131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0491 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0491  AsmA family protein  100 
 
 		 818 aa  1556    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487855 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2682  AsmA family protein  27.96 
 
 		 895 aa  194  5e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.397979  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0711  AsmA family protein  25.09 
 
 		 609 aa  84  0.000000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0110  AsmA family protein  27.4 
 
 		 704 aa  82  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  32.81 
 
 		 1077 aa  78.6  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  29.88 
 
 		 677 aa  78.6  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  30.67 
 
 		 797 aa  77.8  0.0000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4449  AsmA  27.57 
 
 		 688 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4907  hypothetical protein  26.12 
 
 		 688 aa  71.2  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5883  hypothetical protein  27.33 
 
 		 750 aa  68.2  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0566  AsmA  25.94 
 
 		 691 aa  67  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723827 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4914  AsmA family protein  30.33 
 
 		 688 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000550525 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4857  AsmA family protein  29.51 
 
 		 688 aa  64.3  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000523424 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4735  AsmA family protein  29.51 
 
 		 688 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000197359 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5070  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis, AsmA  25.13 
 
 		 764 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67975  hypothetical protein  26.69 
 
 		 750 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.302933  normal  0.0556453 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2116  AsmA family protein  26.67 
 
 		 614 aa  62.8  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.738267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4258  AsmA family protein  24.26 
 
 		 741 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000475178 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2409  AsmA family protein  25 
 
 		 612 aa  62.4  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.278474  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  24.06 
 
 		 812 aa  62.4  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4649  AsmA family protein  27.52 
 
 		 688 aa  62  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0580327 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2162  AsmA family protein  27.17 
 
 		 701 aa  60.8  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.152966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0079  AsmA  25.34 
 
 		 669 aa  60.5  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.178612  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3055  AsmA family protein  27.66 
 
 		 657 aa  60.8  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4900  AsmA  25.34 
 
 		 741 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6307  AsmA  25.13 
 
 		 765 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726183  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1772  AsmA family protein  25.13 
 
 		 765 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192484  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1797  AsmA family protein  25.13 
 
 		 765 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.374116 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1009  hypothetical protein  25.3 
 
 		 656 aa  58.9  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1245  AsmA  28.22 
 
 		 643 aa  58.9  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.350704  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  29.3 
 
 		 712 aa  58.9  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5341  hypothetical protein  25.79 
 
 		 741 aa  57  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2268  AsmA family protein  28.45 
 
 		 818 aa  57  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.1369  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2657  AsmA  27.16 
 
 		 737 aa  56.2  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.871932  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0557  asmA protein  22.78 
 
 		 703 aa  56.6  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00432882  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1309  AsmA family protein  28.45 
 
 		 830 aa  55.8  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2319  AsmA family protein  28.45 
 
 		 830 aa  55.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1181  AsmA  21.01 
 
 		 667 aa  55.8  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.256758  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2694  AsmA family protein  29.38 
 
 		 699 aa  56.2  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.264  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1796  AsmA family protein  28.45 
 
 		 830 aa  55.8  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.147838  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0099  AsmA family protein  28.45 
 
 		 830 aa  55.8  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.483374  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2151  AsmA family protein  28.45 
 
 		 830 aa  55.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2188  AsmA family protein  28.45 
 
 		 824 aa  55.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1067  AsmA family protein  28.45 
 
 		 830 aa  55.8  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.103538  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0321  AsmA  21.76 
 
 		 740 aa  55.5  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.188121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2769  AsmA family protein  30.84 
 
 		 587 aa  55.5  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.961536  normal  0.388317 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1028  hypothetical protein  29.21 
 
 		 725 aa  55.5  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.632611  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2024  AsmA  23.71 
 
 		 614 aa  55.5  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000524921  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1499  AsmA family protein  27.05 
 
 		 759 aa  55.1  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473524 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0312  AsmA family protein  26.72 
 
 		 748 aa  55.1  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0754  AsmA family protein  24.02 
 
 		 745 aa  55.1  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2347  putative assembly protein  23.55 
 
