129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_3288 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc2657  hypothetical protein  35.19 
 
 
1426 aa  687    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2335  hypothetical protein  99.49 
 
 
1368 aa  2696    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1029  hypothetical protein  34.25 
 
 
1419 aa  675    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3332  hypothetical protein  99.71 
 
 
1397 aa  2763    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3829  hypothetical protein  74.55 
 
 
1399 aa  2083    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1298  hypothetical protein  96.06 
 
 
1397 aa  2606    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438344  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3970  hypothetical protein  61.52 
 
 
1430 aa  1670    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.231617 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0257  hypothetical protein  74.48 
 
 
1399 aa  2082    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.866424  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0634  hypothetical protein  73.82 
 
 
1398 aa  2058    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.913326  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0741  hypothetical protein  74.55 
 
 
1399 aa  2084    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77418  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0490  hypothetical protein  99.57 
 
 
1397 aa  2757    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1109  hypothetical protein  99.57 
 
 
1397 aa  2757    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.823265  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3288  hypothetical protein  100 
 
 
1397 aa  2766    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0218679  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3321  hypothetical protein  99.71 
 
 
1397 aa  2764    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2216  hypothetical protein  99.49 
 
 
1372 aa  2703    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0519007  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2643  hypothetical protein  74.24 
 
 
1399 aa  2066    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.73761 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0711  hypothetical protein  74.62 
 
 
1399 aa  2083    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.463012  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0659  hypothetical protein  73.67 
 
 
1398 aa  2060    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2488  hypothetical protein  33.55 
 
 
1426 aa  671    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297377  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2507  hypothetical protein  58.58 
 
 
1419 aa  1640    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380036  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0728  hypothetical protein  61.4 
 
 
1428 aa  1661    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2894  putative transmembrane protein  33.86 
 
 
1426 aa  680    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0993  hypothetical protein  32.73 
 
 
1398 aa  628  1e-178  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.193482 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0366  hypothetical protein  31.45 
 
 
1381 aa  538  1e-151  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4831  hypothetical protein  32.17 
 
 
1420 aa  511  1e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761382  normal  0.626491 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0849  hypothetical protein  29.71 
 
 
1384 aa  504  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3897  hypothetical protein  30.12 
 
 
1379 aa  496  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.663381 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3368  hypothetical protein  31.8 
 
 
1378 aa  490  1e-137  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.48731  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4656  hypothetical protein  31.37 
 
 
1425 aa  490  1e-137  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4655  hypothetical protein  29.9 
 
 
1441 aa  474  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431718  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0243  putative transmembrane protein  31.27 
 
 
1472 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.150673  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1776  membrane protein-like protein  25.67 
 
 
1384 aa  433  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3330  hypothetical protein  27.96 
 
 
1307 aa  426  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000315008 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1218  hypothetical protein  29.32 
 
 
1341 aa  426  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0577669  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1744  hypothetical protein  26.39 
 
 
1284 aa  419  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0306491 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5159  hypothetical protein  33.54 
 
 
1394 aa  407  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3520  putative transmembrane protein  28.77 
 
 
1450 aa  393  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0199259 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1057  hypothetical protein  26.1 
 
 
1264 aa  374  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1493  membrane protein-like protein  24.44 
 
 
1379 aa  369  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0510  hypothetical protein  26.71 
 
 
1261 aa  335  3e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4018  hypothetical protein  29.61 
 
 
1418 aa  270  1e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.938248  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2270  membrane protein-like protein  26.7 
 
 
1304 aa  219  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1719  hypothetical protein  21.08 
 
 
1273 aa  206  3e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1719  hypothetical protein  22.42 
 
 
1273 aa  196  3e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0257  hypothetical protein  23.17 
 
 
1276 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3672  hypothetical protein  23.76 
 
 
1277 aa  187  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03680  hypothetical protein  21.39 
 
 
1266 aa  183  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4397  hypothetical protein  21.65 
 
 
1392 aa  181  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.963583  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2839  hypothetical protein  24.63 
 
 
1291 aa  176  2.9999999999999996e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3830  hypothetical protein  23.34 
 
