122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1127 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1127  membrane protein-like protein  100 
 
 		 1294 aa  2623    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.334782  normal  0.712644 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03680  hypothetical protein  25.71 
 
 		 1266 aa  453  1e-125  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3733  hypothetical protein  26.91 
 
 		 1443 aa  446  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002388  possible exported protein  25.77 
 
 		 1301 aa  436  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.267234  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4397  hypothetical protein  25.15 
 
 		 1392 aa  424  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.963583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0488  hypothetical protein  25.6 
 
 		 1287 aa  423  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.135683  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0188  hypothetical protein  25.14 
 
 		 1301 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0408  hypothetical protein  24.81 
 
 		 1436 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3467  hypothetical protein  25.88 
 
 		 1416 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0484  hypothetical protein  26.03 
 
 		 1417 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.814446 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3643  hypothetical protein  26.1 
 
 		 1417 aa  405  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247251  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4093  hypothetical protein  25.36 
 
 		 1390 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3749  hypothetical protein  24.92 
 
 		 1439 aa  398  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3817  hypothetical protein  25.31 
 
 		 1459 aa  388  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0527  hypothetical protein  25.23 
 
 		 1454 aa  388  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0579  hypothetical protein  24.28 
 
 		 1383 aa  385  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0502  hypothetical protein  25.06 
 
 		 1441 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0523  hypothetical protein  25.21 
 
 		 1446 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0257  hypothetical protein  23.44 
 
 		 1276 aa  359  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4406  hypothetical protein  23.37 
 
 		 1291 aa  355  2.9999999999999997e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.213897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0268  hypothetical protein  22.77 
 
 		 1276 aa  352  2e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3329  hypothetical protein  24.59 
 
 		 1419 aa  352  2e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03105  conserved membrane protein, predicted transporter  23.43 
 
 		 1266 aa  346  1e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0723003  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03056  hypothetical protein  23.43 
 
 		 1266 aa  346  1e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.102838  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0461  hypothetical protein  23.35 
 
 		 1266 aa  346  2e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00853598  normal  0.775435 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3541  hypothetical protein  23.28 
 
 		 1266 aa  346  2e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3435  hypothetical protein  23.27 
 
 		 1266 aa  345  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0461  conserved hypothetical protein  23.2 
 
 		 1266 aa  341  5e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.049997  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3728  hypothetical protein  23.2 
 
 		 1266 aa  341  5e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3277  hypothetical protein  23.2 
 
 		 1266 aa  341  5.9999999999999996e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.682788  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4562  hypothetical protein  23.12 
 
 		 1266 aa  339  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190737  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4555  putative protease  23.49 
 
 		 1323 aa  338  5e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3682  hypothetical protein  23.09 
 
 		 1265 aa  325  5e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3672  hypothetical protein  22.76 
 
 		 1277 aa  324  7e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3561  hypothetical protein  22.9 
 
 		 1266 aa  315  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3632  hypothetical protein  23.12 
 
 		 1266 aa  314  5.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357405  normal  0.0273308 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3560  hypothetical protein  22.74 
 
 		 1266 aa  313  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3667  hypothetical protein  22.74 
 
 		 1266 aa  313  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3729  hypothetical protein  22.66 
 
 		 1266 aa  312  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.424475  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2839  hypothetical protein  27.17 
 
 		 1291 aa  291  7e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00269  putative protease  25.76 
 
 		 1331 aa  286  2.0000000000000002e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0563  hypothetical protein  25.25 
 
 		 1419 aa  271  4e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72639  normal  0.280407 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0472  membrane protein  24.43 
 
 		 1515 aa  248  6e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.50538 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0403  hypothetical protein  24.85 
 
 		 1305 aa  245  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0470  hypothetical protein  25.38 
 
 		 1307 aa  244  7e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.196897  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1193  hypothetical protein  24.74 
 
 		 1307 aa  243  1e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.879408  hitchhiker  0.00193389 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3830  hypothetical protein  23.55 
 
 		 1284 aa  229  2e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.238588  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0380  hypothetical protein  20.02 
 
 		 1265 aa  206  2e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2656  hypothetical protein  19.22 
 
 		 1288 aa  192  2.9999999999999997e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37084  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0410  hypothetical protein  20.37 
 
