126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4093 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4093  hypothetical protein  100 
 
 		 1390 aa  2827    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3329  hypothetical protein  44.57 
 
 		 1419 aa  1132    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3467  hypothetical protein  85.1 
 
 		 1416 aa  2392    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0484  hypothetical protein  85.18 
 
 		 1417 aa  2380    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.814446 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3733  hypothetical protein  48.71 
 
 		 1443 aa  1414    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3643  hypothetical protein  84.75 
 
 		 1417 aa  2376    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0472  membrane protein  45.33 
 
 		 1515 aa  774    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.50538 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3817  hypothetical protein  70.1 
 
 		 1459 aa  2043    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0408  hypothetical protein  53.26 
 
 		 1436 aa  1493    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0579  hypothetical protein  72.05 
 
 		 1383 aa  2063    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0527  hypothetical protein  70.12 
 
 		 1454 aa  2039    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0502  hypothetical protein  70.31 
 
 		 1441 aa  2029    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0563  hypothetical protein  52.95 
 
 		 1419 aa  1510    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72639  normal  0.280407 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3749  hypothetical protein  50 
 
 		 1439 aa  1424    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0523  hypothetical protein  70.23 
 
 		 1446 aa  2033    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4397  hypothetical protein  52.79 
 
 		 1392 aa  1486    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.963583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0188  hypothetical protein  28.86 
 
 		 1301 aa  561  1e-158  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2839  hypothetical protein  27.49 
 
 		 1291 aa  501  1e-140  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00269  putative protease  27.65 
 
 		 1331 aa  475  1e-132  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002388  possible exported protein  27 
 
 		 1301 aa  471  1.0000000000000001e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.267234  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03680  hypothetical protein  25.95 
 
 		 1266 aa  463  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4555  putative protease  26.59 
 
 		 1323 aa  457  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1127  membrane protein-like protein  25.36 
 
 		 1294 aa  420  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.334782  normal  0.712644 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0488  hypothetical protein  25.29 
 
 		 1287 aa  420  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.135683  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4406  hypothetical protein  25.36 
 
 		 1291 aa  403  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.213897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0257  hypothetical protein  25.13 
 
 		 1276 aa  397  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0268  hypothetical protein  24.65 
 
 		 1276 aa  392  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3682  hypothetical protein  24.5 
 
 		 1265 aa  392  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03105  conserved membrane protein, predicted transporter  24.94 
 
 		 1266 aa  384  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0723003  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03056  hypothetical protein  24.94 
 
 		 1266 aa  384  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.102838  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3435  hypothetical protein  24.67 
 
 		 1266 aa  386  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0461  hypothetical protein  24.6 
 
 		 1266 aa  384  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00853598  normal  0.775435 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3541  hypothetical protein  24.36 
 
 		 1266 aa  381  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0461  conserved hypothetical protein  24.44 
 
 		 1266 aa  379  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.049997  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4562  hypothetical protein  24.44 
 
 		 1266 aa  379  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3672  hypothetical protein  24.21 
 
 		 1277 aa  377  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3830  hypothetical protein  24.94 
 
 		 1284 aa  380  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.238588  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3728  hypothetical protein  24.36 
 
 		 1266 aa  377  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3277  hypothetical protein  24.36 
 
 		 1266 aa  374  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.682788  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3561  hypothetical protein  24.22 
 
 		 1266 aa  361  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3560  hypothetical protein  24.35 
 
 		 1266 aa  361  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3667  hypothetical protein  24.35 
 
 		 1266 aa  361  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3729  hypothetical protein  24.35 
 
 		 1266 aa  361  6e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.424475  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3632  hypothetical protein  24.27 
 
 		 1266 aa  359  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357405  normal  0.0273308 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1193  hypothetical protein  26.43 
 
 		 1307 aa  297  1e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.879408  hitchhiker  0.00193389 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0470  hypothetical protein  26.66 
 
 		 1307 aa  297  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.196897  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0403  hypothetical protein  26.53 
 
 		 1305 aa  295  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1719  hypothetical protein  21.92 
 
 		 1273 aa  283  2e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1719  hypothetical protein  21.62 
 
 		 1273 aa  277  1.0000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1744  hypothetical protein  22.11 
 