 
1284 aa  174  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.238588  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0408  hypothetical protein  24.04 
 
 
1436 aa  171  6e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1988  membrane protein-like protein  26.37 
 
 
1300 aa  171  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2656  hypothetical protein  23.97 
 
 
1288 aa  169  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37084  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0410  hypothetical protein  25.51 
 
 
1309 aa  168  5e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.103346 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002388  possible exported protein  23.46 
 
 
1301 aa  165  6e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.267234  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0488  hypothetical protein  23.26 
 
 
1287 aa  162  3e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.135683  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0188  hypothetical protein  20.67 
 
 
1301 aa  162  6e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3733  hypothetical protein  23.02 
 
 
1443 aa  161  7e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4406  hypothetical protein  22.43 
 
 
1291 aa  158  8e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.213897  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0268  hypothetical protein  21.97 
 
 
1276 aa  157  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3749  hypothetical protein  22.13 
 
 
1439 aa  157  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0502  hypothetical protein  22.84 
 
 
1441 aa  153  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3643  hypothetical protein  21.92 
 
 
1417 aa  151  8e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247251  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3817  hypothetical protein  22.73 
 
 
1459 aa  150  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0470  hypothetical protein  21.54 
 
 
1307 aa  150  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.196897  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0563  hypothetical protein  21.89 
 
 
1419 aa  149  5e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72639  normal  0.280407 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0523  hypothetical protein  22.5 
 
 
1446 aa  148  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0527  hypothetical protein  22.39 
 
 
1454 aa  147  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3467  hypothetical protein  21.72 
 
 
1416 aa  147  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0403  hypothetical protein  21.33 
 
 
1305 aa  147  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1193  hypothetical protein  21.47 
 
 
1307 aa  145  4e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.879408  hitchhiker  0.00193389 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2136  hypothetical protein  25.98 
 
 
1141 aa  143  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0380  hypothetical protein  24.53 
 
 
1265 aa  142  3.9999999999999997e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4158  hypothetical protein  23.63 
 
 
1271 aa  142  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0461  hypothetical protein  23.18 
 
 
1266 aa  142  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00853598  normal  0.775435 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3541  hypothetical protein  22.38 
 
 
1266 aa  142  6e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3435  hypothetical protein  23.06 
 
 
1266 aa  140  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03105  conserved membrane protein, predicted transporter  22.84 
 
 
1266 aa  139  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0723003  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4093  hypothetical protein  21.27 
 
 
1390 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03056  hypothetical protein  22.84 
 
 
1266 aa  139  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.102838  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0461  conserved hypothetical protein  22.91 
 
 
1266 aa  137  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.049997  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3728  hypothetical protein  23.24 
 
 
1266 aa  137  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1735  membrane protein-like protein  23.57 
 
 
1346 aa  136  3e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3329  hypothetical protein  22.77 
 
 
1419 aa  135  5e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2235  hypothetical protein  23.62 
 
 
1290 aa  133  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01889  hypothetical protein  25.24 
 
 
1306 aa  133  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3632  hypothetical protein  23.76 
 
 
1266 aa  132  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357405  normal  0.0273308 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3561  hypothetical protein  23.76 
 
 
1266 aa  132  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4277  hypothetical protein  23.79 
 
 
1269 aa  132  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3729  hypothetical protein  23.76 
 
 
1266 aa  132  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.424475  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3667  hypothetical protein  23.76 
 
 
1266 aa  132  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3560  hypothetical protein  23.76 
 
 
1266 aa  132  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3682  hypothetical protein  22.32 
 
 
1265 aa  131  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00269  putative protease  21.87 
 
 
1331 aa  127  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4555  putative protease  20.59 
 
 
1323 aa  125  6e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4467  hypothetical protein  23.31 
 
 
1271 aa  122  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00502079  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0861  membrane protein-like protein  22.88 
 
 
1273 aa  122  6e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.835961  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58090  hypothetical protein  22.72 
 
 
1276 aa  121  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0579  hypothetical protein  24.18 
 
 
1383 aa  121  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5090  hypothetical protein  23.04 
 
 
1275 aa  120  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.340947  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>