103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A0099 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA1309  AsmA family protein  100 
 
 		 830 aa  1648    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2319  AsmA family protein  100 
 
 		 830 aa  1648    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5070  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis, AsmA  86.11 
 
 		 764 aa  827    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2268  AsmA family protein  86.75 
 
 		 818 aa  1341    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.1369  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1711  AsmA family protein  65.57 
 
 		 765 aa  1044    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1796  AsmA family protein  100 
 
 		 830 aa  1648    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.147838  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0099  AsmA family protein  100 
 
 		 830 aa  1648    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.483374  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2151  AsmA family protein  100 
 
 		 830 aa  1648    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2188  AsmA family protein  99.79 
 
 		 824 aa  951    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1067  AsmA family protein  100 
 
 		 830 aa  1648    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.103538  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1499  AsmA family protein  85.01 
 
 		 759 aa  819    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473524 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1703  AsmA family protein  70.21 
 
 		 782 aa  704    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1797  AsmA family protein  82.23 
 
 		 765 aa  790    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.374116 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1865  AsmA family protein  61.64 
 
 		 832 aa  986    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0704419  normal  0.0719659 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64510  hypothetical protein  56.12 
 
 		 689 aa  558  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5601  hypothetical protein  56.12 
 
 		 689 aa  557  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4907  hypothetical protein  56.06 
 
 		 688 aa  546  1e-154  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0791  AsmA family protein  54.77 
 
 		 765 aa  548  1e-154  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.352435  normal  0.138985 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4449  AsmA  55.85 
 
 		 688 aa  545  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0721  AsmA family protein  51.88 
 
 		 765 aa  542  1e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.641564 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4857  AsmA family protein  55.53 
 
 		 688 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000523424 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4735  AsmA family protein  55.53 
 
 		 688 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000197359 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4914  AsmA family protein  55.77 
 
 		 688 aa  535  1e-150  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000550525 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4649  AsmA family protein  54.53 
 
 		 688 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0580327 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0784  AsmA family protein  54.01 
 
 		 680 aa  519  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0773  hypothetical protein  55.05 
 
 		 740 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0128597 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0566  AsmA  53.27 
 
 		 691 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723827 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4261  AsmA family protein  53.38 
 
 		 669 aa  484  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.545183  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0817  AsmA  51.37 
 
 		 791 aa  482  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118812  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2640  AsmA  51.08 
 
 		 735 aa  481  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02380  AsmA family protein  51.4 
 
 		 677 aa  476  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4747  AsmA family protein  49.16 
 
 		 678 aa  471  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4058  AsmA family protein  51.05 
 
 		 745 aa  463  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4073  hypothetical protein  51.04 
 
 		 729 aa  464  1e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0571071 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0104  AsmA family protein  50.81 
 
 		 739 aa  464  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03372  predicted outer membrane biogenesis protein  48.2 
 
 		 691 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0189  AsmA family protein  48.2 
 
 		 691 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3921  AsmA family protein  47.56 
 
 		 686 aa  461  9.999999999999999e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3727  AsmA family protein  48.2 
 
 		 686 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0193  AsmA family protein  48.2 
 
 		 691 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3828  AsmA family protein  47.98 
 
 		 686 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975888 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3929  AsmA family protein  48.2 
 
 		 686 aa  461  9.999999999999999e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4887  AsmA family protein  48.2 
 
 		 686 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.647897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4012  AsmA family protein  48.2 
 
 		 686 aa  459  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3882  AsmA family protein  47.98 
 
 		 686 aa  458  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3926  AsmA family protein  47.77 
 
 		 686 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3804  AsmA family protein  46.72 
 
 		 686 aa  459  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3817  AsmA family protein  47.77 
 
 		 686 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3985  AsmA family protein  47.77 
 
 		 686 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.189734 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6307  AsmA  76.19 
 
 		 765 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726183  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1772  AsmA family protein  76.19 
 
 		 765 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192484  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2673  AsmA family protein  41.47 
 
