120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0763 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0874  hypothetical protein  40.85 
 
 		 1080 aa  832    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1173  AsmA  40 
 
 		 1079 aa  814    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000700757  normal  0.126204 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3362  AsmA family protein  40.41 
 
 		 1061 aa  787    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.596637 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0763  AsmA family protein  100 
 
 		 1070 aa  2144    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116181  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1371  AsmA family protein  41.98 
 
 		 1104 aa  889    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000870938  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2612  AsmA family protein  43.18 
 
 		 1094 aa  877    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.74213  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0899  AsmA family protein  40.35 
 
 		 1061 aa  779    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00548137  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2358  hypothetical protein  23.97 
 
 		 1102 aa  249  3e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3774  membrane protein-like  29.47 
 
 		 1234 aa  107  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0394533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1218  hypothetical protein  30.94 
 
 		 1341 aa  77  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0577669  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0705  membrane protein-like protein  21.67 
 
 		 1224 aa  76.3  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.113545  hitchhiker  0.00000969857 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5159  hypothetical protein  26.74 
 
 		 1394 aa  67.8  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4831  hypothetical protein  28.97 
 
 		 1420 aa  65.1  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761382  normal  0.626491 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2657  hypothetical protein  25.72 
 
 		 1426 aa  64.3  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0993  hypothetical protein  23.62 
 
 		 1398 aa  63.9  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.193482 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1029  hypothetical protein  28.83 
 
 		 1419 aa  63.2  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2894  putative transmembrane protein  26.34 
 
 		 1426 aa  63.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1861  membrane protein-like protein  19.71 
 
 		 1144 aa  63.2  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.777283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3321  hypothetical protein  24.73 
 
 		 1397 aa  62.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2488  hypothetical protein  26.76 
 
 		 1426 aa  63.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3332  hypothetical protein  24.73 
 
 		 1397 aa  62.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3288  hypothetical protein  24.36 
 
 		 1397 aa  62.4  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0218679  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0849  hypothetical protein  27.96 
 
 		 1384 aa  62.4  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2335  hypothetical protein  24.45 
 
 		 1368 aa  61.2  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0549  hypothetical protein  21.16 
 
 		 1210 aa  61.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0490  hypothetical protein  24.45 
 
 		 1397 aa  61.2  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1109  hypothetical protein  24.45 
 
 		 1397 aa  61.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.823265  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2216  hypothetical protein  24.09 
 
 		 1372 aa  61.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0519007  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2270  membrane protein-like protein  23.9 
 
 		 1304 aa  59.3  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1400  hypothetical protein  21.95 
 
 		 843 aa  59.3  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.71275  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1776  membrane protein-like protein  20.96 
 
 		 1384 aa  58.9  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1953  AsmA family protein  22.71 
 
 		 682 aa  58.2  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.279291  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1298  hypothetical protein  24.09 
 
 		 1397 aa  58.2  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438344  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0634  hypothetical protein  21.95 
 
 		 856 aa  57.8  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3609  AsmA  23.54 
 
 		 640 aa  57.4  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0257  hypothetical protein  26.61 
 
 		 1399 aa  57.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.866424  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2694  AsmA family protein  25.67 
 
 		 699 aa  57.8  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.264  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0741  hypothetical protein  25.69 
 
 		 1399 aa  57.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77418  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0711  hypothetical protein  25.69 
 
 		 1399 aa  57.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.463012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1493  membrane protein-like protein  25.36 
 
 		 1379 aa  57.8  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1744  hypothetical protein  23.74 
 
 		 1284 aa  57  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0306491 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0555  hypothetical protein  21.95 
 
 		 843 aa  57  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4921  AsmA family protein  21.71 
 
 		 747 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2643  hypothetical protein  26.55 
 
 		 1399 aa  56.2  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.73761 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0634  hypothetical protein  25.69 
 
 		 1398 aa  55.8  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.913326  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0659  hypothetical protein  25.69 
 
 		 1398 aa  55.5  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  25.93 
 
 		 797 aa  55.1  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0928  hypothetical protein  22.28 
 
 		 655 aa  55.1  0.000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.903286  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0563  hypothetical protein  24.77 
 
 		 1419 aa  55.1  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72639  normal  0.280407 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3829  hypothetical protein  24.77 
 
