123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_12700 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0938  hypothetical protein  50.51 
 
 		 1273 aa  1215    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349009  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4467  hypothetical protein  50.55 
 
 		 1271 aa  1274    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00502079  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4158  hypothetical protein  51.02 
 
 		 1271 aa  1286    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0843  hypothetical protein  50.39 
 
 		 1267 aa  1263    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.560634  normal  0.938035 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58090  hypothetical protein  52.75 
 
 		 1276 aa  1232    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12700  hypothetical protein  100 
 
 		 1277 aa  2480    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0861  membrane protein-like protein  55.7 
 
 		 1273 aa  1312    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.835961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0978  hypothetical protein  50.43 
 
 		 1271 aa  1216    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5090  hypothetical protein  52.8 
 
 		 1275 aa  1221    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.340947  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0945  hypothetical protein  50.51 
 
 		 1271 aa  1210    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4277  hypothetical protein  50 
 
 		 1269 aa  1214    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3187  exonuclease VII, small subunit  24.58 
 
 		 1380 aa  371  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1942  membrane protein-like protein  23.96 
 
 		 1272 aa  306  2.0000000000000002e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.307785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0410  hypothetical protein  29.45 
 
 		 1309 aa  272  2.9999999999999997e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103346 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2656  hypothetical protein  24.93 
 
 		 1288 aa  270  1e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37084  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2235  hypothetical protein  26.67 
 
 		 1290 aa  268  5e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1744  hypothetical protein  23.39 
 
 		 1284 aa  265  4.999999999999999e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0306491 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3330  hypothetical protein  24.15 
 
 		 1307 aa  248  6.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000315008 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002388  possible exported protein  21.78 
 
 		 1301 aa  247  9.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.267234  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0257  hypothetical protein  23.04 
 
 		 1276 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0268  hypothetical protein  22.81 
 
 		 1276 aa  236  3e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3830  hypothetical protein  24.01 
 
 		 1284 aa  231  5e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.238588  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03680  hypothetical protein  21.53 
 
 		 1266 aa  231  5e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4406  hypothetical protein  22.94 
 
 		 1291 aa  231  5e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.213897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0579  hypothetical protein  21.37 
 
 		 1383 aa  221  6e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3672  hypothetical protein  23.79 
 
 		 1277 aa  218  5e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0510  hypothetical protein  26.2 
 
 		 1261 aa  218  7e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3728  hypothetical protein  22.85 
 
 		 1266 aa  215  5.999999999999999e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3682  hypothetical protein  23.06 
 
 		 1265 aa  214  7e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1057  hypothetical protein  22.33 
 
 		 1264 aa  213  2e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0461  conserved hypothetical protein  22.75 
 
 		 1266 aa  211  6e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.049997  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1193  hypothetical protein  21.28 
 
 		 1307 aa  211  9e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.879408  hitchhiker  0.00193389 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0488  hypothetical protein  20.79 
 
 		 1287 aa  210  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.135683  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3541  hypothetical protein  22.68 
 
 		 1266 aa  211  1e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0403  hypothetical protein  21.39 
 
 		 1305 aa  210  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3435  hypothetical protein  22.63 
 
 		 1266 aa  210  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3632  hypothetical protein  23.63 
 
 		 1266 aa  209  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357405  normal  0.0273308 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03105  conserved membrane protein, predicted transporter  22.41 
 
 		 1266 aa  209  3e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0723003  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03056  hypothetical protein  22.41 
 
 		 1266 aa  209  3e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.102838  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3729  hypothetical protein  23.53 
 
 		 1266 aa  209  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.424475  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0470  hypothetical protein  21.28 
 
 		 1307 aa  209  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.196897  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2839  hypothetical protein  21.13 
 
 		 1291 aa  209  4e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3277  hypothetical protein  22.66 
 
 		 1266 aa  208  4e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.682788  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3561  hypothetical protein  23.5 
 
 		 1266 aa  209  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3560  hypothetical protein  23.55 
 
 		 1266 aa  208  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0461  hypothetical protein  22.48 
 
 		 1266 aa  208  5e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00853598  normal  0.775435 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3667  hypothetical protein  23.55 
 
 		 1266 aa  208  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1218  hypothetical protein  26.47 
 
 		 1341 aa  207  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0577669  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4562  hypothetical protein  22.33 
 
