102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1774 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2673  AsmA family protein  57.81 
 
 		 762 aa  768    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.583753  normal  0.123003 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4258  AsmA family protein  53.46 
 
 		 791 aa  722    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521449  normal  0.0888136 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1774  AsmA family protein  100 
 
 		 761 aa  1508    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64510  hypothetical protein  41.07 
 
 		 689 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5601  hypothetical protein  40.72 
 
 		 689 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3828  AsmA family protein  39.4 
 
 		 686 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975888 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3882  AsmA family protein  39.23 
 
 		 686 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3926  AsmA family protein  39.23 
 
 		 686 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3804  AsmA family protein  39.23 
 
 		 686 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3985  AsmA family protein  39.23 
 
 		 686 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.189734 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03372  predicted outer membrane biogenesis protein  38.6 
 
 		 691 aa  414  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0189  AsmA family protein  38.6 
 
 		 691 aa  414  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3727  AsmA family protein  39.27 
 
 		 686 aa  414  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0193  AsmA family protein  38.6 
 
 		 691 aa  414  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3929  AsmA family protein  39.27 
 
 		 686 aa  414  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0721  AsmA family protein  38 
 
 		 765 aa  413  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.641564 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3817  AsmA family protein  38.9 
 
 		 686 aa  415  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4887  AsmA family protein  39.27 
 
 		 686 aa  415  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.647897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0791  AsmA family protein  37.62 
 
 		 765 aa  413  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.352435  normal  0.138985 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2640  AsmA  38.8 
 
 		 735 aa  412  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3921  AsmA family protein  38.06 
 
 		 686 aa  412  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4012  AsmA family protein  39.07 
 
 		 686 aa  412  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4914  AsmA family protein  39.07 
 
 		 688 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000550525 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4261  AsmA family protein  41.48 
 
 		 669 aa  405  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.545183  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4857  AsmA family protein  39.07 
 
 		 688 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000523424 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4735  AsmA family protein  39.24 
 
 		 688 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000197359 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4649  AsmA family protein  38.38 
 
 		 688 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0580327 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4073  hypothetical protein  34.24 
 
 		 729 aa  399  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0571071 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4449  AsmA  37.14 
 
 		 688 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4907  hypothetical protein  37.31 
 
 		 688 aa  392  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0817  AsmA  37.13 
 
 		 791 aa  391  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118812  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02380  AsmA family protein  40.07 
 
 		 677 aa  392  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0566  AsmA  37.31 
 
 		 691 aa  385  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723827 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0784  AsmA family protein  38.65 
 
 		 680 aa  385  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0773  hypothetical protein  37.3 
 
 		 740 aa  373  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0128597 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4747  AsmA family protein  37.2 
 
 		 678 aa  375  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2321  putative transmembrane protein, AsmA-like  40.34 
 
 		 839 aa  356  7.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.704699 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1865  AsmA family protein  39.87 
 
 		 832 aa  355  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0704419  normal  0.0719659 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0988  AsmA family protein  37.08 
 
 		 810 aa  347  5e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1703  AsmA family protein  38.38 
 
 		 782 aa  346  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0104  AsmA family protein  40.59 
 
 		 739 aa  344  2.9999999999999997e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4058  AsmA family protein  41.25 
 
 		 745 aa  344  5e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1499  AsmA family protein  39.41 
 
 		 759 aa  339  9.999999999999999e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473524 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6307  AsmA  38.31 
 
 		 765 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726183  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1711  AsmA family protein  38.97 
 
 		 765 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1772  AsmA family protein  38.31 
 
 		 765 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192484  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1797  AsmA family protein  38.31 
 
 		 765 aa  338  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.374116 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1683  AsmA family protein  38.76 
 
 		 765 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2268  AsmA family protein  38.74 
 
 		 818 aa  337  5.999999999999999e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.1369  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2188  AsmA family protein  38.05 
 
 		 824 aa  337  7e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1309  AsmA family protein  38.05 
 
 		 830 aa  336  9e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2319  AsmA family protein  38.05 
 
 		 830 aa  336  9e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1796  AsmA family protein  38.05 
 
