127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0993 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2657  hypothetical protein  43.61 
 
 		 1426 aa  1127    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1029  hypothetical protein  62.5 
 
 		 1419 aa  1728    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3970  hypothetical protein  32.45 
 
 		 1430 aa  643    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.231617 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0993  hypothetical protein  100 
 
 		 1398 aa  2807    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.193482 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2488  hypothetical protein  43.04 
 
 		 1426 aa  1103    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2507  hypothetical protein  32.6 
 
 		 1419 aa  648    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2894  putative transmembrane protein  43.68 
 
 		 1426 aa  1127    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0728  hypothetical protein  32.4 
 
 		 1428 aa  635  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1298  hypothetical protein  33.14 
 
 		 1397 aa  617  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438344  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4656  hypothetical protein  32.54 
 
 		 1425 aa  617  1e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3332  hypothetical protein  32.66 
 
 		 1397 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3288  hypothetical protein  32.66 
 
 		 1397 aa  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0218679  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3321  hypothetical protein  32.66 
 
 		 1397 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0490  hypothetical protein  32.68 
 
 		 1397 aa  610  1e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1109  hypothetical protein  32.68 
 
 		 1397 aa  610  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.823265  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2216  hypothetical protein  32.79 
 
 		 1372 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0519007  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2335  hypothetical protein  32.79 
 
 		 1368 aa  606  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3897  hypothetical protein  32.08 
 
 		 1379 aa  602  1e-170  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.663381 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4831  hypothetical protein  32.56 
 
 		 1420 aa  602  1e-170  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761382  normal  0.626491 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5159  hypothetical protein  32.97 
 
 		 1394 aa  603  1e-170  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0849  hypothetical protein  32.42 
 
 		 1384 aa  598  1e-169  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3829  hypothetical protein  31.85 
 
 		 1399 aa  593  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0711  hypothetical protein  31.92 
 
 		 1399 aa  592  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.463012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0257  hypothetical protein  31.78 
 
 		 1399 aa  588  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.866424  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0741  hypothetical protein  31.78 
 
 		 1399 aa  589  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77418  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0659  hypothetical protein  31.77 
 
 		 1398 aa  587  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4655  hypothetical protein  31.09 
 
 		 1441 aa  580  1e-164  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0634  hypothetical protein  31.67 
 
 		 1398 aa  583  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.913326  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0366  hypothetical protein  30.79 
 
 		 1381 aa  576  1.0000000000000001e-162  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3368  hypothetical protein  32.16 
 
 		 1378 aa  569  1e-160  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.48731  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2643  hypothetical protein  31.34 
 
 		 1399 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.73761 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0243  putative transmembrane protein  30.77 
 
 		 1472 aa  522  1e-146  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.150673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3330  hypothetical protein  28.63 
 
 		 1307 aa  461  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000315008 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1218  hypothetical protein  30.34 
 
 		 1341 aa  461  9.999999999999999e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0577669  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3520  putative transmembrane protein  29.17 
 
 		 1450 aa  459  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0199259 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1776  membrane protein-like protein  24.18 
 
 		 1384 aa  434  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1744  hypothetical protein  26.64 
 
 		 1284 aa  422  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0306491 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1493  membrane protein-like protein  24.41 
 
 		 1379 aa  423  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1057  hypothetical protein  27.54 
 
 		 1264 aa  401  9.999999999999999e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0510  hypothetical protein  27.87 
 
 		 1261 aa  399  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4018  hypothetical protein  30.8 
 
 		 1418 aa  364  7.0000000000000005e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.938248  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1719  hypothetical protein  20.82 
 
 		 1273 aa  226  4e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1719  hypothetical protein  20.98 
 
 		 1273 aa  224  6e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0488  hypothetical protein  21.65 
 
 		 1287 aa  208  5e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.135683  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0268  hypothetical protein  23.31 
 
 		 1276 aa  202  5e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03680  hypothetical protein  22.65 
 
 		 1266 aa  201  9e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0257  hypothetical protein  22.99 
 
 		 1276 aa  200  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002388  possible exported protein  23.13 
 
 		 1301 aa  196  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.267234  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2270  membrane protein-like protein  24.81 
 
 		 1304 aa  193  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2656  hypothetical protein  24.54 
 
