126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0410 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0410  hypothetical protein  100 
 
 
1309 aa  2513    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.103346 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2136  hypothetical protein  34.34 
 
 
1141 aa  355  5e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2656  hypothetical protein  28.15 
 
 
1288 aa  354  5.9999999999999994e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37084  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2270  membrane protein-like protein  29.58 
 
 
1304 aa  348  3e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2899  hypothetical protein  28.55 
 
 
1283 aa  313  2e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5090  hypothetical protein  28.19 
 
 
1275 aa  309  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.340947  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0380  hypothetical protein  29.2 
 
 
1265 aa  308  4.0000000000000004e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58090  hypothetical protein  27.86 
 
 
1276 aa  301  5e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3330  hypothetical protein  26.39 
 
 
1307 aa  294  8e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000315008 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1988  membrane protein-like protein  30.22 
 
 
1300 aa  289  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1719  hypothetical protein  21.66 
 
 
1273 aa  286  2.0000000000000002e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1719  hypothetical protein  21.73 
 
 
1273 aa  286  2.0000000000000002e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12700  hypothetical protein  28.02 
 
 
1277 aa  273  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0510  hypothetical protein  27.53 
 
 
1261 aa  269  2.9999999999999995e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0861  membrane protein-like protein  26.82 
 
 
1273 aa  266  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.835961  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3728  hypothetical protein  24.12 
 
 
1266 aa  259  2e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4406  hypothetical protein  25.26 
 
 
1291 aa  259  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.213897  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0461  conserved hypothetical protein  24.12 
 
 
1266 aa  259  3e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.049997  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3541  hypothetical protein  24.12 
 
 
1266 aa  258  7e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3435  hypothetical protein  24.12 
 
 
1266 aa  257  9e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03105  conserved membrane protein, predicted transporter  24.05 
 
 
1266 aa  257  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0723003  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03056  hypothetical protein  24.05 
 
 
1266 aa  257  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.102838  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0461  hypothetical protein  24.05 
 
 
1266 aa  255  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00853598  normal  0.775435 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4562  hypothetical protein  24.05 
 
 
1266 aa  254  7e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190737  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1057  hypothetical protein  23.47 
 
 
1264 aa  251  6e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4158  hypothetical protein  25.75 
 
 
1271 aa  248  6e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4397  hypothetical protein  23.24 
 
 
1392 aa  248  6.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.963583  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0843  hypothetical protein  26.56 
 
 
1267 aa  244  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.560634  normal  0.938035 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1218  hypothetical protein  27.81 
 
 
1341 aa  244  1e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0577669  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4467  hypothetical protein  25.48 
 
 
1271 aa  243  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00502079  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1744  hypothetical protein  23.28 
 
 
1284 aa  242  4e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0306491 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3729  hypothetical protein  24.15 
 
 
1266 aa  242  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.424475  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3561  hypothetical protein  24.07 
 
 
1266 aa  239  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3733  hypothetical protein  22.46 
 
 
1443 aa  238  5.0000000000000005e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3560  hypothetical protein  24.07 
 
 
1266 aa  238  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3667  hypothetical protein  24.07 
 
 
1266 aa  238  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4277  hypothetical protein  27.6 
 
 
1269 aa  238  6e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01889  hypothetical protein  29.25 
 
 
1306 aa  238  7e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3632  hypothetical protein  24.07 
 
 
1266 aa  237  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357405  normal  0.0273308 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0945  hypothetical protein  26.84 
 
 
1271 aa  237  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0502  hypothetical protein  22.3 
 
 
1441 aa  235  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0579  hypothetical protein  22.45 
 
 
1383 aa  235  5e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0938  hypothetical protein  27.53 
 
 
1273 aa  234  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349009  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4555  putative protease  22.72 
 
 
1323 aa  234  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0978  hypothetical protein  27.53 
 
 
1271 aa  234  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3277  hypothetical protein  23.69 
 
 
1266 aa  233  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.682788  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0527  hypothetical protein  22.38 
 
 
1454 aa  233  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3817  hypothetical protein  22.23 
 
 
1459 aa  231  5e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0523  hypothetical protein  22.26 
 
 
1446 aa  230  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0563  hypothetical protein  22.91 
 
