125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2657 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2657  hypothetical protein  100 
 
 		 1426 aa  2824    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2335  hypothetical protein  35.61 
 
 		 1368 aa  668    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1029  hypothetical protein  44.62 
 
 		 1419 aa  1125    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3332  hypothetical protein  35.42 
 
 		 1397 aa  673    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3829  hypothetical protein  33.95 
 
 		 1399 aa  664    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1298  hypothetical protein  34.91 
 
 		 1397 aa  664    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438344  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3970  hypothetical protein  33.43 
 
 		 1430 aa  677    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.231617 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0993  hypothetical protein  43.61 
 
 		 1398 aa  1125    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.193482 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0257  hypothetical protein  33.5 
 
 		 1399 aa  655    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.866424  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0634  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1398 aa  638    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.913326  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0741  hypothetical protein  33.5 
 
 		 1399 aa  654    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77418  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0490  hypothetical protein  35.33 
 
 		 1397 aa  670    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1109  hypothetical protein  35.33 
 
 		 1397 aa  670    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.823265  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3288  hypothetical protein  35.42 
 
 		 1397 aa  676    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0218679  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3321  hypothetical protein  35.42 
 
 		 1397 aa  674    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2216  hypothetical protein  35.61 
 
 		 1372 aa  669    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0519007  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2488  hypothetical protein  77.12 
 
 		 1426 aa  2202    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0711  hypothetical protein  33.5 
 
 		 1399 aa  655    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.463012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0659  hypothetical protein  33.4 
 
 		 1398 aa  641    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2507  hypothetical protein  32.65 
 
 		 1419 aa  661    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0728  hypothetical protein  33.19 
 
 		 1428 aa  678    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2894  putative transmembrane protein  78.65 
 
 		 1426 aa  2238    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2643  hypothetical protein  33.21 
 
 		 1399 aa  632  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.73761 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0366  hypothetical protein  31.97 
 
 		 1381 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3368  hypothetical protein  33.28 
 
 		 1378 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.48731  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3897  hypothetical protein  31.62 
 
 		 1379 aa  566  1e-160  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.663381 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4831  hypothetical protein  32.96 
 
 		 1420 aa  563  1.0000000000000001e-159  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761382  normal  0.626491 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0849  hypothetical protein  31.81 
 
 		 1384 aa  564  1.0000000000000001e-159  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4656  hypothetical protein  31.73 
 
 		 1425 aa  554  1e-156  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4655  hypothetical protein  31.04 
 
 		 1441 aa  538  1e-151  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5159  hypothetical protein  35.36 
 
 		 1394 aa  530  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0243  putative transmembrane protein  32.13 
 
 		 1472 aa  522  1e-146  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.150673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1776  membrane protein-like protein  26.65 
 
 		 1384 aa  502  1e-140  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1218  hypothetical protein  31.45 
 
 		 1341 aa  476  1e-132  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0577669  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3330  hypothetical protein  28.42 
 
 		 1307 aa  468  9.999999999999999e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000315008 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1493  membrane protein-like protein  26.52 
 
 		 1379 aa  468  9.999999999999999e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3520  putative transmembrane protein  29.34 
 
 		 1450 aa  444  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0199259 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1744  hypothetical protein  25.92 
 
 		 1284 aa  421  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0306491 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1057  hypothetical protein  27.63 
 
 		 1264 aa  402  9.999999999999999e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0510  hypothetical protein  27.87 
 
 		 1261 aa  390  1e-106  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4018  hypothetical protein  30.85 
 
 		 1418 aa  355  4e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.938248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4406  hypothetical protein  24.82 
 
 		 1291 aa  228  6e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.213897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2656  hypothetical protein  26.1 
 
 		 1288 aa  211  7e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37084  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0461  hypothetical protein  24.31 
 
 		 1266 aa  211  9e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00853598  normal  0.775435 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3435  hypothetical protein  24.24 
 
 		 1266 aa  209  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03105  conserved membrane protein, predicted transporter  24.38 
 
 		 1266 aa  208  5e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0723003  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03056  hypothetical protein  24.38 
 
 		 1266 aa  208  5e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.102838  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3682  hypothetical protein  23.62 
 
 		 1265 aa  206  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3277  hypothetical protein  24.73 
 
 		 1266 aa  206  3e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.682788  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0257  hypothetical protein  24.42 
 