 		 762 aa  356  1e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.583753  normal  0.123003 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0079  AsmA  39.09 
 
 		 669 aa  342  1e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.178612  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  38.39 
 
 		 632 aa  337  3.9999999999999995e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1683  AsmA family protein  67.28 
 
 		 765 aa  335  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1774  AsmA family protein  38.04 
 
 		 761 aa  323  8e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4258  AsmA family protein  39.24 
 
 		 791 aa  315  2.9999999999999996e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521449  normal  0.0888136 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2321  putative transmembrane protein, AsmA-like  58.14 
 
 		 839 aa  301  4e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.704699 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3055  AsmA family protein  36.74 
 
 		 657 aa  293  1e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1181  AsmA  35.18 
 
 		 667 aa  292  2e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.256758  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0988  AsmA family protein  57.92 
 
 		 810 aa  278  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0883  AsmA  35.9 
 
 		 664 aa  268  2.9999999999999995e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.444148 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0924  AsmA family protein  32.3 
 
 		 670 aa  255  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4106  AsmA family protein  32.15 
 
 		 669 aa  251  5e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850545  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0666  hypothetical protein  35.73 
 
 		 697 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3293  AsmA family protein  32.27 
 
 		 656 aa  233  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187573  normal  0.760873 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4644  AsmA family protein  30.35 
 
 		 649 aa  208  4e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0752121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2665  AsmA family protein  30.41 
 
 		 674 aa  171  5e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100749 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2433  AsmA family protein  26.45 
 
 		 710 aa  154  7e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.2026  normal  0.914727 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1200  AsmA  27.07 
 
 		 700 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0110  AsmA family protein  25.45 
 
 		 704 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  25.71 
 
 		 1077 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0489  hypothetical protein  21.9 
 
 		 665 aa  77  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000190696  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2443  AsmA family protein  32.47 
 
 		 1146 aa  76.6  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.59764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2682  AsmA family protein  28.08 
 
 		 895 aa  72.4  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.397979  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  32.28 
 
 		 677 aa  65.9  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0491  AsmA family protein  28.45 
 
 		 818 aa  57.8  0.0000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487855 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1028  hypothetical protein  25.76 
 
 		 725 aa  56.6  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.632611  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  26.28 
 
 		 797 aa  55.8  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01675  AsmA family membrane protein  37.8 
 
 		 342 aa  56.2  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.3424  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0557  asmA protein  30.56 
 
 		 703 aa  53.9  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00432882  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2769  AsmA family protein  23.37 
 
 		 587 aa  53.5  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.961536  normal  0.388317 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2229  putative outer membrane assembly protein  31.48 
 
 		 719 aa  54.3  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87964  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2863  AsmA family protein  23.55 
 
 		 711 aa  54.3  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  28.7 
 
 		 812 aa  53.5  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1136  AsmA family protein  24.9 
 
 		 295 aa  52.8  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0437231 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0521  AsmA  28.77 
 
 		 789 aa  50.8  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0159  AsmA family protein  22.54 
 
 		 794 aa  50.4  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  31.62 
 
 		 712 aa  50.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0754  AsmA family protein  25.17 
 
 		 745 aa  49.7  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1769  AsmA family protein  22.62 
 
 		 1278 aa  49.7  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2612  AsmA family protein  24.55 
 
 		 1094 aa  50.1  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.74213  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0118  AsmA  29.29 
 
 		 762 aa  48.5  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413911  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3362  AsmA family protein  22.16 
 
 		 1061 aa  48.1  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.596637 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  30.88 
 
 		 813 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2657  AsmA  27.83 
 
 		 737 aa  47  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.871932  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1332  AsmA family protein  26.67 
 
 		 696 aa  47.4  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0711  AsmA family protein  25.71 
 
 		 609 aa  47.8  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0596  AsmA family protein  29.85 
 
 		 1186 aa  47.4  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233427 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4900  AsmA  24.77 
 
 		 741 aa  46.6  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>