105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0773 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4857  AsmA family protein  47.23 
 
 		 688 aa  645    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000523424 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0773  hypothetical protein  100 
 
 		 740 aa  1488    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0128597 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4449  AsmA  47.78 
 
 		 688 aa  651    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0817  AsmA  55.88 
 
 		 791 aa  786    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118812  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2640  AsmA  58.54 
 
 		 735 aa  810    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64510  hypothetical protein  50.36 
 
 		 689 aa  675    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4735  AsmA family protein  47.56 
 
 		 688 aa  646    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000197359 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5601  hypothetical protein  50.36 
 
 		 689 aa  676    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1703  AsmA family protein  46.55 
 
 		 782 aa  687    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4914  AsmA family protein  46.99 
 
 		 688 aa  637    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000550525 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4649  AsmA family protein  48.08 
 
 		 688 aa  639    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0580327 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0721  AsmA family protein  80.99 
 
 		 765 aa  1226    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.641564 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4261  AsmA family protein  52.14 
 
 		 669 aa  690    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.545183  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0791  AsmA family protein  82.2 
 
 		 765 aa  1237    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.352435  normal  0.138985 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4907  hypothetical protein  46.48 
 
 		 688 aa  633  1e-180  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0566  AsmA  48.75 
 
 		 691 aa  626  1e-178  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723827 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0784  AsmA family protein  48.36 
 
 		 680 aa  616  1e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4747  AsmA family protein  43.57 
 
 		 678 aa  594  1e-168  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02380  AsmA family protein  44.41 
 
 		 677 aa  577  1.0000000000000001e-163  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1865  AsmA family protein  56.26 
 
 		 832 aa  565  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0704419  normal  0.0719659 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2321  putative transmembrane protein, AsmA-like  57.43 
 
 		 839 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.704699 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0988  AsmA family protein  53.31 
 
 		 810 aa  556  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3828  AsmA family protein  39.27 
 
 		 686 aa  533  1e-150  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975888 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3804  AsmA family protein  41.06 
 
 		 686 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4887  AsmA family protein  39.12 
 
 		 686 aa  532  1e-150  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.647897  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03372  predicted outer membrane biogenesis protein  39.12 
 
 		 691 aa  531  1e-149  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0189  AsmA family protein  39.12 
 
 		 691 aa  531  1e-149  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3921  AsmA family protein  39.94 
 
 		 686 aa  530  1e-149  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3727  AsmA family protein  39.12 
 
 		 686 aa  531  1e-149  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4012  AsmA family protein  39.12 
 
 		 686 aa  530  1e-149  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0193  AsmA family protein  39.12 
 
 		 691 aa  531  1e-149  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3929  AsmA family protein  39.12 
 
 		 686 aa  531  1e-149  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3882  AsmA family protein  41.06 
 
 		 686 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3926  AsmA family protein  40.62 
 
 		 686 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3817  AsmA family protein  41.06 
 
 		 686 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3985  AsmA family protein  40.62 
 
 		 686 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.189734 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6307  AsmA  56.25 
 
 		 765 aa  521  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726183  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1772  AsmA family protein  56.25 
 
 		 765 aa  521  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192484  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1499  AsmA family protein  56.47 
 
 		 759 aa  520  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473524 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1797  AsmA family protein  56.25 
 
 		 765 aa  521  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.374116 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2188  AsmA family protein  55.27 
 
 		 824 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4073  hypothetical protein  38.94 
 
 		 729 aa  519  1.0000000000000001e-145  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0571071 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0104  AsmA family protein  38.39 
 
 		 739 aa  517  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1309  AsmA family protein  55.05 
 
 		 830 aa  515  1e-144  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2319  AsmA family protein  55.05 
 
 		 830 aa  515  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5070  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis, AsmA  54.96 
 
 		 764 aa  513  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1796  AsmA family protein  55.05 
 
 		 830 aa  515  1e-144  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.147838  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0099  AsmA family protein  55.05 
 
 		 830 aa  515  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.483374  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2151  AsmA family protein  55.05 
 
 		 830 aa  515  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1067  AsmA family protein  55.05 
 
