85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0895 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0895  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 433 aa  861    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000900502  hitchhiker  0.000000000000951989 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0766  TPR repeat-containing protein  37.83 
 
 		 421 aa  265  8.999999999999999e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00235749  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0755  TPR repeat-containing protein  33.49 
 
 		 421 aa  224  3e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3770  TPR domain protein  30.27 
 
 		 420 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1401  TPR repeat-containing protein  29.78 
 
 		 420 aa  172  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1575  TPR domain protein  30.27 
 
 		 420 aa  172  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1613  TPR domain protein  29.78 
 
 		 420 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.060004 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1429  TPR domain-containing protein  29.78 
 
 		 420 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1541  TPR domain-containing protein  29.78 
 
 		 420 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1682  TPR domain protein  29.78 
 
 		 420 aa  171  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.327391  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1444  TPR repeat-containing protein  30.02 
 
 		 420 aa  170  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1646  TPR domain-containing protein  29.78 
 
 		 420 aa  170  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.804305  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1401  TPR repeat-containing protein  29.78 
 
 		 420 aa  170  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0553383  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0485  TPR repeat-containing protein  30.02 
 
 		 418 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1243  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 420 aa  159  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.852694  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1350  TPR repeat-containing protein  31.74 
 
 		 418 aa  147  4.0000000000000006e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.182598  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1097  TPR repeat-containing protein  31.97 
 
 		 409 aa  145  1e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0987806  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1551  TPR repeat-containing protein  29.18 
 
 		 414 aa  135  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.261583  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1522  TPR repeat-containing protein  29.18 
 
 		 414 aa  135  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2134  TPR repeat-containing protein  27.6 
 
 		 420 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1193  TPR domain-containing protein  29.59 
 
 		 408 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1033  hypothetical protein  27.11 
 
 		 414 aa  125  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1011  TPR repeat-containing protein  26.39 
 
 		 413 aa  123  6e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.534766  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  23.86 
 
 		 725 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  23.48 
 
 		 1061 aa  61.6  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1139  TPR repeat-containing protein  33.96 
 
 		 357 aa  59.7  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000045072  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0991  TPR repeat-containing protein  33.96 
 
 		 357 aa  58.9  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161827  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3236  tetratricopeptide TPR_4  24.37 
 
 		 514 aa  57.4  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.789976  normal  0.265917 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.31 
 
 		 689 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2716  hypothetical protein  25.54 
 
 		 905 aa  54.7  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0426299  hitchhiker  0.00105391 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  24.53 
 
 		 1676 aa  53.1  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  24.91 
 
 		 448 aa  52.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  25.14 
 
 		 1406 aa  51.6  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2077  tetratricopeptide TPR_2  25.53 
 
 		 314 aa  50.4  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.18 
 
 		 466 aa  50.1  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.06 
 
 		 2240 aa  50.1  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  25.73 
 
 		 936 aa  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  27.73 
 
 		 837 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  28.26 
 
 		 265 aa  49.7  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  23.48 
 
 		 979 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  33.57 
 
 		 677 aa  48.9  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  28.9 
 
 		 4079 aa  48.9  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  23.36 
 
 		 2262 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  28.41 
 
 		 315 aa  48.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1796  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 		 352 aa  47.8  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  21.61 
 
 		 265 aa  47.4  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  22.03 
 
 		 2262 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.71 
 
 		 586 aa  47.4  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  28.83 
 
 		 1979 aa  47.4  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  26.36 
 
 		 594 aa  46.6  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2073  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.07 
 
 		 214 aa  46.6  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0814777  normal  0.412873 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.64 
 
 		 293 aa  46.6  0.0009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0156  TPR repeat-containing protein  25.57 
 
 		 955 aa  45.8  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.61 
 
 		 265 aa  45.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1201  tetratricopeptide TPR_2  31.97 
 
 		 918 aa  46.2  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.173975  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1530  TPR repeat-containing protein  25.12 
 
 		 873 aa  46.6  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0304158  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  23.34 
 
 		 566 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  22.99 
 
 		 288 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2421  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.43 
 
 		 199 aa  46.2  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  24.81 
 
 		 267 aa  45.8  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0828  TPR repeat-containing protein  25.13 
 
 		 886 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  25.36 
 
 		 1764 aa  45.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03118  FOG: TPR repeat 2396 protein  30.61 
 
 		 308 aa  45.1  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.63 
 
 		 645 aa  45.8  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000607684  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.82 
 
 		 566 aa  44.7  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  26.72 
 
 		 750 aa  44.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  24.12 
 
 		 568 aa  45.1  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1008  TPR repeat-containing protein  27.19 
 
 		 359 aa  44.3  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000389173  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1184  TPR domain-containing protein  24 
 
 		 222 aa  44.3  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  22.34 
 
 		 1454 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.47 
 
 		 624 aa  43.9  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0447  TPR domain-containing protein  23.03 
 
 		 992 aa  43.9  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000620141  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  22.34 
 
 		 1451 aa  43.9  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1730  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  25.12 
 
 		 974 aa  43.9  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000283057  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  22.73 
 
 		 714 aa  43.9  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0840  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.46 
 
 		 199 aa  43.5  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2947  tetratricopeptide TPR_2  23.68 
 
 		 321 aa  43.5  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.708581 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1078  TPR repeat-containing protein  19.18 
 
 		 423 aa  43.5  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.327406  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11910  TPR repeat-containing protein  25.77 
 
 		 394 aa  43.5  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000944223  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2739  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  28.5 
 
 		 248 aa  43.1  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2065  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.23 
 
 		 465 aa  43.5  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.145613  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.64 
 
 		 1034 aa  43.5  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  21.39 
 
 		 573 aa  43.5  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0531  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 287 aa  43.1  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.259397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47766  predicted protein  24.3 
 
 		 613 aa  43.1  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>