48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1193 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1193  TPR domain-containing protein  100 
 
 
408 aa  813    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1097  TPR repeat-containing protein  64.46 
 
 
409 aa  511  1e-144  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0987806  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1350  TPR repeat-containing protein  39.17 
 
 
418 aa  250  3e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.182598  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1429  TPR domain-containing protein  27.99 
 
 
420 aa  152  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1444  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 
420 aa  151  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1541  TPR domain-containing protein  27.99 
 
 
420 aa  152  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1613  TPR domain protein  27.99 
 
 
420 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.060004 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1646  TPR domain-containing protein  27.99 
 
 
420 aa  150  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.804305  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1401  TPR repeat-containing protein  27.99 
 
 
420 aa  150  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0553383  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1682  TPR domain protein  27.99 
 
 
420 aa  150  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.327391  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1401  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 
420 aa  150  5e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0755  TPR repeat-containing protein  28.09 
 
 
421 aa  149  7e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3770  TPR domain protein  27.75 
 
 
420 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1575  TPR domain protein  27.99 
 
 
420 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0895  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 
433 aa  142  9.999999999999999e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000900502  hitchhiker  0.000000000000951989 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1243  TPR repeat-containing protein  26.38 
 
 
420 aa  141  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.852694  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2134  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 
420 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0766  TPR repeat-containing protein  30.22 
 
 
421 aa  135  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00235749  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0485  TPR repeat-containing protein  28.61 
 
 
418 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1551  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 
414 aa  103  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.261583  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1522  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 
414 aa  103  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1033  hypothetical protein  26.73 
 
 
414 aa  102  9e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1011  TPR repeat-containing protein  26.57 
 
 
413 aa  94.7  3e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.534766  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  21.33 
 
 
577 aa  50.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.38 
 
 
466 aa  49.7  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0774  tetratricopeptide TPR_2  22.87 
 
 
519 aa  49.7  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.169881  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.39 
 
 
2240 aa  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  23.75 
 
 
887 aa  47.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  23.86 
 
 
1676 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.91 
 
 
566 aa  47.4  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  20.8 
 
 
577 aa  46.6  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  25.76 
 
 
979 aa  46.6  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  23.18 
 
 
681 aa  46.6  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  23.02 
 
 
676 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.13 
 
 
632 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  21.04 
 
 
561 aa  45.4  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00726  TPR domain protein  27.21 
 
 
385 aa  45.1  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  21.04 
 
 
561 aa  45.4  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 
878 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  23.57 
 
 
661 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.28 
 
 
553 aa  44.3  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  23.74 
 
 
3145 aa  44.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  20.78 
 
 
603 aa  43.9  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.84 
 
 
364 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0488  TPR repeat-containing protein  27.7 
 
 
485 aa  43.1  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.160649 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  26.67 
 
 
594 aa  43.1  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  24.6 
 
 
486 aa  43.1  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0122  TPR repeat-containing protein  28.78 
 
 
660 aa  43.1  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.142603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>