  22.78 
 
 		 860 aa  43.1  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23400  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 		 183 aa  43.1  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000457247  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>