 		 1276 aa  205  4e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3541  hypothetical protein  24.73 
 
 		 1266 aa  205  4e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4562  hypothetical protein  24.47 
 
 		 1266 aa  205  5e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0268  hypothetical protein  23.71 
 
 		 1276 aa  204  7e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0461  conserved hypothetical protein  24.31 
 
 		 1266 aa  204  9.999999999999999e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.049997  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3728  hypothetical protein  24.59 
 
 		 1266 aa  202  3e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1719  hypothetical protein  22.37 
 
 		 1273 aa  196  2e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3561  hypothetical protein  23.64 
 
 		 1266 aa  194  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3729  hypothetical protein  23.79 
 
 		 1266 aa  194  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.424475  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1719  hypothetical protein  22.61 
 
 		 1273 aa  194  9e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3560  hypothetical protein  23.64 
 
 		 1266 aa  194  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3632  hypothetical protein  23.79 
 
 		 1266 aa  194  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357405  normal  0.0273308 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3667  hypothetical protein  23.64 
 
 		 1266 aa  194  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2270  membrane protein-like protein  24.32 
 
 		 1304 aa  193  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03680  hypothetical protein  22.88 
 
 		 1266 aa  191  7e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002388  possible exported protein  22.46 
 
 		 1301 aa  185  5.0000000000000004e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.267234  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1988  membrane protein-like protein  24.55 
 
 		 1300 aa  183  2e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3672  hypothetical protein  24.33 
 
 		 1277 aa  182  4e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4277  hypothetical protein  23.3 
 
 		 1269 aa  182  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3830  hypothetical protein  23.74 
 
 		 1284 aa  178  5e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.238588  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0470  hypothetical protein  23.39 
 
 		 1307 aa  177  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.196897  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0403  hypothetical protein  23.7 
 
 		 1305 aa  176  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0978  hypothetical protein  23.63 
 
 		 1271 aa  174  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0488  hypothetical protein  22.17 
 
 		 1287 aa  173  3e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.135683  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1193  hypothetical protein  23.18 
 
 		 1307 aa  171  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.879408  hitchhiker  0.00193389 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0945  hypothetical protein  22.99 
 
 		 1271 aa  170  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2839  hypothetical protein  23.09 
 
 		 1291 aa  169  2.9999999999999998e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0188  hypothetical protein  21.06 
 
 		 1301 aa  157  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0408  hypothetical protein  22.38 
 
 		 1436 aa  153  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0938  hypothetical protein  23.42 
 
 		 1273 aa  153  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0843  hypothetical protein  22.37 
 
 		 1267 aa  152  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.560634  normal  0.938035 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0563  hypothetical protein  22.1 
 
 		 1419 aa  152  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72639  normal  0.280407 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4467  hypothetical protein  22.9 
 
 		 1271 aa  152  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00502079  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2136  hypothetical protein  24.38 
 
 		 1141 aa  150  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0411  hypothetical protein  24.47 
 
 		 1274 aa  150  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.68904  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0471  hypothetical protein  24.6 
 
 		 1286 aa  149  4.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.356031  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0380  hypothetical protein  23.4 
 
 		 1265 aa  146  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58090  hypothetical protein  23.33 
 
 		 1276 aa  146  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4397  hypothetical protein  21.11 
 
 		 1392 aa  146  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.963583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2235  hypothetical protein  26.65 
 
 		 1290 aa  145  5e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3467  hypothetical protein  20.68 
 
 		 1416 aa  142  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0579  hypothetical protein  21.36 
 
 		 1383 aa  142  6e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01889  hypothetical protein  25.21 
 
 		 1306 aa  141  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5090  hypothetical protein  23.61 
 
 		 1275 aa  140  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.340947  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0484  hypothetical protein  20.3 
 
 		 1417 aa  138  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.814446 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3643  hypothetical protein  20.72 
 
 		 1417 aa  135  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4158  hypothetical protein  22.6 
 
 		 1271 aa  135  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12700  hypothetical protein  23.15 
 
 		 1277 aa  134  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4093  hypothetical protein  20.62 
 
 		 1390 aa  133  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3733  hypothetical protein  20.19 
 
 		 1443 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1735  membrane protein-like protein  21.7 
 
 		 1346 aa  129  4.0000000000000003e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>