127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2507 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2488  hypothetical protein  31.5 
 
 
1426 aa  649    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297377  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2657  hypothetical protein  32.65 
 
 
1426 aa  652    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2335  hypothetical protein  59.06 
 
 
1368 aa  1585    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3332  hypothetical protein  58.5 
 
 
1397 aa  1602    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3829  hypothetical protein  56.4 
 
 
1399 aa  1561    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1298  hypothetical protein  58.82 
 
 
1397 aa  1610    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438344  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3970  hypothetical protein  69.3 
 
 
1430 aa  1987    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.231617 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0993  hypothetical protein  32.85 
 
 
1398 aa  639    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.193482 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0257  hypothetical protein  56.01 
 
 
1399 aa  1555    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.866424  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0634  hypothetical protein  55.95 
 
 
1398 aa  1558    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.913326  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0741  hypothetical protein  56.08 
 
 
1399 aa  1557    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77418  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0490  hypothetical protein  58.5 
 
 
1397 aa  1598    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1109  hypothetical protein  58.5 
 
 
1397 aa  1598    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.823265  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3288  hypothetical protein  58.78 
 
 
1397 aa  1604    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0218679  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3321  hypothetical protein  58.5 
 
 
1397 aa  1601    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2216  hypothetical protein  59.06 
 
 
1372 aa  1585    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0519007  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2643  hypothetical protein  57.25 
 
 
1399 aa  1582    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.73761 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0711  hypothetical protein  56.22 
 
 
1399 aa  1565    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.463012  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0659  hypothetical protein  55.95 
 
 
1398 aa  1556    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2507  hypothetical protein  100 
 
 
1419 aa  2862    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380036  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0728  hypothetical protein  69.71 
 
 
1428 aa  1992    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2894  putative transmembrane protein  31.66 
 
 
1426 aa  652    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1029  hypothetical protein  30.69 
 
 
1419 aa  613  1e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0366  hypothetical protein  30.24 
 
 
1381 aa  568  1e-160  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4831  hypothetical protein  30.72 
 
 
1420 aa  547  1e-154  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761382  normal  0.626491 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0849  hypothetical protein  28.73 
 
 
1384 aa  526  1e-148  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4656  hypothetical protein  29.93 
 
 
1425 aa  525  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3897  hypothetical protein  29.75 
 
 
1379 aa  523  1e-146  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.663381 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3368  hypothetical protein  29.64 
 
 
1378 aa  513  1e-144  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.48731  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4655  hypothetical protein  28.38 
 
 
1441 aa  496  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431718  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3330  hypothetical protein  27.11 
 
 
1307 aa  488  1e-136  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000315008 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1218  hypothetical protein  27.9 
 
 
1341 aa  456  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0577669  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1744  hypothetical protein  26.33 
 
 
1284 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0306491 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0243  putative transmembrane protein  28.82 
 
 
1472 aa  443  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.150673  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1776  membrane protein-like protein  24.89 
 
 
1384 aa  429  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1057  hypothetical protein  26.36 
 
 
1264 aa  409  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5159  hypothetical protein  31.29 
 
 
1394 aa  408  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3520  putative transmembrane protein  28.01 
 
 
1450 aa  401  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0199259 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1493  membrane protein-like protein  24.32 
 
 
1379 aa  388  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0510  hypothetical protein  25.77 
 
 
1261 aa  365  3e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4018  hypothetical protein  27.85 
 
 
1418 aa  290  1e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.938248  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1719  hypothetical protein  21.24 
 
 
1273 aa  230  2e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1719  hypothetical protein  21.08 
 
 
1273 aa  226  3e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2270  membrane protein-like protein  23.53 
 
 
1304 aa  215  4.9999999999999996e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2136  hypothetical protein  25 
 
 
1141 aa  181  1e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2656  hypothetical protein  23.76 
 
 
1288 aa  177  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37084  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3672  hypothetical protein  23.17 
 
 
1277 aa  167  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4406  hypothetical protein  22.17 
 
 
1291 aa  167  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.213897  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0488  hypothetical protein  21.76 
 
 
1287 aa  164  9e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.135683  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0257  hypothetical protein  23.38 
 
 
1276 aa  162  5e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1988  membrane protein-like protein  24.27 
 