 		 1288 aa  188  6e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37084  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4277  hypothetical protein  23.23 
 
 		 1269 aa  187  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3672  hypothetical protein  24.73 
 
 		 1277 aa  184  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2136  hypothetical protein  25.75 
 
 		 1141 aa  182  2.9999999999999997e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2839  hypothetical protein  22.24 
 
 		 1291 aa  179  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4397  hypothetical protein  20.42 
 
 		 1392 aa  179  4e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.963583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0408  hypothetical protein  22.03 
 
 		 1436 aa  177  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3682  hypothetical protein  21.9 
 
 		 1265 aa  175  3.9999999999999995e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1988  membrane protein-like protein  24.61 
 
 		 1300 aa  175  5.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3830  hypothetical protein  22.38 
 
 		 1284 aa  175  5.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.238588  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4406  hypothetical protein  22.66 
 
 		 1291 aa  175  6.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.213897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0470  hypothetical protein  22.03 
 
 		 1307 aa  170  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.196897  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0403  hypothetical protein  21.96 
 
 		 1305 aa  168  6.9999999999999995e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3435  hypothetical protein  22.72 
 
 		 1266 aa  168  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0945  hypothetical protein  22.89 
 
 		 1271 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0461  hypothetical protein  22.61 
 
 		 1266 aa  166  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00853598  normal  0.775435 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3277  hypothetical protein  22.72 
 
 		 1266 aa  166  3e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.682788  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3541  hypothetical protein  22.5 
 
 		 1266 aa  165  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0938  hypothetical protein  22.99 
 
 		 1273 aa  165  6e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349009  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03105  conserved membrane protein, predicted transporter  22.5 
 
 		 1266 aa  164  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0723003  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03056  hypothetical protein  22.5 
 
 		 1266 aa  164  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.102838  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1193  hypothetical protein  21.82 
 
 		 1307 aa  162  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.879408  hitchhiker  0.00193389 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0461  conserved hypothetical protein  22.66 
 
 		 1266 aa  162  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.049997  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0978  hypothetical protein  22.72 
 
 		 1271 aa  162  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3728  hypothetical protein  22.66 
 
 		 1266 aa  161  7e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1735  membrane protein-like protein  23.77 
 
 		 1346 aa  159  3e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3729  hypothetical protein  22.83 
 
 		 1266 aa  159  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.424475  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3667  hypothetical protein  22.83 
 
 		 1266 aa  159  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58090  hypothetical protein  22.76 
 
 		 1276 aa  159  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3643  hypothetical protein  21.28 
 
 		 1417 aa  159  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3560  hypothetical protein  22.83 
 
 		 1266 aa  159  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3561  hypothetical protein  22.78 
 
 		 1266 aa  159  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4093  hypothetical protein  21.27 
 
 		 1390 aa  158  6e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5090  hypothetical protein  23.03 
 
 		 1275 aa  158  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.340947  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4562  hypothetical protein  22.39 
 
 		 1266 aa  158  7e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0843  hypothetical protein  22.47 
 
 		 1267 aa  157  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.560634  normal  0.938035 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0188  hypothetical protein  21.65 
 
 		 1301 aa  157  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2235  hypothetical protein  25 
 
 		 1290 aa  156  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3632  hypothetical protein  22.72 
 
 		 1266 aa  156  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357405  normal  0.0273308 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3467  hypothetical protein  21.16 
 
 		 1416 aa  156  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0484  hypothetical protein  20.78 
 
 		 1417 aa  155  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.814446 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4158  hypothetical protein  22.26 
 
 		 1271 aa  154  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3733  hypothetical protein  20.33 
 
 		 1443 aa  154  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0563  hypothetical protein  20.27 
 
 		 1419 aa  147  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72639  normal  0.280407 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3817  hypothetical protein  21.03 
 
 		 1459 aa  142  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0579  hypothetical protein  19.86 
 
 		 1383 aa  142  6e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0502  hypothetical protein  20.72 
 
 		 1441 aa  142  6e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0523  hypothetical protein  20.59 
 
 		 1446 aa  141  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0527  hypothetical protein  20.47 
 
 		 1454 aa  140  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4467  hypothetical protein  22.92 
 
 		 1271 aa  139  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00502079  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0380  hypothetical protein  23.82 
 
 		 1265 aa  135  5e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>