96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1327 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1327  hypothetical protein  100 
 
 		 599 aa  1130    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158025  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0919  hypothetical protein  71.31 
 
 		 611 aa  755    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3033  hypothetical protein  28.75 
 
 		 649 aa  189  9e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0689945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5162  AsmA family protein  30.66 
 
 		 602 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.63495  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0892  AsmA  29.68 
 
 		 655 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3609  AsmA  28.1 
 
 		 640 aa  182  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0560  putative AsmA-like protein  27.83 
 
 		 705 aa  180  7e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.748944 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1004  AsmA  27.9 
 
 		 649 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.478001  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5009  AsmA family protein  35.19 
 
 		 1013 aa  102  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0536968 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1887  AsmA protein  27.94 
 
 		 604 aa  96.7  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  24.14 
 
 		 677 aa  92.4  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  27.03 
 
 		 712 aa  89  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2526  AsmA  26.52 
 
 		 893 aa  86.3  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  26.07 
 
 		 709 aa  84  0.000000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1140  AsmA family protein  26.5 
 
 		 732 aa  80.1  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.999799  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2229  putative outer membrane assembly protein  22.42 
 
 		 719 aa  79.3  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87964  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3762  AsmA family protein  29.59 
 
 		 654 aa  78.6  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2024  AsmA  25.15 
 
 		 614 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000524921  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1332  AsmA family protein  29.96 
 
 		 696 aa  74.7  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2331  AsmA family protein  23.46 
 
 		 607 aa  73.9  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00854787  hitchhiker  0.00634925 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2056  AsmA family protein  23.46 
 
 		 607 aa  73.9  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399142  hitchhiker  0.00088344 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1993  AsmA family protein  23.46 
 
 		 607 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2483  AsmA family protein  27.41 
 
 		 742 aa  73.2  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2694  AsmA family protein  23.77 
 
 		 699 aa  73.6  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.264  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2006  hypothetical protein  31.82 
 
 		 660 aa  72.8  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0368531  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0716  AsmA family protein  32.12 
 
 		 660 aa  71.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.194292 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1016  AsmA  25.4 
 
 		 656 aa  72  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.620407  normal  0.697565 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  23.1 
 
 		 812 aa  71.6  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2566  asmA protein  23.08 
 
 		 606 aa  70.5  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2409  AsmA family protein  22.65 
 
 		 612 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.278474  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0651  AsmA  24.31 
 
 		 646 aa  68.9  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0590  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis  30 
 
 		 826 aa  69.3  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2164  AsmA family protein  23.19 
 
 		 606 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0565997  normal  0.411123 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2241  AsmA family protein  23.19 
 
 		 606 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104222  normal  0.355768 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2372  AsmA protein  22.69 
 
 		 606 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00905663  normal  0.0519979 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0557  asmA protein  22.09 
 
 		 703 aa  67.4  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00432882  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0159  AsmA family protein  28.5 
 
 		 794 aa  67.4  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  27.53 
 
 		 797 aa  66.2  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1134  ASMA  25.41 
 
 		 508 aa  65.5  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.038364  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1004  AsmA family protein  25.41 
 
 		 502 aa  65.1  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000644102  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2008  AsmA family protein  22.86 
 
 		 607 aa  64.3  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0960641  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1953  AsmA family protein  24.73 
 
 		 682 aa  63.2  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.279291  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2209  AsmA family protein  22.94 
 
 		 606 aa  62.4  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6831  putative asmA protein, assembly of outer membrane proteins  23.46 
 
 		 645 aa  62.4  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0946528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1773  AsmA family protein  23.16 
 
 		 608 aa  60.5  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000090206  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1985  AsmA family protein  21 
 
 		 611 aa  60.5  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0885974  normal  0.0733894 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002984  AsmA protein  20.45 
 
 		 695 aa  58.9  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1578  putative assembly protein  21.98 
 
