More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2755 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2755  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 758 aa  1567    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.202192  normal  0.502255 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  25.47 
 
 		 1276 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  23.43 
 
 		 1694 aa  93.2  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  23.82 
 
 		 878 aa  90.1  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.2 
 
 		 988 aa  88.2  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  24.02 
 
 		 927 aa  87.4  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  23.61 
 
 		 573 aa  86.7  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.79 
 
 		 1056 aa  82  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  26.28 
 
 		 3560 aa  81.3  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.72 
 
 		 784 aa  81.3  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.82 
 
 		 818 aa  80.5  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  22.64 
 
 		 397 aa  77.4  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.34 
 
 		 810 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  25.47 
 
 		 3035 aa  76.3  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.64 
 
 		 1056 aa  75.9  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.98 
 
 		 1022 aa  75.9  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  24.49 
 
 		 649 aa  75.1  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  24.81 
 
 		 795 aa  74.7  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  20.55 
 
 		 1979 aa  73.6  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  23.34 
 
 		 465 aa  73.9  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  23.62 
 
 		 409 aa  73.2  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  22.83 
 
 		 543 aa  73.2  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  25.55 
 
 		 955 aa  72.8  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0225  TPR repeat-containing protein  25.48 
 
 		 414 aa  71.2  0.00000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  25.68 
 
 		 4079 aa  71.2  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  22 
 
 		 562 aa  70.9  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.55 
 
 		 2240 aa  70.9  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  23.6 
 
 		 804 aa  70.9  0.00000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.54 
 
 		 542 aa  70.1  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3062  hypothetical protein  24.39 
 
 		 391 aa  70.1  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.16 
 
 		 707 aa  69.7  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  20.83 
 
 		 740 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  24.16 
 
 		 745 aa  68.9  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  19.96 
 
 		 1737 aa  68.2  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  24.55 
 
 		 4489 aa  66.6  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  22.97 
 
 		 462 aa  66.6  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  23.24 
 
 		 602 aa  66.6  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  25.82 
 
 		 395 aa  65.9  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  27.46 
 
 		 409 aa  65.9  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  19.87 
 
 		 3145 aa  65.5  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0378  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.3 
 
 		 545 aa  65.1  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.579733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  20.54 
 
 		 466 aa  65.1  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  22.83 
 
 		 824 aa  65.1  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  23.64 
 
 		 1013 aa  64.3  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  23.26 
 
 		 392 aa  64.3  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2735  TPR repeat-containing protein  27.71 
 
 		 384 aa  63.9  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  27.98 
 
 		 409 aa  63.9  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  21.91 
 
 		 564 aa  62.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  24.78 
 
 		 244 aa  62  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  21.74 
 
 		 576 aa  62  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  23.79 
 
 		 450 aa  62  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.12 
 
 		 632 aa  61.6  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  23.94 
 
 		 356 aa  61.2  0.00000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  20.95 
 
 		 733 aa  61.6  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  23.05 
 
 		 352 aa  60.8  0.00000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  25.89 
 
 		 750 aa  60.1  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  23.56 
 
 		 1827 aa  60.5  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  23.73 
 
 		 617 aa  60.5  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  22.02 
 
 		 833 aa  60.1  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.71 
 
 		 629 aa  59.7  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  23.65 
 
 		 649 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  23.65 
 
 		 649 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  22.14 
 
 		 344 aa  58.5  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  25.43 
 
 		 875 aa  58.2  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12541  Tfp pilus assembly protein PilF  21.98 
 
 		 442 aa  58.2  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.34619  hitchhiker  0.00140851 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  23.46 
 
 		 2262 aa  58.2  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  23.56 
 
 		 732 aa  57.8  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  22.57 
 
 		 594 aa  58.2  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  21.43 
 
 		 1056 aa  57.8  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  22.31 
 
 		 1067 aa  57.8  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.2 
 
 		 466 aa  57.8  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1837  TPR repeat-containing protein  25.5 
 
 		 344 aa  57.8  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  21.75 
 
 		 577 aa  57.4  0.0000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  20.86 
 
 		 1069 aa  57.4  0.0000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.5 
 
 		 344 aa  57.8  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  22.73 
 
 		 739 aa  57.4  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  23.26 
 
 		 376 aa  57  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  21.75 
 
 		 577 aa  57  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  26.63 
 
 		 267 aa  57  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  22.69 
 
 		 739 aa  57.4  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  23.65 
 
 		 646 aa  57.4  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  21.68 
 
 		 1094 aa  57  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  21.1 
 
 		 366 aa  56.6  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  26.63 
 
 		 603 aa  57  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  24.07 
 
 		 561 aa  57.4  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2200  TPR domain-containing protein  22.05 
 
 		 695 aa  56.2  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  23.95 
 
 		 1764 aa  56.2  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  21.1 
 
 		 1138 aa  56.6  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  24.74 
 
 		 578 aa  56.2  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  25.75 
 
 		 375 aa  56.2  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  23.05 
 
 		 714 aa  56.2  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.71 
 
 		 293 aa  56.2  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  23.77 
 
 		 561 aa  55.8  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  20.7 
 
 		 714 aa  55.8  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10800  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 		 245 aa  55.5  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 		 279 aa  55.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  21.51 
 
 		 589 aa  55.8  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  22.33 
 
 		 909 aa  55.1  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.96 
 
 		 1034 aa  55.1  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  21.45 
 
 		 935 aa  55.1  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>