 		 830 aa  336  9e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.147838  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0099  AsmA family protein  38.05 
 
 		 830 aa  336  9e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.483374  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2151  AsmA family protein  38.05 
 
 		 830 aa  336  9e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1067  AsmA family protein  38.05 
 
 		 830 aa  336  9e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.103538  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5070  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis, AsmA  38.74 
 
 		 764 aa  334  4e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  34.45 
 
 		 632 aa  320  5e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0079  AsmA  33.74 
 
 		 669 aa  307  4.0000000000000004e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.178612  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1181  AsmA  29.45 
 
 		 667 aa  274  5.000000000000001e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.256758  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0924  AsmA family protein  32.43 
 
 		 670 aa  270  8.999999999999999e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0883  AsmA  31.91 
 
 		 664 aa  261  4e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.444148 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3055  AsmA family protein  31.18 
 
 		 657 aa  255  2.0000000000000002e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3293  AsmA family protein  30.68 
 
 		 656 aa  244  6e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187573  normal  0.760873 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0666  hypothetical protein  29.64 
 
 		 697 aa  241  4e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4106  AsmA family protein  29.19 
 
 		 669 aa  229  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850545  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4644  AsmA family protein  29.46 
 
 		 649 aa  216  9e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0752121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2433  AsmA family protein  26.22 
 
 		 710 aa  170  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.2026  normal  0.914727 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2665  AsmA family protein  26.73 
 
 		 674 aa  152  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100749 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1200  AsmA  24.96 
 
 		 700 aa  140  6e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0110  AsmA family protein  21.62 
 
 		 704 aa  96.3  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2657  AsmA  23.84 
 
 		 737 aa  72.8  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.871932  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2682  AsmA family protein  22.29 
 
 		 895 aa  73.2  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.397979  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2769  AsmA family protein  25.75 
 
 		 587 aa  70.1  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.961536  normal  0.388317 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0489  hypothetical protein  20.32 
 
 		 665 aa  68.6  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000190696  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01675  AsmA family membrane protein  30.15 
 
 		 342 aa  64.7  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.3424  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  22.32 
 
 		 709 aa  60.8  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3362  AsmA family protein  25.19 
 
 		 1061 aa  54.3  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.596637 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1887  AsmA protein  32.97 
 
 		 604 aa  53.9  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2863  AsmA family protein  21.46 
 
 		 711 aa  52.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  23.49 
 
 		 677 aa  51.6  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0159  AsmA family protein  22.32 
 
 		 794 aa  50.4  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2162  AsmA family protein  24.01 
 
 		 701 aa  50.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.152966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1009  hypothetical protein  36.27 
 
 		 656 aa  49.7  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3033  hypothetical protein  23.5 
 
 		 649 aa  49.3  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0689945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0711  AsmA family protein  24.43 
 
 		 609 aa  49.7  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0491  AsmA family protein  30.19 
 
 		 818 aa  49.7  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487855 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2209  AsmA family protein  28.89 
 
 		 606 aa  49.3  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2614  AsmA family protein  29.67 
 
 		 606 aa  49.3  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.745873  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0560  putative AsmA-like protein  26.92 
 
 		 705 aa  48.9  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.748944 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5855  AsmA family protein  25.45 
 
 		 580 aa  48.9  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.734767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  38.18 
 
 		 812 aa  47  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1004  AsmA  25.31 
 
 		 649 aa  46.2  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.478001  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1136  AsmA family protein  25.22 
 
 		 295 aa  46.2  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0437231 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3300  AsmA family protein  20.06 
 
 		 642 aa  46.6  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0102048 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3609  AsmA  21.56 
 
 		 640 aa  45.8  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2566  asmA protein  34.09 
 
 		 606 aa  45.1  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2024  AsmA  29.79 
 
 		 614 aa  45.1  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000524921  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2056  AsmA family protein  33.7 
 
 		 607 aa  45.1  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399142  hitchhiker  0.00088344 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2331  AsmA family protein  33.7 
 
 		 607 aa  44.7  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00854787  hitchhiker  0.00634925 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>