127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3897 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0366  hypothetical protein  57.08 
 
 		 1381 aa  1525    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4655  hypothetical protein  69.27 
 
 		 1441 aa  1912    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5159  hypothetical protein  51.47 
 
 		 1394 aa  1288    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4656  hypothetical protein  54 
 
 		 1425 aa  1360    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3897  hypothetical protein  100 
 
 		 1379 aa  2728    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.663381 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4018  hypothetical protein  51.49 
 
 		 1418 aa  926    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.938248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4831  hypothetical protein  52.83 
 
 		 1420 aa  1333    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761382  normal  0.626491 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3368  hypothetical protein  53.66 
 
 		 1378 aa  1359    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.48731  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0243  putative transmembrane protein  44.46 
 
 		 1472 aa  1002    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.150673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0849  hypothetical protein  48.14 
 
 		 1384 aa  1204    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3520  putative transmembrane protein  34.92 
 
 		 1450 aa  676    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0199259 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0993  hypothetical protein  32.6 
 
 		 1398 aa  613  9.999999999999999e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.193482 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2894  putative transmembrane protein  31.28 
 
 		 1426 aa  588  1e-166  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2488  hypothetical protein  31.5 
 
 		 1426 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1029  hypothetical protein  30.97 
 
 		 1419 aa  572  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2657  hypothetical protein  31.91 
 
 		 1426 aa  568  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3330  hypothetical protein  30.27 
 
 		 1307 aa  551  1e-155  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000315008 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3970  hypothetical protein  30.75 
 
 		 1430 aa  537  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.231617 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2507  hypothetical protein  29.82 
 
 		 1419 aa  532  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1218  hypothetical protein  31.31 
 
 		 1341 aa  525  1e-147  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0577669  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0728  hypothetical protein  30.32 
 
 		 1428 aa  525  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3288  hypothetical protein  30.6 
 
 		 1397 aa  481  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0218679  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3321  hypothetical protein  30.58 
 
 		 1397 aa  480  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2335  hypothetical protein  30.53 
 
 		 1368 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3332  hypothetical protein  30.58 
 
 		 1397 aa  479  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1298  hypothetical protein  30.32 
 
 		 1397 aa  478  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438344  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0490  hypothetical protein  30.53 
 
 		 1397 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1109  hypothetical protein  30.53 
 
 		 1397 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.823265  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2216  hypothetical protein  30.53 
 
 		 1372 aa  476  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0519007  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0257  hypothetical protein  29.49 
 
 		 1399 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.866424  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0711  hypothetical protein  29.62 
 
 		 1399 aa  473  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.463012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1744  hypothetical protein  26.86 
 
 		 1284 aa  469  9.999999999999999e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0306491 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0741  hypothetical protein  29.49 
 
 		 1399 aa  469  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77418  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2643  hypothetical protein  28.84 
 
 		 1399 aa  470  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.73761 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3829  hypothetical protein  29.28 
 
 		 1399 aa  466  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0634  hypothetical protein  29.62 
 
 		 1398 aa  464  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.913326  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0659  hypothetical protein  29.62 
 
 		 1398 aa  465  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1057  hypothetical protein  27.79 
 
 		 1264 aa  449  1.0000000000000001e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0510  hypothetical protein  27.93 
 
 		 1261 aa  418  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1776  membrane protein-like protein  23.14 
 
 		 1384 aa  332  3e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1493  membrane protein-like protein  22.11 
 
 		 1379 aa  302  3e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2270  membrane protein-like protein  24.53 
 
 		 1304 aa  229  3e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2656  hypothetical protein  22.59 
 
 		 1288 aa  218  5.9999999999999996e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37084  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0488  hypothetical protein  21.3 
 
 		 1287 aa  214  1e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.135683  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0380  hypothetical protein  23.93 
 
 		 1265 aa  207  1e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0461  hypothetical protein  24.25 
 
 		 1266 aa  207  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00853598  normal  0.775435 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03105  conserved membrane protein, predicted transporter  24.25 
 
 		 1266 aa  206  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0723003  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03056  hypothetical protein  24.25 
 
 		 1266 aa  206  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.102838  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3541  hypothetical protein  23.68 
 
 		 1266 aa  207  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3435  hypothetical protein  24.18 
 
