123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0243 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0366  hypothetical protein  44.71 
 
 		 1381 aa  1048    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4655  hypothetical protein  42.46 
 
 		 1441 aa  1004    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4656  hypothetical protein  43.4 
 
 		 1425 aa  960    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3897  hypothetical protein  44.67 
 
 		 1379 aa  1048    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.663381 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4831  hypothetical protein  44.41 
 
 		 1420 aa  987    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761382  normal  0.626491 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0243  putative transmembrane protein  100 
 
 		 1472 aa  2848    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.150673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5159  hypothetical protein  44.22 
 
 		 1394 aa  963    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0849  hypothetical protein  41.46 
 
 		 1384 aa  926    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3520  putative transmembrane protein  38.37 
 
 		 1450 aa  732    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0199259 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3368  hypothetical protein  44.56 
 
 		 1378 aa  1013    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.48731  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4018  hypothetical protein  40.88 
 
 		 1418 aa  617  1e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.938248  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2488  hypothetical protein  31.92 
 
 		 1426 aa  566  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2894  putative transmembrane protein  31.85 
 
 		 1426 aa  563  1e-158  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0993  hypothetical protein  31.13 
 
 		 1398 aa  557  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.193482 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2657  hypothetical protein  32.23 
 
 		 1426 aa  550  1e-155  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1029  hypothetical protein  31 
 
 		 1419 aa  526  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3330  hypothetical protein  30.72 
 
 		 1307 aa  488  1e-136  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000315008 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3970  hypothetical protein  29.28 
 
 		 1430 aa  481  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.231617 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0728  hypothetical protein  29.36 
 
 		 1428 aa  474  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2507  hypothetical protein  29 
 
 		 1419 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2643  hypothetical protein  30.65 
 
 		 1399 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.73761 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3332  hypothetical protein  31.51 
 
 		 1397 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3288  hypothetical protein  31.46 
 
 		 1397 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0218679  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3321  hypothetical protein  31.44 
 
 		 1397 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2335  hypothetical protein  31.36 
 
 		 1368 aa  460  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1298  hypothetical protein  31.2 
 
 		 1397 aa  457  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438344  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0490  hypothetical protein  31.64 
 
 		 1397 aa  459  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1109  hypothetical protein  31.64 
 
 		 1397 aa  459  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.823265  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2216  hypothetical protein  31.36 
 
 		 1372 aa  460  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0519007  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0659  hypothetical protein  30.28 
 
 		 1398 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3829  hypothetical protein  29.37 
 
 		 1399 aa  453  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1218  hypothetical protein  31.47 
 
 		 1341 aa  449  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0577669  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0634  hypothetical protein  29.87 
 
 		 1398 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.913326  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0257  hypothetical protein  29.74 
 
 		 1399 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.866424  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0741  hypothetical protein  29.74 
 
 		 1399 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77418  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0711  hypothetical protein  29.6 
 
 		 1399 aa  447  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.463012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1744  hypothetical protein  27.05 
 
 		 1284 aa  437  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0306491 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0510  hypothetical protein  29.54 
 
 		 1261 aa  385  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1057  hypothetical protein  26.87 
 
 		 1264 aa  383  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1776  membrane protein-like protein  24.6 
 
 		 1384 aa  351  7e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1493  membrane protein-like protein  22.91 
 
 		 1379 aa  338  5e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03680  hypothetical protein  23.85 
 
 		 1266 aa  209  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002388  possible exported protein  23.9 
 
 		 1301 aa  207  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.267234  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0488  hypothetical protein  22.83 
 
 		 1287 aa  206  4e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.135683  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2839  hypothetical protein  23.87 
 
 		 1291 aa  195  5e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1719  hypothetical protein  20.01 
 
 		 1273 aa  181  1e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4158  hypothetical protein  24.28 
 
 		 1271 aa  181  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4277  hypothetical protein  24.86 
 
 		 1269 aa  179  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1988  membrane protein-like protein  25.4 
 
 		 1300 aa  175  5e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3733  hypothetical protein  22.3 
 
 		 1443 aa  175  6.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0563  hypothetical protein  23.11 
 