 		 1399 aa  55.1  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0521  AsmA  24.32 
 
 		 789 aa  54.7  0.000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  31.78 
 
 		 812 aa  53.9  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67975  hypothetical protein  26 
 
 		 750 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.302933  normal  0.0556453 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2899  hypothetical protein  29.03 
 
 		 1283 aa  54.3  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0366  hypothetical protein  23.31 
 
 		 1381 aa  53.5  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0307  AsmA family protein  24.29 
 
 		 748 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304017 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3970  hypothetical protein  24.07 
 
 		 1430 aa  52.8  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.231617 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4258  AsmA family protein  22.51 
 
 		 741 aa  53.1  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000475178 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1719  hypothetical protein  26.71 
 
 		 1273 aa  52.4  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3330  hypothetical protein  24.29 
 
 		 1307 aa  52.8  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000315008 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0510  hypothetical protein  25.59 
 
 		 1261 aa  52.8  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2223  protein of unknown function DUF748  23.7 
 
 		 1216 aa  52.8  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.023159  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4555  putative protease  24.84 
 
 		 1323 aa  51.6  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1199  putative assembly protein  22.32 
 
 		 599 aa  51.6  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1045  hypothetical protein  21.02 
 
 		 921 aa  51.6  0.00008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.665952  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  32.28 
 
 		 709 aa  51.6  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0287  AsmA family protein  23.73 
 
 		 748 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233767 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1719  hypothetical protein  26.09 
 
 		 1273 aa  51.2  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1618  hypothetical protein  27.64 
 
 		 1197 aa  51.2  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0115001 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1091  hypothetical protein  19.62 
 
 		 853 aa  51.2  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5883  hypothetical protein  26 
 
 		 750 aa  51.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3269  hypothetical protein  24.32 
 
 		 1169 aa  51.2  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.723226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0312  AsmA family protein  23.6 
 
 		 748 aa  51.2  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0728  hypothetical protein  27.98 
 
 		 1428 aa  51.2  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2235  hypothetical protein  27.54 
 
 		 1290 aa  50.4  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0491  AsmA family protein  26.79 
 
 		 818 aa  50.4  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487855 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1985  AsmA family protein  22.52 
 
 		 611 aa  50.1  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0885974  normal  0.0733894 
 
 
-
 
NC_002978  WD0305  hypothetical protein  27.54 
 
 		 1040 aa  49.7  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.396383  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0264  hypothetical protein  23.3 
 
 		 995 aa  49.7  0.0003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4655  hypothetical protein  22.82 
 
 		 1441 aa  49.3  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0243  putative transmembrane protein  23.14 
 
 		 1472 aa  49.3  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.150673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0188  hypothetical protein  22.99 
 
 		 1301 aa  48.9  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1327  hypothetical protein  22.49 
 
 		 599 aa  48.9  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158025  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  22.28 
 
 		 712 aa  48.9  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4656  hypothetical protein  24.49 
 
 		 1425 aa  48.5  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0471  hypothetical protein  22.86 
 
 		 1286 aa  48.5  0.0006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.356031  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0077  AsmA  26.97 
 
 		 506 aa  48.5  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0411  hypothetical protein  23.21 
 
 		 1274 aa  48.5  0.0008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.68904  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2863  AsmA family protein  21.62 
 
 		 711 aa  47.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2483  AsmA family protein  23.08 
 
 		 742 aa  47.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1019  outer membrane protein assembly protein AsmA  23.15 
 
 		 640 aa  47.4  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0854  AsmA family protein  27.82 
 
 		 715 aa  47.8  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000187162  hitchhiker  0.00000372454 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4900  AsmA  23.11 
 
 		 741 aa  46.6  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1669  hypothetical protein  21.14 
 
 		 1210 aa  47.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.285065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2656  hypothetical protein  23.46 
 
 		 1288 aa  47  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37084  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2526  AsmA  24.23 
 
 		 893 aa  47  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3329  hypothetical protein  24.24 
 
 		 1419 aa  46.6  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58090  hypothetical protein  24 
 
 		 1276 aa  47.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0472  membrane protein  25.88 
 
 		 1515 aa  47  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.50538 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6831  putative asmA protein, assembly of outer membrane proteins  23.27 
 
 		 645 aa  47  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0946528  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>