 		 1309 aa  191  7e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103346 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4277  hypothetical protein  20.43 
 
 		 1269 aa  188  6e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1744  hypothetical protein  21.84 
 
 		 1284 aa  186  3e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0306491 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2899  hypothetical protein  22.41 
 
 		 1283 aa  173  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0945  hypothetical protein  19.85 
 
 		 1271 aa  168  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1218  hypothetical protein  19.9 
 
 		 1341 aa  167  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0577669  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4158  hypothetical protein  21.27 
 
 		 1271 aa  165  7e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0938  hypothetical protein  20.14 
 
 		 1273 aa  163  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349009  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4467  hypothetical protein  21.14 
 
 		 1271 aa  164  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00502079  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0978  hypothetical protein  20.12 
 
 		 1271 aa  162  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0843  hypothetical protein  22.3 
 
 		 1267 aa  161  9e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.560634  normal  0.938035 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0861  membrane protein-like protein  20.92 
 
 		 1273 aa  156  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.835961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1988  membrane protein-like protein  20.45 
 
 		 1300 aa  156  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0510  hypothetical protein  20.55 
 
 		 1261 aa  151  8e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2270  membrane protein-like protein  20.37 
 
 		 1304 aa  148  6e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1029  hypothetical protein  21.6 
 
 		 1419 aa  143  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58090  hypothetical protein  21.71 
 
 		 1276 aa  143  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5090  hypothetical protein  22.09 
 
 		 1275 aa  142  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.340947  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2507  hypothetical protein  20.93 
 
 		 1419 aa  135  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1505  membrane protein-like  23.22 
 
 		 1283 aa  135  6e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000453243  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2723  membrane protein-like  21.79 
 
 		 1236 aa  133  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.439608  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3897  hypothetical protein  20.73 
 
 		 1379 aa  133  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.663381 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2894  putative transmembrane protein  18.58 
 
 		 1426 aa  130  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2488  hypothetical protein  18.73 
 
 		 1426 aa  130  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0471  hypothetical protein  20.24 
 
 		 1286 aa  125  4e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.356031  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2657  hypothetical protein  19.57 
 
 		 1426 aa  125  8e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2235  hypothetical protein  19.79 
 
 		 1290 aa  124  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0411  hypothetical protein  19.72 
 
 		 1274 aa  124  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.68904  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2136  hypothetical protein  20.5 
 
 		 1141 aa  123  3e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3520  putative transmembrane protein  20.54 
 
 		 1450 aa  120  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0199259 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3970  hypothetical protein  20.1 
 
 		 1430 aa  119  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.231617 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12700  hypothetical protein  19.8 
 
 		 1277 aa  117  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3330  hypothetical protein  18.53 
 
 		 1307 aa  115  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000315008 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5159  hypothetical protein  19.69 
 
 		 1394 aa  111  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0728  hypothetical protein  20.17 
 
 		 1428 aa  111  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3187  exonuclease VII, small subunit  19.44 
 
 		 1380 aa  111  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1057  hypothetical protein  21.34 
 
 		 1264 aa  109  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0849  hypothetical protein  21.08 
 
 		 1384 aa  107  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01889  hypothetical protein  19.43 
 
 		 1306 aa  107  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3332  hypothetical protein  27.01 
 
 		 1397 aa  97.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3321  hypothetical protein  27.01 
 
 		 1397 aa  97.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2335  hypothetical protein  27.01 
 
 		 1368 aa  97.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0490  hypothetical protein  27.01 
 
 		 1397 aa  97.4  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1109  hypothetical protein  27.01 
 
 		 1397 aa  97.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.823265  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3288  hypothetical protein  27.01 
 
 		 1397 aa  97.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0218679  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2216  hypothetical protein  27.01 
 
 		 1372 aa  97.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0519007  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1776  membrane protein-like protein  25.19 
 
 		 1384 aa  93.6  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0711  hypothetical protein  26.9 
 
 		 1399 aa  92.4  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.463012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3829  hypothetical protein  26.47 
 
 		 1399 aa  91.7  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1942  membrane protein-like protein  21.34 
 
 		 1272 aa  91.3  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.307785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0257  hypothetical protein  26.4 
 
 		 1399 aa  90.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.866424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>