161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0485 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0485  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 418 aa  834    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2134  TPR repeat-containing protein  75.12 
 
 		 420 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3770  TPR domain protein  45.69 
 
 		 420 aa  355  1e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1444  TPR repeat-containing protein  45.22 
 
 		 420 aa  351  1e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1575  TPR domain protein  45.45 
 
 		 420 aa  351  1e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1646  TPR domain-containing protein  45.22 
 
 		 420 aa  350  2e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.804305  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1401  TPR repeat-containing protein  45.22 
 
 		 420 aa  350  2e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0553383  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1613  TPR domain protein  44.98 
 
 		 420 aa  350  3e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.060004 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1429  TPR domain-containing protein  44.98 
 
 		 420 aa  349  5e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1541  TPR domain-containing protein  44.98 
 
 		 420 aa  349  5e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1401  TPR repeat-containing protein  44.74 
 
 		 420 aa  349  6e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1682  TPR domain protein  44.98 
 
 		 420 aa  348  8e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.327391  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1243  TPR repeat-containing protein  44.98 
 
 		 420 aa  347  2e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.852694  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0755  TPR repeat-containing protein  32.61 
 
 		 421 aa  209  7e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1033  hypothetical protein  30.71 
 
 		 414 aa  188  1e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0766  TPR repeat-containing protein  32.78 
 
 		 421 aa  186  6e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00235749  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1522  TPR repeat-containing protein  31.2 
 
 		 414 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1551  TPR repeat-containing protein  31.2 
 
 		 414 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.261583  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0895  TPR repeat-containing protein  30.02 
 
 		 433 aa  176  8e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000900502  hitchhiker  0.000000000000951989 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1193  TPR domain-containing protein  28.61 
 
 		 408 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1350  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 418 aa  121  3e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.182598  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1011  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 413 aa  113  6e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.534766  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1097  TPR repeat-containing protein  26.96 
 
 		 409 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0987806  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.86 
 
 		 624 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  23.31 
 
 		 632 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  22.88 
 
 		 577 aa  63.9  0.000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1745  TPR repeat-containing protein  24.33 
 
 		 402 aa  62.8  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.31 
 
 		 2240 aa  62.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  22.51 
 
 		 577 aa  62  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  28.98 
 
 		 1069 aa  62  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  24 
 
 		 3145 aa  60.8  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  21.4 
 
 		 1737 aa  60.1  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  23.67 
 
 		 968 aa  59.7  0.00000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  26.75 
 
 		 643 aa  59.3  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1812  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.27 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.312909  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  24.69 
 
 		 615 aa  58.2  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  23.38 
 
 		 827 aa  57.8  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.04 
 
 		 645 aa  57.4  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000607684  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  24.4 
 
 		 402 aa  57.4  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.53 
 
 		 810 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  23.35 
 
 		 1154 aa  56.6  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  24.64 
 
 		 436 aa  55.8  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  23.14 
 
 		 573 aa  55.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  23.75 
 
 		 638 aa  55.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1957  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.46 
 
 		 375 aa  55.1  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.46 
 
 		 639 aa  54.7  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  22.58 
 
 		 573 aa  54.7  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1677  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 222 aa  55.1  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1711  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 222 aa  55.1  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  25.74 
 
 		 796 aa  53.5  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  22.8 
 
 		 673 aa  53.5  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2716  hypothetical protein  24.72 
 
 		 905 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0426299  hitchhiker  0.00105391 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1530  TPR repeat-containing protein  24.41 
 
 		 873 aa  52.8  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0304158  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0616  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.03 
 
 		 647 aa  52.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.1691e-34 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0781  TPR domain-containing protein  26.43 
 
 		 924 aa  51.6  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.55707  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2954  TPR repeat-containing protein  18.26 
 
 		 468 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  24.39 
 
 		 311 aa  51.6  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  24.86 
 
 		 573 aa  50.8  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25 
 
 		 818 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2073  TPR domain-containing protein  21.88 
 
 		 417 aa  50.4  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0409184  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  21.74 
 
 		 878 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2261  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.12 
 
 		 251 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000463811 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.75 
 
 		 632 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0602  hypothetical protein  25.85 
 
 		 817 aa  50.4  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1078  TPR repeat-containing protein  22.92 
 
 		 423 aa  50.1  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.327406  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.4 
 
 		 586 aa  50.1  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0524  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.8 
 
 		 574 aa  49.7  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  23.02 
 
 		 764 aa  49.7  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  22.68 
 
 		 397 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  23.76 
 
 		 448 aa  49.7  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  24.45 
 
 		 597 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.17 
 
 		 689 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  27.39 
 
 		 3035 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  21.72 
 
 		 750 aa  49.7  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  23.36 
 
 		 927 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  24.36 
 
 		 1979 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3321  TPR repeat-containing protein  31.34 
 
 		 453 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0995  tetratricopeptide TPR_2  29.05 
 
 		 614 aa  48.9  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129848  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0362  TPR repeat-containing protein  25.68 
 
 		 804 aa  48.9  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.587657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  20.69 
 
 		 808 aa  48.9  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1011  TPR repeat-containing protein  21.68 
 
 		 800 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.926102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  24.54 
 
 		 4079 aa  48.5  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  23.38 
 
 		 955 aa  48.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0599  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.54 
 
 		 263 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  18.23 
 
 		 448 aa  47.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1633  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.47 
 
 		 358 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000383939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2362  TPR repeat-containing protein  23.17 
 
 		 585 aa  47.8  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3220  TPR repeat-containing protein  19.86 
 
 		 1178 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.166794 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  22.27 
 
 		 883 aa  47.4  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1476  TPR repeat-containing protein  24.61 
 
 		 226 aa  47.4  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.818932  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0582  TPR repeat-containing protein  25.95 
 
 		 263 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2755  TPR repeat-containing protein  24.49 
 
 		 758 aa  47  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.202192  normal  0.502255 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1760  glycosyl transferase family 2  24.51 
 
 		 392 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  22.33 
 
 		 718 aa  47  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  25.17 
 
 		 1406 aa  47  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0733  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  25.28 
 
 		 256 aa  46.6  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  24.37 
 
 		 804 aa  46.6  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  28.37 
 
 		 686 aa  46.6  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.52 
 
 		 1056 aa  46.6  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0419  TPR repeat-containing protein  24.48 
 
 		 917 aa  45.8  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>