157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1851 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  100 
 
 
709 aa  1372    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  34.95 
 
 
677 aa  322  1.9999999999999998e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1887  AsmA protein  28.33 
 
 
604 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2694  AsmA family protein  30.16 
 
 
699 aa  208  3e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.264  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2483  AsmA family protein  28.36 
 
 
742 aa  208  3e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2209  AsmA family protein  25.44 
 
 
606 aa  194  6e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  26.87 
 
 
712 aa  182  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1985  AsmA family protein  24.84 
 
 
611 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0885974  normal  0.0733894 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2006  hypothetical protein  28.28 
 
 
660 aa  177  4e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0368531  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0716  AsmA family protein  28.39 
 
 
660 aa  177  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.194292 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2116  AsmA family protein  26.67 
 
 
614 aa  172  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.738267  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3103  AsmA family protein  27.76 
 
 
675 aa  171  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.596916  normal  0.117573 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2331  AsmA family protein  24.07 
 
 
607 aa  171  6e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00854787  hitchhiker  0.00634925 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2056  AsmA family protein  24.57 
 
 
607 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399142  hitchhiker  0.00088344 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2024  AsmA  25.2 
 
 
614 aa  168  4e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000524921  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0651  AsmA  26.97 
 
 
646 aa  167  5.9999999999999996e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2614  AsmA family protein  31.16 
 
 
606 aa  167  8e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.745873  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1993  AsmA family protein  24.42 
 
 
607 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2566  asmA protein  25.19 
 
 
606 aa  162  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2008  AsmA family protein  24.42 
 
 
607 aa  160  7e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0960641  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2164  AsmA family protein  24.88 
 
 
606 aa  159  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0565997  normal  0.411123 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2241  AsmA family protein  24.47 
 
 
606 aa  158  3e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104222  normal  0.355768 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1140  AsmA family protein  25.9 
 
 
732 aa  157  9e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.999799  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2372  AsmA protein  24.92 
 
 
606 aa  156  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00905663  normal  0.0519979 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3033  hypothetical protein  27.99 
 
 
649 aa  155  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0689945  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1457  AsmA  27.29 
 
 
654 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1773  AsmA family protein  24.54 
 
 
608 aa  156  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000090206  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3609  AsmA  25.79 
 
 
640 aa  155  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1332  AsmA family protein  25.78 
 
 
696 aa  153  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002984  AsmA protein  23.88 
 
 
695 aa  151  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4636  AsmA family protein  26.87 
 
 
648 aa  150  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86579  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0560  putative AsmA-like protein  27.89 
 
 
705 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.748944 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0892  AsmA  27.48 
 
 
655 aa  148  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1009  hypothetical protein  24.37 
 
 
656 aa  148  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0557  asmA protein  22.7 
 
 
703 aa  147  9e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00432882  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1019  outer membrane protein assembly protein AsmA  24.4 
 
 
640 aa  145  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1433  AsmA  26.5 
 
 
655 aa  144  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2526  AsmA  29.56 
 
 
893 aa  140  8.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1016  AsmA  26.4 
 
 
656 aa  139  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.620407  normal  0.697565 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02923  hypothetical protein  23.4 
 
 
695 aa  138  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1004  AsmA  32.89 
 
 
649 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.478001  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5162  AsmA family protein  33.59 
 
 
602 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.63495  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1245  AsmA  23.93 
 
 
643 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.350704  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6831  putative asmA protein, assembly of outer membrane proteins  25.32 
 
 
645 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0946528  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  32.14 
 
 
812 aa  130  6e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4921  AsmA family protein  23.78 
 
 
747 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2409  AsmA family protein  27.25 
 
 
612 aa  125  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.278474  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  25.78 
 
 
797 aa  123  9.999999999999999e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2229  putative outer membrane assembly protein  24.01 
 
 
719 aa  120  7e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87964  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0287  AsmA family protein  23.8 
 
 
748 aa  120  9e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000233767 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0307  AsmA family protein  23.65 
 