 		 1284 aa  266  3e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0306491 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0380  hypothetical protein  22.88 
 
 		 1265 aa  244  1e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1735  membrane protein-like protein  23.18 
 
 		 1346 aa  234  1e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3330  hypothetical protein  22.41 
 
 		 1307 aa  229  3e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000315008 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4467  hypothetical protein  22.21 
 
 		 1271 aa  220  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00502079  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0410  hypothetical protein  22.15 
 
 		 1309 aa  220  2e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103346 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2656  hypothetical protein  21.97 
 
 		 1288 aa  211  9e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37084  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4277  hypothetical protein  21.86 
 
 		 1269 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0510  hypothetical protein  21.38 
 
 		 1261 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4158  hypothetical protein  23.75 
 
 		 1271 aa  198  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0861  membrane protein-like protein  21.94 
 
 		 1273 aa  197  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.835961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1218  hypothetical protein  21.33 
 
 		 1341 aa  191  9e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0577669  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1057  hypothetical protein  21.48 
 
 		 1264 aa  185  6e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3897  hypothetical protein  20.58 
 
 		 1379 aa  176  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.663381 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12700  hypothetical protein  21.59 
 
 		 1277 aa  175  3.9999999999999995e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0843  hypothetical protein  23.07 
 
 		 1267 aa  171  7e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.560634  normal  0.938035 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4831  hypothetical protein  22.89 
 
 		 1420 aa  170  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761382  normal  0.626491 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5159  hypothetical protein  22.03 
 
 		 1394 aa  171  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2899  hypothetical protein  23.26 
 
 		 1283 aa  169  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0849  hypothetical protein  21.72 
 
 		 1384 aa  169  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0411  hypothetical protein  21.68 
 
 		 1274 aa  167  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.68904  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0243  putative transmembrane protein  21.79 
 
 		 1472 aa  165  4.0000000000000004e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.150673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0945  hypothetical protein  20.98 
 
 		 1271 aa  165  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0993  hypothetical protein  21.56 
 
 		 1398 aa  164  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.193482 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2894  putative transmembrane protein  21.84 
 
 		 1426 aa  164  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0938  hypothetical protein  21.07 
 
 		 1273 aa  160  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1029  hypothetical protein  21.34 
 
 		 1419 aa  160  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0978  hypothetical protein  21.07 
 
 		 1271 aa  159  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3829  hypothetical protein  22.18 
 
 		 1399 aa  159  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0659  hypothetical protein  23.19 
 
 		 1398 aa  157  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58090  hypothetical protein  20.3 
 
 		 1276 aa  156  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0471  hypothetical protein  22.05 
 
 		 1286 aa  157  2e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.356031  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2488  hypothetical protein  21.64 
 
 		 1426 aa  155  7e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0634  hypothetical protein  22.59 
 
 		 1398 aa  154  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.913326  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2235  hypothetical protein  21.45 
 
 		 1290 aa  154  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0741  hypothetical protein  22.02 
 
 		 1399 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77418  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0711  hypothetical protein  22.02 
 
 		 1399 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.463012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0257  hypothetical protein  21.9 
 
 		 1399 aa  149  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.866424  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2643  hypothetical protein  22.85 
 
 		 1399 aa  145  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.73761 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4655  hypothetical protein  19.82 
 
 		 1441 aa  143  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3520  putative transmembrane protein  21.62 
 
 		 1450 aa  140  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0199259 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3970  hypothetical protein  21.38 
 
 		 1430 aa  135  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.231617 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1776  membrane protein-like protein  21.15 
 
 		 1384 aa  135  3.9999999999999996e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1298  hypothetical protein  22.07 
 
 		 1397 aa  135  6.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438344  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3332  hypothetical protein  21.34 
 
 		 1397 aa  133  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0512  hypothetical protein  26.75 
 
 		 1153 aa  133  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.350168  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1645  hypothetical protein  26.75 
 
 		 1153 aa  133  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000756943  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2657  hypothetical protein  20.62 
 
 		 1426 aa  132  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1109  hypothetical protein  21.45 
 
 		 1397 aa  132  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.823265  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3288  hypothetical protein  21.34 
 
 		 1397 aa  132  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0218679  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3321  hypothetical protein  21.34 
 
 		 1397 aa  132  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>