 		 1266 aa  205  5e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190737  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1719  hypothetical protein  20.59 
 
 		 1273 aa  200  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2899  hypothetical protein  24.65 
 
 		 1283 aa  197  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1719  hypothetical protein  20.64 
 
 		 1273 aa  195  4e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0849  hypothetical protein  24.2 
 
 		 1384 aa  194  9e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0380  hypothetical protein  24.44 
 
 		 1265 aa  190  1e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1988  membrane protein-like protein  26.71 
 
 		 1300 aa  190  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2723  membrane protein-like  31.51 
 
 		 1236 aa  189  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.439608  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3749  hypothetical protein  21.86 
 
 		 1439 aa  188  5e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4555  putative protease  21.32 
 
 		 1323 aa  181  5.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0563  hypothetical protein  21.13 
 
 		 1419 aa  181  9e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72639  normal  0.280407 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4397  hypothetical protein  21.75 
 
 		 1392 aa  181  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.963583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1735  membrane protein-like protein  23.95 
 
 		 1346 aa  179  2e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0502  hypothetical protein  21.77 
 
 		 1441 aa  178  5e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0523  hypothetical protein  21.68 
 
 		 1446 aa  177  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0408  hypothetical protein  22.05 
 
 		 1436 aa  175  3.9999999999999995e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3733  hypothetical protein  20.57 
 
 		 1443 aa  175  6.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3520  putative transmembrane protein  25.68 
 
 		 1450 aa  172  4e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0199259 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0188  hypothetical protein  20.86 
 
 		 1301 aa  160  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5159  hypothetical protein  24.25 
 
 		 1394 aa  159  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3467  hypothetical protein  21.25 
 
 		 1416 aa  155  4e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3643  hypothetical protein  20.88 
 
 		 1417 aa  155  7e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247251  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4093  hypothetical protein  22.09 
 
 		 1390 aa  153  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3817  hypothetical protein  21.8 
 
 		 1459 aa  148  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0527  hypothetical protein  22 
 
 		 1454 aa  147  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0484  hypothetical protein  21.14 
 
 		 1417 aa  147  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.814446 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4656  hypothetical protein  24.17 
 
 		 1425 aa  145  4e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0411  hypothetical protein  22.93 
 
 		 1274 aa  142  6e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.68904  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4831  hypothetical protein  24.48 
 
 		 1420 aa  140  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761382  normal  0.626491 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2136  hypothetical protein  25.57 
 
 		 1141 aa  140  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3368  hypothetical protein  23.97 
 
 		 1378 aa  140  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.48731  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0471  hypothetical protein  24 
 
 		 1286 aa  140  2e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.356031  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0512  hypothetical protein  20.93 
 
 		 1153 aa  138  7.000000000000001e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.350168  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3897  hypothetical protein  23.95 
 
 		 1379 aa  138  9e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.663381 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0993  hypothetical protein  22.71 
 
 		 1398 aa  137  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.193482 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1645  hypothetical protein  20.86 
 
 		 1153 aa  137  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000756943  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01889  hypothetical protein  26.25 
 
 		 1306 aa  137  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1029  hypothetical protein  23.99 
 
 		 1419 aa  135  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0366  hypothetical protein  22.79 
 
 		 1381 aa  132  5.0000000000000004e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00269  putative protease  22.8 
 
 		 1331 aa  131  7.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2657  hypothetical protein  22.99 
 
 		 1426 aa  131  8.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1127  membrane protein-like protein  19.8 
 
 		 1294 aa  129  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.334782  normal  0.712644 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2894  putative transmembrane protein  22.29 
 
 		 1426 aa  122  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1776  membrane protein-like protein  20.94 
 
 		 1384 aa  122  6e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2643  hypothetical protein  22.84 
 
 		 1399 aa  122  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.73761 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0243  putative transmembrane protein  24.64 
 
 		 1472 aa  121  7e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.150673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2488  hypothetical protein  22.98 
 
 		 1426 aa  119  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0472  membrane protein  24.53 
 
 		 1515 aa  119  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.50538 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4655  hypothetical protein  22.95 
 
 		 1441 aa  118  6.9999999999999995e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1493  membrane protein-like protein  22.04 
 
 		 1379 aa  115  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0634  hypothetical protein  21.91 
 
 		 1398 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.913326  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0659  hypothetical protein  21.73 
 
 		 1398 aa  114  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>