123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4158 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0938  hypothetical protein  64.22 
 
 		 1273 aa  1628    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349009  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4467  hypothetical protein  91.58 
 
 		 1271 aa  2356    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00502079  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4158  hypothetical protein  100 
 
 		 1271 aa  2547    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0843  hypothetical protein  68.82 
 
 		 1267 aa  1823    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.560634  normal  0.938035 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58090  hypothetical protein  53.93 
 
 		 1276 aa  1284    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0861  membrane protein-like protein  54.9 
 
 		 1273 aa  1367    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.835961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0978  hypothetical protein  64.22 
 
 		 1271 aa  1627    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5090  hypothetical protein  53.53 
 
 		 1275 aa  1267    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.340947  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0945  hypothetical protein  63.99 
 
 		 1271 aa  1624    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4277  hypothetical protein  63.51 
 
 		 1269 aa  1647    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12700  hypothetical protein  51.16 
 
 		 1277 aa  1253    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3187  exonuclease VII, small subunit  24.71 
 
 		 1380 aa  360  9.999999999999999e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1942  membrane protein-like protein  24.87 
 
 		 1272 aa  322  3.9999999999999996e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.307785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2235  hypothetical protein  25.68 
 
 		 1290 aa  302  3e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2723  membrane protein-like  25.72 
 
 		 1236 aa  299  2e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.439608  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3330  hypothetical protein  24.65 
 
 		 1307 aa  275  4.0000000000000004e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000315008 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1719  hypothetical protein  22.73 
 
 		 1273 aa  265  4.999999999999999e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1719  hypothetical protein  22.74 
 
 		 1273 aa  263  1e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2656  hypothetical protein  22.83 
 
 		 1288 aa  251  8e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37084  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3830  hypothetical protein  22.91 
 
 		 1284 aa  250  1e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.238588  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0257  hypothetical protein  22.87 
 
 		 1276 aa  249  3e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0268  hypothetical protein  22.77 
 
 		 1276 aa  248  4e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1744  hypothetical protein  22.27 
 
 		 1284 aa  245  5e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0306491 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4406  hypothetical protein  22.64 
 
 		 1291 aa  244  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.213897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0410  hypothetical protein  25.61 
 
 		 1309 aa  239  3e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103346 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0579  hypothetical protein  21.99 
 
 		 1383 aa  239  3e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3682  hypothetical protein  23.12 
 
 		 1265 aa  234  9e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0510  hypothetical protein  23.4 
 
 		 1261 aa  231  7e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3672  hypothetical protein  23.15 
 
 		 1277 aa  231  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1193  hypothetical protein  21.74 
 
 		 1307 aa  229  3e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.879408  hitchhiker  0.00193389 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0470  hypothetical protein  22.36 
 
 		 1307 aa  228  4e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.196897  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4555  putative protease  22.6 
 
 		 1323 aa  226  1e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0403  hypothetical protein  22.34 
 
 		 1305 aa  227  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3729  hypothetical protein  23.19 
 
 		 1266 aa  221  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.424475  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3560  hypothetical protein  23.19 
 
 		 1266 aa  221  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3667  hypothetical protein  23.19 
 
 		 1266 aa  221  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2270  membrane protein-like protein  23.76 
 
 		 1304 aa  221  7e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4397  hypothetical protein  21.77 
 
 		 1392 aa  221  8.999999999999998e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.963583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3632  hypothetical protein  23.19 
 
 		 1266 aa  221  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357405  normal  0.0273308 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3561  hypothetical protein  23.15 
 
 		 1266 aa  221  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002388  possible exported protein  20.39 
 
 		 1301 aa  217  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.267234  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03680  hypothetical protein  20.16 
 
 		 1266 aa  214  7e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0849  hypothetical protein  23.8 
 
 		 1384 aa  214  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3733  hypothetical protein  21.44 
 
 		 1443 aa  213  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0380  hypothetical protein  23.44 
 
 		 1265 aa  211  6e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1218  hypothetical protein  22.82 
 
 		 1341 aa  207  9e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0577669  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3541  hypothetical protein  22.64 
 
 		 1266 aa  206  3e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1057  hypothetical protein  22.21 
 
 		 1264 aa  205  4e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3728  hypothetical protein  22.92 
 
 		 1266 aa  205  4e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0188  hypothetical protein  22.04 
 