 		 611 aa  59.7  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.976931  normal  0.530891 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1009  hypothetical protein  26.69 
 
 		 656 aa  58.2  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1019  outer membrane protein assembly protein AsmA  24.14 
 
 		 640 aa  57.8  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02923  hypothetical protein  20.07 
 
 		 695 aa  57  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1028  hypothetical protein  29.48 
 
 		 725 aa  57  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.632611  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0874  hypothetical protein  25.26 
 
 		 1080 aa  56.6  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2863  AsmA family protein  24.38 
 
 		 711 aa  56.6  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2162  AsmA family protein  25.98 
 
 		 701 aa  56.6  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.152966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1433  AsmA  26.21 
 
 		 655 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1659  AsmA family protein  24.52 
 
 		 1191 aa  56.2  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.242862 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2303  putative assembly protein  21.99 
 
 		 618 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2347  putative assembly protein  21.99 
 
 		 618 aa  56.2  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2354  putative assembly protein  21.99 
 
 		 618 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.827623  normal  0.53573 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2247  putative assembly protein  21.99 
 
 		 618 aa  56.2  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2461  putative assembly protein  21.99 
 
 		 618 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.45795 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3951  AsmA  26.21 
 
 		 649 aa  55.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2614  AsmA family protein  20.34 
 
 		 606 aa  55.5  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.745873  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0118  AsmA  22.99 
 
 		 762 aa  53.1  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413911  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4261  AsmA family protein  25.65 
 
 		 669 aa  52  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.545183  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0521  AsmA  26.84 
 
 		 789 aa  52  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1245  AsmA  28.69 
 
 		 643 aa  51.6  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.350704  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4258  AsmA family protein  23.31 
 
 		 791 aa  51.6  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521449  normal  0.0888136 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1168  putative assembly protein  19.84 
 
 		 617 aa  51.6  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1457  AsmA  24.6 
 
 		 654 aa  50.8  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2204  putative assembly protein  19.84 
 
 		 617 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0754  AsmA family protein  25.23 
 
 		 745 aa  50.1  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0996  putative assembly protein  19.84 
 
 		 617 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4921  AsmA family protein  26.96 
 
 		 747 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1577  putative assembly protein  19.84 
 
 		 617 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190719  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1593  AsmA family protein  19.84 
 
 		 617 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00514431  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2612  AsmA family protein  25 
 
 		 1094 aa  49.7  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.74213  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2357  putative assembly protein  19.84 
 
 		 617 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0084  hypothetical protein  27.84 
 
 		 999 aa  49.3  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1744  hypothetical protein  28.93 
 
 		 1284 aa  49.7  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0306491 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3001  putative assembly protein  19.84 
 
 		 617 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.352254 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01959  hypothetical protein  19.44 
 
 		 617 aa  48.9  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01970  predicted assembly protein  19.44 
 
 		 617 aa  48.9  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4644  AsmA family protein  23.46 
 
 		 649 aa  48.5  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0752121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0763  AsmA family protein  23.08 
 
 		 1070 aa  48.1  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116181  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2640  AsmA  24.03 
 
 		 735 aa  47.8  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1173  AsmA  23.46 
 
 		 1079 aa  47.8  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000700757  normal  0.126204 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3144  AsmA family protein  28.81 
 
 		 632 aa  46.6  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.524402  normal  0.468603 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4636  AsmA family protein  25.22 
 
 		 648 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86579  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0212  hypothetical protein  24.09 
 
 		 1217 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0447715 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2116  AsmA family protein  23.26 
 
 		 614 aa  46.2  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.738267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3300  AsmA family protein  28.19 
 
 		 642 aa  45.4  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0102048 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1313  hypothetical protein  27.98 
 
 		 809 aa  45.1  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000526597  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2918  AsmA family protein  28.39 
 
 		 632 aa  44.7  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0271811  normal  0.516066 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0817  AsmA  23.01 
 
 		 791 aa  43.9  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118812  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>