 
748 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0304017 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0590  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis  33.57 
 
 
826 aa  115  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0312  AsmA family protein  23.87 
 
 
748 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67975  hypothetical protein  24.73 
 
 
750 aa  114  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.302933  normal  0.0556453 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5341  hypothetical protein  23.13 
 
 
741 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3951  AsmA  24.84 
 
 
649 aa  110  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552842  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4258  AsmA family protein  23.47 
 
 
741 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000475178 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5883  hypothetical protein  24.17 
 
 
750 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4900  AsmA  22.76 
 
 
741 aa  109  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3762  AsmA family protein  23.21 
 
 
654 aa  106  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2863  AsmA family protein  22.85 
 
 
711 aa  106  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0754  AsmA family protein  23.13 
 
 
745 aa  104  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5009  AsmA family protein  28.39 
 
 
1013 aa  104  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0536968 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0321  AsmA  22.93 
 
 
740 aa  102  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.188121  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3365  AsmA family protein  23.47 
 
 
655 aa  98.2  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.590521 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0110  AsmA family protein  24.19 
 
 
704 aa  96.7  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0919  hypothetical protein  28.9 
 
 
611 aa  94.7  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  26.62 
 
 
1077 aa  92  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2673  AsmA family protein  24.82 
 
 
762 aa  90.5  9e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.583753  normal  0.123003 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3175  AsmA family protein  23.54 
 
 
741 aa  88.6  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0379  AsmA family protein  25.56 
 
 
630 aa  86.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0432846  hitchhiker  0.00179462 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1953  AsmA family protein  29.37 
 
 
682 aa  87  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.279291  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0167  AsmA  23.7 
 
 
603 aa  85.9  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1327  hypothetical protein  26.77 
 
 
599 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158025  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0411  AsmA family protein  24.56 
 
 
630 aa  80.9  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0513288  hitchhiker  0.0000211549 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1578  putative assembly protein  21.1 
 
 
611 aa  79  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.976931  normal  0.530891 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3300  AsmA family protein  21.43 
 
 
642 aa  78.6  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0102048 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0159  AsmA family protein  25.76 
 
 
794 aa  77.8  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3055  AsmA family protein  22.75 
 
 
657 aa  77.4  0.0000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655109  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0521  AsmA  24.3 
 
 
789 aa  77.4  0.0000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1199  putative assembly protein  21.35 
 
 
599 aa  75.9  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2162  AsmA family protein  23.37 
 
 
701 aa  74.3  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.152966  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1004  AsmA family protein  26.92 
 
 
502 aa  73.9  0.000000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000644102  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1134  ASMA  26.5 
 
 
508 aa  73.6  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.038364  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3293  AsmA family protein  22.75 
 
 
656 aa  73.2  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187573  normal  0.760873 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1552  AsmA family protein  22.28 
 
 
645 aa  72.4  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3001  putative assembly protein  20.89 
 
 
617 aa  71.6  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.352254 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2678  putative assembly protein  20.8 
 
 
615 aa  71.6  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.462778  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2354  putative assembly protein  20.75 
 
 
618 aa  69.7  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.827623  normal  0.53573 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01970  predicted assembly protein  20.59 
 
 
617 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  22.36 
 
 
632 aa  68.9  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01959  hypothetical protein  20.59 
 
 
617 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2247  putative assembly protein  19.91 
 
 
618 aa  68.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2303  putative assembly protein  19.91 
 
 
618 aa  68.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2204  putative assembly protein  21.12 
 
 
617 aa  68.6  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0711  AsmA family protein  23.93 
 
 
609 aa  67.8  0.0000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1168  putative assembly protein  20.59 
 
 
617 aa  67.4  0.0000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2347  putative assembly protein  19.91 
 
 
618 aa  67.4  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2461  putative assembly protein  20.73 
 
 
618 aa  66.6  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.45795 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1593  AsmA family protein  20.44 
 
 
617 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00514431  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>