 
1419 aa  228  8e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72639  normal  0.280407 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3520  putative transmembrane protein  26.12 
 
 
1450 aa  227  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0199259 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0408  hypothetical protein  22.74 
 
 
1436 aa  226  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0268  hypothetical protein  23.84 
 
 
1276 aa  224  7e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0411  hypothetical protein  25.93 
 
 
1274 aa  219  2e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.68904  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3329  hypothetical protein  22.74 
 
 
1419 aa  219  2.9999999999999998e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0257  hypothetical protein  23.2 
 
 
1276 aa  219  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0471  hypothetical protein  25.74 
 
 
1286 aa  219  2.9999999999999998e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.356031  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03680  hypothetical protein  22.09 
 
 
1266 aa  219  4e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2235  hypothetical protein  25.94 
 
 
1290 aa  218  5e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3830  hypothetical protein  24.65 
 
 
1284 aa  218  7e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.238588  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4831  hypothetical protein  27.64 
 
 
1420 aa  217  9e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761382  normal  0.626491 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4093  hypothetical protein  22.34 
 
 
1390 aa  217  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2839  hypothetical protein  22.96 
 
 
1291 aa  212  4e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3672  hypothetical protein  24.4 
 
 
1277 aa  210  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0403  hypothetical protein  22.28 
 
 
1305 aa  210  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3749  hypothetical protein  22.44 
 
 
1439 aa  208  5e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3467  hypothetical protein  22.34 
 
 
1416 aa  207  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002388  possible exported protein  21.23 
 
 
1301 aa  207  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.267234  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0366  hypothetical protein  24.78 
 
 
1381 aa  205  6e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3643  hypothetical protein  22.1 
 
 
1417 aa  203  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247251  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1127  membrane protein-like protein  20.85 
 
 
1294 aa  203  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.334782  normal  0.712644 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3897  hypothetical protein  24.89 
 
 
1379 aa  198  6e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.663381 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3368  hypothetical protein  26.5 
 
 
1378 aa  196  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.48731  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1029  hypothetical protein  24.78 
 
 
1419 aa  194  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4655  hypothetical protein  25.27 
 
 
1441 aa  192  5e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431718  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0188  hypothetical protein  22.12 
 
 
1301 aa  190  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5159  hypothetical protein  25.65 
 
 
1394 aa  189  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0849  hypothetical protein  25.11 
 
 
1384 aa  188  7e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1505  membrane protein-like  21.63 
 
 
1283 aa  179  2e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000453243  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3187  exonuclease VII, small subunit  22.54 
 
 
1380 aa  176  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00269  putative protease  21.28 
 
 
1331 aa  174  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1942  membrane protein-like protein  21.5 
 
 
1272 aa  174  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.307785  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2894  putative transmembrane protein  23.06 
 
 
1426 aa  173  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1298  hypothetical protein  25.1 
 
 
1397 aa  164  9e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438344  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2488  hypothetical protein  22.75 
 
 
1426 aa  163  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297377  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1735  membrane protein-like protein  23.34 
 
 
1346 aa  162  4e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3321  hypothetical protein  25.46 
 
 
1397 aa  158  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3288  hypothetical protein  25.36 
 
 
1397 aa  157  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0218679  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3332  hypothetical protein  25.36 
 
 
1397 aa  156  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2335  hypothetical protein  25.36 
 
 
1368 aa  155  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2216  hypothetical protein  25.36 
 
 
1372 aa  155  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0519007  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3829  hypothetical protein  24.68 
 
 
1399 aa  155  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0490  hypothetical protein  25.36 
 
 
1397 aa  154  7e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1109  hypothetical protein  25.36 
 
 
1397 aa  154  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.823265  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1493  membrane protein-like protein  19.33 
 
 
1379 aa  154  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0705  membrane protein-like protein  24.57 
 
 
1224 aa  152  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.113545  hitchhiker  0.00000969857 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0257  hypothetical protein  24.49 
 
 
1399 aa  152  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.866424  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0741  hypothetical protein  24.73 
 
 
1399 aa  152  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77418  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0711  hypothetical protein  24.39 
 
 
1399 aa  152  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.463012  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0243  putative transmembrane protein  25.47 
 
 
1472 aa  151  6e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.150673  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>