111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2640 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0773  hypothetical protein  59.04 
 
 		 740 aa  800    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0128597 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0817  AsmA  70.78 
 
 		 791 aa  1010    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118812  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0791  AsmA family protein  58.68 
 
 		 765 aa  846    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.352435  normal  0.138985 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2640  AsmA  100 
 
 		 735 aa  1476    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1703  AsmA family protein  45.39 
 
 		 782 aa  646    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0721  AsmA family protein  57.77 
 
 		 765 aa  834    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.641564 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4261  AsmA family protein  47.42 
 
 		 669 aa  620  1e-176  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.545183  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4857  AsmA family protein  46.89 
 
 		 688 aa  615  1e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000523424 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4735  AsmA family protein  47.03 
 
 		 688 aa  617  1e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000197359 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5601  hypothetical protein  47.02 
 
 		 689 aa  618  1e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64510  hypothetical protein  47.41 
 
 		 689 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4914  AsmA family protein  47.04 
 
 		 688 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000550525 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4449  AsmA  46.38 
 
 		 688 aa  610  1e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4907  hypothetical protein  46.81 
 
 		 688 aa  599  1e-170  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4649  AsmA family protein  46.33 
 
 		 688 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0580327 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0566  AsmA  45.14 
 
 		 691 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723827 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02380  AsmA family protein  45.8 
 
 		 677 aa  579  1e-164  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4747  AsmA family protein  43.23 
 
 		 678 aa  576  1.0000000000000001e-163  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0784  AsmA family protein  45.14 
 
 		 680 aa  570  1e-161  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4073  hypothetical protein  41.45 
 
 		 729 aa  542  1e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0571071 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0104  AsmA family protein  40.6 
 
 		 739 aa  534  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3828  AsmA family protein  40.35 
 
 		 686 aa  533  1e-150  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975888 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03372  predicted outer membrane biogenesis protein  40.2 
 
 		 691 aa  531  1e-149  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0189  AsmA family protein  40.2 
 
 		 691 aa  531  1e-149  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4058  AsmA family protein  40 
 
 		 745 aa  531  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3727  AsmA family protein  40.2 
 
 		 686 aa  531  1e-149  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4012  AsmA family protein  40.2 
 
 		 686 aa  531  1e-149  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0193  AsmA family protein  40.2 
 
 		 691 aa  531  1e-149  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3929  AsmA family protein  40.2 
 
 		 686 aa  531  1e-149  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4887  AsmA family protein  40.2 
 
 		 686 aa  531  1e-149  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.647897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3921  AsmA family protein  40.77 
 
 		 686 aa  528  1e-148  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3882  AsmA family protein  41 
 
 		 686 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3804  AsmA family protein  41 
 
 		 686 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3926  AsmA family protein  40.86 
 
 		 686 aa  521  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3817  AsmA family protein  40.71 
 
 		 686 aa  520  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3985  AsmA family protein  40.86 
 
 		 686 aa  521  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.189734 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1865  AsmA family protein  51.31 
 
 		 832 aa  492  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0704419  normal  0.0719659 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2321  putative transmembrane protein, AsmA-like  50.51 
 
 		 839 aa  486  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.704699 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1309  AsmA family protein  51.08 
 
 		 830 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2319  AsmA family protein  51.08 
 
 		 830 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1796  AsmA family protein  51.08 
 
 		 830 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.147838  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0099  AsmA family protein  51.08 
 
 		 830 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.483374  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2151  AsmA family protein  51.08 
 
 		 830 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2188  AsmA family protein  50.87 
 
 		 824 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1067  AsmA family protein  51.08 
 
 		 830 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.103538  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2268  AsmA family protein  50.87 
 
 		 818 aa  464  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.1369  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1711  AsmA family protein  49.25 
 
 		 765 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2673  AsmA family protein  41.27 
 
 		 762 aa  420  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.583753  normal  0.123003 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  35.56 
 
 		 632 aa  403  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0079  AsmA  33.19 
 
 		 669 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.178612  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1774  AsmA family protein  39.73 
 