 		 1301 aa  205  5e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0461  conserved hypothetical protein  23.1 
 
 		 1266 aa  204  7e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.049997  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3368  hypothetical protein  23.09 
 
 		 1378 aa  204  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.48731  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03105  conserved membrane protein, predicted transporter  22.5 
 
 		 1266 aa  202  3e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0723003  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03056  hypothetical protein  22.5 
 
 		 1266 aa  202  3e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.102838  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3467  hypothetical protein  23.62 
 
 		 1416 aa  202  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3435  hypothetical protein  22.5 
 
 		 1266 aa  201  6e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3277  hypothetical protein  22.71 
 
 		 1266 aa  201  6e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.682788  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0488  hypothetical protein  20.83 
 
 		 1287 aa  201  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.135683  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1988  membrane protein-like protein  25.24 
 
 		 1300 aa  200  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0461  hypothetical protein  22.43 
 
 		 1266 aa  199  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00853598  normal  0.775435 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4562  hypothetical protein  22.48 
 
 		 1266 aa  198  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2839  hypothetical protein  21.33 
 
 		 1291 aa  197  9e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4093  hypothetical protein  23.75 
 
 		 1390 aa  197  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3897  hypothetical protein  23.29 
 
 		 1379 aa  192  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.663381 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4831  hypothetical protein  23.86 
 
 		 1420 aa  192  4e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761382  normal  0.626491 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0484  hypothetical protein  23.38 
 
 		 1417 aa  191  9e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.814446 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4656  hypothetical protein  22.75 
 
 		 1425 aa  189  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3520  putative transmembrane protein  23.35 
 
 		 1450 aa  184  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0199259 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0408  hypothetical protein  22.88 
 
 		 1436 aa  183  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3329  hypothetical protein  22.16 
 
 		 1419 aa  181  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5159  hypothetical protein  24.39 
 
 		 1394 aa  178  6e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0512  hypothetical protein  21.35 
 
 		 1153 aa  177  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.350168  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0563  hypothetical protein  22.66 
 
 		 1419 aa  175  5e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72639  normal  0.280407 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1645  hypothetical protein  21.23 
 
 		 1153 aa  175  5.999999999999999e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000756943  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3817  hypothetical protein  22.06 
 
 		 1459 aa  174  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0527  hypothetical protein  21.94 
 
 		 1454 aa  173  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0411  hypothetical protein  23.1 
 
 		 1274 aa  173  2e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.68904  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0366  hypothetical protein  23.22 
 
 		 1381 aa  172  4e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0523  hypothetical protein  21.66 
 
 		 1446 aa  170  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0502  hypothetical protein  21.68 
 
 		 1441 aa  168  5e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0243  putative transmembrane protein  23.77 
 
 		 1472 aa  165  4.0000000000000004e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.150673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1127  membrane protein-like protein  21.27 
 
 		 1294 aa  165  7e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.334782  normal  0.712644 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2899  hypothetical protein  23.92 
 
 		 1283 aa  160  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2136  hypothetical protein  25 
 
 		 1141 aa  159  3e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00269  putative protease  22.3 
 
 		 1331 aa  158  8e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0471  hypothetical protein  23.62 
 
 		 1286 aa  157  1e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.356031  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4655  hypothetical protein  23.82 
 
 		 1441 aa  150  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0993  hypothetical protein  21.97 
 
 		 1398 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.193482 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1029  hypothetical protein  22.59 
 
 		 1419 aa  145  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4018  hypothetical protein  22.89 
 
 		 1418 aa  144  9e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.938248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01889  hypothetical protein  24.63 
 
 		 1306 aa  142  3.9999999999999997e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0728  hypothetical protein  21.69 
 
 		 1428 aa  139  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2894  putative transmembrane protein  21.48 
 
 		 1426 aa  138  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3970  hypothetical protein  21.94 
 
 		 1430 aa  138  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.231617 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2488  hypothetical protein  22.22 
 
 		 1426 aa  137  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2643  hypothetical protein  23.24 
 
 		 1399 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.73761 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2657  hypothetical protein  22.6 
 
 		 1426 aa  135  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3332  hypothetical protein  23.51 
 
 		 1397 aa  133  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0490  hypothetical protein  23.48 
 
 		 1397 aa  133  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3321  hypothetical protein  23.51 
 
 		 1397 aa  133  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>