 		 830 aa  515  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.103538  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4058  AsmA family protein  37.92 
 
 		 745 aa  513  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2268  AsmA family protein  54.99 
 
 		 818 aa  511  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.1369  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1683  AsmA family protein  53.4 
 
 		 765 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1711  AsmA family protein  54.33 
 
 		 765 aa  500  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  36.23 
 
 		 632 aa  427  1e-118  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0079  AsmA  34.23 
 
 		 669 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.178612  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2673  AsmA family protein  40.5 
 
 		 762 aa  405  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.583753  normal  0.123003 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1774  AsmA family protein  38.01 
 
 		 761 aa  357  5e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1181  AsmA  30.57 
 
 		 667 aa  353  8.999999999999999e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.256758  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4258  AsmA family protein  36.81 
 
 		 791 aa  349  8e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521449  normal  0.0888136 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4106  AsmA family protein  31.32 
 
 		 669 aa  321  3e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850545  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3055  AsmA family protein  34.85 
 
 		 657 aa  319  1e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0883  AsmA  30.87 
 
 		 664 aa  317  5e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.444148 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0924  AsmA family protein  29.45 
 
 		 670 aa  317  6e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3293  AsmA family protein  32.07 
 
 		 656 aa  297  4e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187573  normal  0.760873 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0666  hypothetical protein  30.35 
 
 		 697 aa  273  1e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4644  AsmA family protein  27.87 
 
 		 649 aa  251  4e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0752121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2433  AsmA family protein  26.49 
 
 		 710 aa  213  7e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.2026  normal  0.914727 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2665  AsmA family protein  26.42 
 
 		 674 aa  194  7e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100749 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1200  AsmA  24.34 
 
 		 700 aa  158  4e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0110  AsmA family protein  24.93 
 
 		 704 aa  139  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0489  hypothetical protein  18.45 
 
 		 665 aa  95.9  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000190696  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  26.42 
 
 		 1077 aa  68.6  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3362  AsmA family protein  27.18 
 
 		 1061 aa  68.2  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.596637 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01675  AsmA family membrane protein  25.42 
 
 		 342 aa  65.9  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.3424  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0899  AsmA family protein  26.42 
 
 		 1061 aa  64.3  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00548137  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1769  AsmA family protein  25.68 
 
 		 1278 aa  61.2  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  20.89 
 
 		 677 aa  60.5  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2769  AsmA family protein  22.22 
 
 		 587 aa  58.5  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.961536  normal  0.388317 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  27.14 
 
 		 797 aa  56.6  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1745  hypothetical protein  24.31 
 
 		 482 aa  56.2  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2682  AsmA family protein  20.61 
 
 		 895 aa  56.6  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.397979  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0521  AsmA  29.66 
 
 		 789 aa  55.5  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2443  AsmA family protein  29.17 
 
 		 1146 aa  54.7  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.59764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2657  AsmA  28.7 
 
 		 737 aa  53.9  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.871932  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0159  AsmA family protein  24.22 
 
 		 794 aa  52.8  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002984  AsmA protein  19.88 
 
 		 695 aa  52  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0491  AsmA family protein  23.51 
 
 		 818 aa  50.8  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487855 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  26.62 
 
 		 709 aa  50.1  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0118  AsmA  24.65 
 
 		 762 aa  50.1  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413911  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0651  AsmA  28.57 
 
 		 646 aa  49.3  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1887  AsmA protein  24.56 
 
 		 604 aa  48.9  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1134  ASMA  22.54 
 
 		 508 aa  48.9  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.038364  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  25.22 
 
 		 812 aa  48.5  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1004  AsmA family protein  22.54 
 
 		 502 aa  48.9  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000644102  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1028  hypothetical protein  26.06 
 
 		 725 aa  47.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.632611  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2612  AsmA family protein  22.88 
 
 		 1094 aa  47  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.74213  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1371  AsmA family protein  28.04 
 
 		 1104 aa  46.6  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000870938  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0874  hypothetical protein  24.76 
 
 		 1080 aa  45.4  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1408  hypothetical protein  23.75 
 
 		 1247 aa  45.8  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>