 		 1419 aa  174  9e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72639  normal  0.280407 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4406  hypothetical protein  22.68 
 
 		 1291 aa  174  9e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.213897  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1719  hypothetical protein  19.51 
 
 		 1273 aa  173  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0380  hypothetical protein  25.04 
 
 		 1265 aa  173  3e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3643  hypothetical protein  23.31 
 
 		 1417 aa  171  8e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247251  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4467  hypothetical protein  24.65 
 
 		 1271 aa  169  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00502079  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4093  hypothetical protein  23.21 
 
 		 1390 aa  167  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3467  hypothetical protein  23.02 
 
 		 1416 aa  167  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3632  hypothetical protein  23.38 
 
 		 1266 aa  166  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357405  normal  0.0273308 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3560  hypothetical protein  23.29 
 
 		 1266 aa  166  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3667  hypothetical protein  23.29 
 
 		 1266 aa  166  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3561  hypothetical protein  23.2 
 
 		 1266 aa  165  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3729  hypothetical protein  23.29 
 
 		 1266 aa  165  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.424475  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0579  hypothetical protein  22.73 
 
 		 1383 aa  165  7e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0257  hypothetical protein  22.16 
 
 		 1276 aa  165  7e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0188  hypothetical protein  22.06 
 
 		 1301 aa  164  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0945  hypothetical protein  24.01 
 
 		 1271 aa  162  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3682  hypothetical protein  23.65 
 
 		 1265 aa  161  9e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0938  hypothetical protein  24.07 
 
 		 1273 aa  160  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0978  hypothetical protein  24.13 
 
 		 1271 aa  161  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0843  hypothetical protein  22.69 
 
 		 1267 aa  159  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.560634  normal  0.938035 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0484  hypothetical protein  22.54 
 
 		 1417 aa  159  3e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.814446 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0408  hypothetical protein  22.47 
 
 		 1436 aa  158  8e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3817  hypothetical protein  23.09 
 
 		 1459 aa  157  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1735  membrane protein-like protein  24.66 
 
 		 1346 aa  157  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4397  hypothetical protein  21.03 
 
 		 1392 aa  157  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.963583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0527  hypothetical protein  23.09 
 
 		 1454 aa  156  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3749  hypothetical protein  21.04 
 
 		 1439 aa  154  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1193  hypothetical protein  21.49 
 
 		 1307 aa  154  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.879408  hitchhiker  0.00193389 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0502  hypothetical protein  22.51 
 
 		 1441 aa  153  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0523  hypothetical protein  22.97 
 
 		 1446 aa  152  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0403  hypothetical protein  21.4 
 
 		 1305 aa  152  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0470  hypothetical protein  21.35 
 
 		 1307 aa  151  7e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.196897  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0268  hypothetical protein  22.2 
 
 		 1276 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2656  hypothetical protein  23.29 
 
 		 1288 aa  150  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37084  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5090  hypothetical protein  23.85 
 
 		 1275 aa  150  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.340947  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58090  hypothetical protein  23.52 
 
 		 1276 aa  149  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3672  hypothetical protein  23.86 
 
 		 1277 aa  146  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2235  hypothetical protein  26.99 
 
 		 1290 aa  144  9e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3541  hypothetical protein  22.46 
 
 		 1266 aa  143  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03105  conserved membrane protein, predicted transporter  22.57 
 
 		 1266 aa  142  6e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0723003  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03056  hypothetical protein  22.57 
 
 		 1266 aa  142  6e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.102838  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0461  hypothetical protein  22.55 
 
 		 1266 aa  141  7.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00853598  normal  0.775435 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3435  hypothetical protein  22.49 
 
 		 1266 aa  140  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2899  hypothetical protein  33.05 
 
 		 1283 aa  139  5e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3728  hypothetical protein  22.57 
 
 		 1266 aa  137  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12700  hypothetical protein  25.34 
 
 		 1277 aa  137  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4562  hypothetical protein  21.83 
 
 		 1266 aa  137  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3277  hypothetical protein  21.92 
 
 		 1266 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.682788  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3830  hypothetical protein  22.57 
 
 		 1284 aa  136  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.238588  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>