 		 761 aa  377  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1181  AsmA  32.16 
 
 		 667 aa  368  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.256758  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0924  AsmA family protein  32.05 
 
 		 670 aa  348  2e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4258  AsmA family protein  37.03 
 
 		 791 aa  348  2e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521449  normal  0.0888136 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0883  AsmA  32.06 
 
 		 664 aa  340  5e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.444148 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3055  AsmA family protein  33.74 
 
 		 657 aa  331  4e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0666  hypothetical protein  32.01 
 
 		 697 aa  303  8.000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4106  AsmA family protein  29.48 
 
 		 669 aa  292  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850545  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3293  AsmA family protein  29.73 
 
 		 656 aa  275  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187573  normal  0.760873 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4644  AsmA family protein  28.11 
 
 		 649 aa  247  4e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0752121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2433  AsmA family protein  26.12 
 
 		 710 aa  208  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.2026  normal  0.914727 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2665  AsmA family protein  25.31 
 
 		 674 aa  195  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100749 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0988  AsmA family protein  52.12 
 
 		 810 aa  189  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1499  AsmA family protein  47.96 
 
 		 759 aa  187  8e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473524 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5070  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis, AsmA  49.19 
 
 		 764 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6307  AsmA  46.49 
 
 		 765 aa  177  9e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726183  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1772  AsmA family protein  46.49 
 
 		 765 aa  177  9e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192484  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1797  AsmA family protein  46.49 
 
 		 765 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.374116 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1683  AsmA family protein  43.07 
 
 		 765 aa  171  7e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1200  AsmA  24.04 
 
 		 700 aa  153  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0110  AsmA family protein  21.26 
 
 		 704 aa  112  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0489  hypothetical protein  21.44 
 
 		 665 aa  102  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000190696  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01675  AsmA family membrane protein  25.75 
 
 		 342 aa  75.5  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.3424  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2769  AsmA family protein  25.28 
 
 		 587 aa  70.9  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.961536  normal  0.388317 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  30.07 
 
 		 1077 aa  68.2  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1745  hypothetical protein  26.64 
 
 		 482 aa  63.9  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0874  hypothetical protein  25.41 
 
 		 1080 aa  58.5  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0919  hypothetical protein  27.04 
 
 		 611 aa  57.4  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2443  AsmA family protein  30.43 
 
 		 1146 aa  57  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.59764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2612  AsmA family protein  25.14 
 
 		 1094 aa  55.5  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.74213  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3362  AsmA family protein  23.42 
 
 		 1061 aa  55.1  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.596637 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2682  AsmA family protein  27.46 
 
 		 895 aa  53.9  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.397979  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  25.66 
 
 		 797 aa  53.9  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2863  AsmA family protein  29.32 
 
 		 711 aa  53.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  22.57 
 
 		 709 aa  51.6  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0159  AsmA family protein  25.81 
 
 		 794 aa  51.2  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  25.49 
 
 		 677 aa  50.4  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2614  AsmA family protein  24.43 
 
 		 606 aa  50.8  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.745873  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2409  AsmA family protein  26.79 
 
 		 612 aa  49.7  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.278474  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0491  AsmA family protein  31.17 
 
 		 818 aa  49.7  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487855 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5883  hypothetical protein  22.97 
 
 		 750 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4900  AsmA  23.47 
 
 		 741 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1028  hypothetical protein  26.9 
 
 		 725 aa  48.1  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.632611  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0651  AsmA  25 
 
 		 646 aa  48.5  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1887  AsmA protein  25.2 
 
 		 604 aa  48.1  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0899  AsmA family protein  22.59 
 
 		 1061 aa  48.1  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00548137  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1327  hypothetical protein  23.18 
 
 		 599 aa  47.8  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158025  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2657  AsmA  26.09 
 
 		 737 aa  47.4  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.871932  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2209  AsmA family protein  23.5 
 
 		 606 aa  47  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3300  AsmA family protein  22.75 
 
 		 642 aa  47  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0102048 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>