 		 618 aa  54.7  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002984  AsmA protein  22.85 
 
 		 695 aa  54.3  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1887  AsmA protein  24.6 
 
 		 604 aa  53.9  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2678  putative assembly protein  22.02 
 
 		 615 aa  53.9  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.462778  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1683  AsmA family protein  29.03 
 
 		 765 aa  54.3  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2461  putative assembly protein  23.36 
 
 		 618 aa  52.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.45795 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2354  putative assembly protein  23.19 
 
 		 618 aa  53.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.827623  normal  0.53573 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1984  AsmA  28.57 
 
 		 1273 aa  52.8  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.697769  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2303  putative assembly protein  23.36 
 
 		 618 aa  53.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2806  hypothetical protein  27.87 
 
 		 1238 aa  53.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2247  putative assembly protein  23.19 
 
 		 618 aa  53.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  27.59 
 
 		 632 aa  52.8  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2547  hypothetical protein  27.87 
 
 		 1234 aa  52.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00977627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5601  hypothetical protein  30.16 
 
 		 689 aa  52.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02380  AsmA family protein  28.88 
 
 		 677 aa  52.8  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1137  AsmA family protein  24.84 
 
 		 265 aa  52.8  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0909358 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1865  AsmA family protein  24.36 
 
 		 832 aa  52  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0704419  normal  0.0719659 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0817  AsmA  25.58 
 
 		 791 aa  52  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118812  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1711  AsmA family protein  25.41 
 
 		 765 aa  52.4  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64510  hypothetical protein  29.37 
 
 		 689 aa  52.4  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1332  AsmA family protein  25.58 
 
 		 696 aa  52.4  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2331  AsmA family protein  22.53 
 
 		 607 aa  52  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00854787  hitchhiker  0.00634925 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0287  AsmA family protein  25.83 
 
 		 748 aa  52  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233767 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2321  putative transmembrane protein, AsmA-like  29.58 
 
 		 839 aa  51.6  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.704699 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0104  AsmA family protein  30.61 
 
 		 739 aa  51.6  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1993  AsmA family protein  22.53 
 
 		 607 aa  51.6  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4058  AsmA family protein  30.61 
 
 		 745 aa  51.6  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2056  AsmA family protein  22.53 
 
 		 607 aa  51.6  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399142  hitchhiker  0.00088344 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4073  hypothetical protein  32.95 
 
 		 729 aa  51.6  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0571071 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1953  AsmA family protein  22.1 
 
 		 682 aa  51.6  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.279291  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2209  AsmA family protein  23.5 
 
 		 606 aa  51.2  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0763  AsmA family protein  26.79 
 
 		 1070 aa  50.4  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116181  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0924  AsmA family protein  26.02 
 
 		 670 aa  50.8  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2008  AsmA family protein  22.53 
 
 		 607 aa  50.4  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0960641  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2828  hypothetical protein  26.18 
 
 		 1230 aa  50.4  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4106  AsmA family protein  23.49 
 
 		 669 aa  50.8  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850545  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1703  AsmA family protein  23.64 
 
 		 782 aa  50.8  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0159  AsmA family protein  23.24 
 
 		 794 aa  50.1  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1140  AsmA family protein  26.04 
 
 		 732 aa  49.7  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.999799  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0988  AsmA family protein  20.91 
 
 		 810 aa  49.7  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0521  AsmA  30 
 
 		 789 aa  49.3  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2640  AsmA  31.17 
 
 		 735 aa  49.3  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0307  AsmA family protein  26.29 
 
 		 748 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304017 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4261  AsmA family protein  35.62 
 
 		 669 aa  49.3  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.545183  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2030  hypothetical protein  26.61 
 
 		 1246 aa  48.9  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0479736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4921  AsmA family protein  25.33 
 
 		 747 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01675  AsmA family membrane protein  25.32 
 
 		 342 aa  48.5  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.3424  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0791  AsmA family protein  23.53 
 
 		 765 aa  48.1  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.352435  normal  0.138985 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1874  hypothetical protein  23.84 
 
 		 1011 aa  47.8  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.794272  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>