 		 1266 aa  205  4e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1719  hypothetical protein  20.04 
 
 		 1273 aa  204  8e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4562  hypothetical protein  23.91 
 
 		 1266 aa  204  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190737  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0461  conserved hypothetical protein  24.04 
 
 		 1266 aa  202  5e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.049997  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3728  hypothetical protein  24.04 
 
 		 1266 aa  201  7.999999999999999e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3277  hypothetical protein  24.27 
 
 		 1266 aa  201  7.999999999999999e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.682788  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0410  hypothetical protein  24.66 
 
 		 1309 aa  199  3e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103346 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2839  hypothetical protein  23.64 
 
 		 1291 aa  198  7e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4467  hypothetical protein  24.07 
 
 		 1271 aa  196  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00502079  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4158  hypothetical protein  23.21 
 
 		 1271 aa  194  7e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4406  hypothetical protein  22.53 
 
 		 1291 aa  194  9e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.213897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0188  hypothetical protein  21.42 
 
 		 1301 aa  194  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03680  hypothetical protein  23.54 
 
 		 1266 aa  191  5.999999999999999e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3561  hypothetical protein  23.04 
 
 		 1266 aa  191  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3682  hypothetical protein  22.43 
 
 		 1265 aa  191  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4397  hypothetical protein  21.36 
 
 		 1392 aa  191  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.963583  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3672  hypothetical protein  24.27 
 
 		 1277 aa  191  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0257  hypothetical protein  22.9 
 
 		 1276 aa  190  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3729  hypothetical protein  23.04 
 
 		 1266 aa  189  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.424475  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002388  possible exported protein  23.95 
 
 		 1301 aa  187  9e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.267234  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3632  hypothetical protein  22.97 
 
 		 1266 aa  187  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357405  normal  0.0273308 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3560  hypothetical protein  22.97 
 
 		 1266 aa  187  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3667  hypothetical protein  22.97 
 
 		 1266 aa  187  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0470  hypothetical protein  22.39 
 
 		 1307 aa  187  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.196897  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1719  hypothetical protein  22.02 
 
 		 1273 aa  186  3e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1193  hypothetical protein  22.29 
 
 		 1307 aa  185  4.0000000000000006e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.879408  hitchhiker  0.00193389 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0938  hypothetical protein  23.13 
 
 		 1273 aa  184  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0403  hypothetical protein  22.34 
 
 		 1305 aa  183  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0978  hypothetical protein  23.2 
 
 		 1271 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0861  membrane protein-like protein  25.44 
 
 		 1273 aa  181  7e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.835961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0408  hypothetical protein  22.38 
 
 		 1436 aa  179  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0843  hypothetical protein  22.74 
 
 		 1267 aa  179  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.560634  normal  0.938035 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0945  hypothetical protein  23.06 
 
 		 1271 aa  179  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4277  hypothetical protein  22.83 
 
 		 1269 aa  179  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1988  membrane protein-like protein  24.3 
 
 		 1300 aa  178  5e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58090  hypothetical protein  23.29 
 
 		 1276 aa  178  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3830  hypothetical protein  23.1 
 
 		 1284 aa  176  2.9999999999999996e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.238588  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4555  putative protease  22.35 
 
 		 1323 aa  175  5.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0563  hypothetical protein  21.5 
 
 		 1419 aa  175  5.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72639  normal  0.280407 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0471  hypothetical protein  26.45 
 
 		 1286 aa  175  5.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.356031  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5090  hypothetical protein  23.81 
 
 		 1275 aa  175  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.340947  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0579  hypothetical protein  20.7 
 
 		 1383 aa  174  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1735  membrane protein-like protein  22.8 
 
 		 1346 aa  172  3e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3467  hypothetical protein  21.66 
 
 		 1416 aa  169  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4093  hypothetical protein  21.53 
 
 		 1390 aa  169  4e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0502  hypothetical protein  20.92 
 
 		 1441 aa  168  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0527  hypothetical protein  20.92 
 
 		 1454 aa  168  8e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3749  hypothetical protein  21.21 
 
 		 1439 aa  167  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3817  hypothetical protein  21.01 
 
 		 1459 aa  167  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0523  hypothetical protein  20.67 
 
 		 1446 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3643  hypothetical protein  21.03 
 
 		 1417 aa  166  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247251  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>