 
1300 aa  160  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0188  hypothetical protein  21.29 
 
 
1301 aa  159  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3682  hypothetical protein  22.19 
 
 
1265 aa  155  7e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0563  hypothetical protein  21.03 
 
 
1419 aa  155  7e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72639  normal  0.280407 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0408  hypothetical protein  23.43 
 
 
1436 aa  154  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3729  hypothetical protein  23.06 
 
 
1266 aa  154  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.424475  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0461  hypothetical protein  22.46 
 
 
1266 aa  154  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00853598  normal  0.775435 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3561  hypothetical protein  23.06 
 
 
1266 aa  154  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3632  hypothetical protein  23.06 
 
 
1266 aa  154  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357405  normal  0.0273308 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3560  hypothetical protein  23.06 
 
 
1266 aa  153  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3667  hypothetical protein  23.06 
 
 
1266 aa  153  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0268  hypothetical protein  22.57 
 
 
1276 aa  152  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1735  membrane protein-like protein  21.64 
 
 
1346 aa  150  2.0000000000000003e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0461  conserved hypothetical protein  22.46 
 
 
1266 aa  149  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.049997  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3728  hypothetical protein  22.46 
 
 
1266 aa  149  5e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1193  hypothetical protein  21.11 
 
 
1307 aa  148  9e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.879408  hitchhiker  0.00193389 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03680  hypothetical protein  21.19 
 
 
1266 aa  146  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2839  hypothetical protein  21.96 
 
 
1291 aa  142  3.9999999999999997e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0502  hypothetical protein  22.61 
 
 
1441 aa  139  4e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0579  hypothetical protein  21.99 
 
 
1383 aa  139  6.0000000000000005e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3830  hypothetical protein  22.21 
 
 
1284 aa  138  9e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.238588  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3435  hypothetical protein  22.67 
 
 
1266 aa  137  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4277  hypothetical protein  21.44 
 
 
1269 aa  137  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1127  membrane protein-like protein  21.03 
 
 
1294 aa  137  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.334782  normal  0.712644 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3817  hypothetical protein  21.9 
 
 
1459 aa  136  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0471  hypothetical protein  23.6 
 
 
1286 aa  135  3.9999999999999996e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.356031  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0527  hypothetical protein  21.79 
 
 
1454 aa  135  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0523  hypothetical protein  22.03 
 
 
1446 aa  135  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0411  hypothetical protein  23.08 
 
 
1274 aa  134  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.68904  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002388  possible exported protein  21.12 
 
 
1301 aa  133  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.267234  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0861  membrane protein-like protein  21.81 
 
 
1273 aa  131  9.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.835961  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0380  hypothetical protein  22.54 
 
 
1265 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4158  hypothetical protein  21.2 
 
 
1271 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3643  hypothetical protein  21.23 
 
 
1417 aa  129  5e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247251  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3187  exonuclease VII, small subunit  20.65 
 
 
1380 aa  128  8.000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3467  hypothetical protein  21.36 
 
 
1416 aa  128  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4093  hypothetical protein  21.26 
 
 
1390 aa  127  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2899  hypothetical protein  22.71 
 
 
1283 aa  126  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0484  hypothetical protein  21.46 
 
 
1417 aa  126  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.814446 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3749  hypothetical protein  20.78 
 
 
1439 aa  126  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01889  hypothetical protein  23.13 
 
 
1306 aa  125  6e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4467  hypothetical protein  21.33 
 
 
1271 aa  124  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00502079  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1505  membrane protein-like  21.07 
 
 
1283 aa  122  4.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000453243  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0472  membrane protein  24.63 
 
 
1515 aa  118  8.999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.50538 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3733  hypothetical protein  25.39 
 
 
1443 aa  115  6e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0410  hypothetical protein  24.58 
 
 
1309 aa  112  5e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.103346 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4555  putative protease  21.52 
 
 
1323 aa  111  9.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4397  hypothetical protein  23.86 
 
 
1392 aa  110  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.963583  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1645  hypothetical protein  20.95 
 
 
1153 aa  109  4e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000756943  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0705  membrane protein-like protein  21.9 
 
 
1224 aa  108  7e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.113545  hitchhiker  0.00000969857 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>