123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0257 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03105  conserved membrane protein, predicted transporter  54.33 
 
 		 1266 aa  1422    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0723003  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0461  conserved hypothetical protein  54.09 
 
 		 1266 aa  1418    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.049997  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0268  hypothetical protein  93.57 
 
 		 1276 aa  2453    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3729  hypothetical protein  53.6 
 
 		 1266 aa  1392    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.424475  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3672  hypothetical protein  65.23 
 
 		 1277 aa  1761    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3830  hypothetical protein  65.8 
 
 		 1284 aa  1760    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.238588  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3560  hypothetical protein  53.52 
 
 		 1266 aa  1391    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4562  hypothetical protein  54.25 
 
 		 1266 aa  1420    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3682  hypothetical protein  52.74 
 
 		 1265 aa  1395    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0403  hypothetical protein  56.93 
 
 		 1305 aa  1537    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3435  hypothetical protein  54.48 
 
 		 1266 aa  1423    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3728  hypothetical protein  54.13 
 
 		 1266 aa  1416    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4406  hypothetical protein  59.06 
 
 		 1291 aa  1615    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.213897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1193  hypothetical protein  56.85 
 
 		 1307 aa  1535    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.879408  hitchhiker  0.00193389 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0470  hypothetical protein  56.85 
 
 		 1307 aa  1532    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.196897  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0461  hypothetical protein  54.48 
 
 		 1266 aa  1425    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00853598  normal  0.775435 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3541  hypothetical protein  54.49 
 
 		 1266 aa  1423    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03056  hypothetical protein  54.33 
 
 		 1266 aa  1422    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.102838  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0257  hypothetical protein  100 
 
 		 1276 aa  2593    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3277  hypothetical protein  54.36 
 
 		 1266 aa  1418    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.682788  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3632  hypothetical protein  53.44 
 
 		 1266 aa  1389    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357405  normal  0.0273308 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3667  hypothetical protein  53.52 
 
 		 1266 aa  1391    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3561  hypothetical protein  53.44 
 
 		 1266 aa  1392    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002388  possible exported protein  29.19 
 
 		 1301 aa  566  1.0000000000000001e-159  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.267234  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03680  hypothetical protein  29.1 
 
 		 1266 aa  549  1e-154  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2839  hypothetical protein  29.22 
 
 		 1291 aa  525  1e-147  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0488  hypothetical protein  25.89 
 
 		 1287 aa  499  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.135683  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0188  hypothetical protein  26.13 
 
 		 1301 aa  430  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0579  hypothetical protein  25.44 
 
 		 1383 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3467  hypothetical protein  25.12 
 
 		 1416 aa  385  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4555  putative protease  23.54 
 
 		 1323 aa  381  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0484  hypothetical protein  24.73 
 
 		 1417 aa  382  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.814446 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0408  hypothetical protein  25.97 
 
 		 1436 aa  383  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3643  hypothetical protein  24.73 
 
 		 1417 aa  378  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3749  hypothetical protein  25 
 
 		 1439 aa  380  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4093  hypothetical protein  25.13 
 
 		 1390 aa  374  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3733  hypothetical protein  23.64 
 
 		 1443 aa  375  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4397  hypothetical protein  25.48 
 
 		 1392 aa  374  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.963583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0527  hypothetical protein  24.96 
 
 		 1454 aa  369  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0502  hypothetical protein  24.63 
 
 		 1441 aa  366  1e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0523  hypothetical protein  24.88 
 
 		 1446 aa  366  2e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3817  hypothetical protein  24.38 
 
 		 1459 aa  363  9e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1127  membrane protein-like protein  23.44 
 
 		 1294 aa  359  1.9999999999999998e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.334782  normal  0.712644 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0563  hypothetical protein  24.32 
 
 		 1419 aa  343  1e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72639  normal  0.280407 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00269  putative protease  27.32 
 
 		 1331 aa  310  2.0000000000000002e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0472  membrane protein  26.42 
 
 		 1515 aa  283  1e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.50538 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3330  hypothetical protein  24.17 
 
 		 1307 aa  263  1e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000315008 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4467  hypothetical protein  23.2 
 
 		 1271 aa  263  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00502079  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4158  hypothetical protein  22.87 
 
 		 1271 aa  249  3e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1744  hypothetical protein  22.22 
 
 		 1284 aa  243  2e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0306491 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0510  hypothetical protein  23.93 
 
 		 1261 aa  239  3e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2656  hypothetical protein  22.4 
 
 		 1288 aa  229  4e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37084  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5090  hypothetical protein  23.21 
 
 		 1275 aa  225  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.340947  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1719  hypothetical protein  22.54 
 
 		 1273 aa  224  9e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58090  hypothetical protein  23.11 
 
 		 1276 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12700  hypothetical protein  23.02 
 
 		 1277 aa  223  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1719  hypothetical protein  22.08 
 
 		 1273 aa  222  3.9999999999999997e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0843  hypothetical protein  21.93 
 
 		 1267 aa  220  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.560634  normal  0.938035 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2270  membrane protein-like protein  23.33 
 
 		 1304 aa  221  1e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3329  hypothetical protein  23.5 
 
 		 1419 aa  218  5.9999999999999996e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4277  hypothetical protein  22.57 
 
 		 1269 aa  217  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0861  membrane protein-like protein  22.93 
 
 		 1273 aa  213  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.835961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2899  hypothetical protein  23.63 
 
 		 1283 aa  213  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0410  hypothetical protein  22.95 
 
 		 1309 aa  210  1e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103346 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0945  hypothetical protein  21.93 
 
 		 1271 aa  208  5e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1218  hypothetical protein  23.08 
 
 		 1341 aa  207  9e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0577669  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0380  hypothetical protein  24.14 
 
 		 1265 aa  206  2e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3368  hypothetical protein  23.43 
 
 		 1378 aa  204  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.48731  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2657  hypothetical protein  23.93 
 
 		 1426 aa  202  3.9999999999999996e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0938  hypothetical protein  22.15 
 
 		 1273 aa  201  6e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0366  hypothetical protein  23.02 
 
 		 1381 aa  200  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0978  hypothetical protein  22.15 
 
 		 1271 aa  199  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0849  hypothetical protein  24.15 
 
 		 1384 aa  196  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0993  hypothetical protein  22.95 
 
 		 1398 aa  194  9e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.193482 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2488  hypothetical protein  23.2 
 
 		 1426 aa  192  4e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4831  hypothetical protein  23.32 
 
 		 1420 aa  191  5.999999999999999e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761382  normal  0.626491 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1735  membrane protein-like protein  24.77 
 
 		 1346 aa  191  7e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2894  putative transmembrane protein  23.07 
 
 		 1426 aa  191  7e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3897  hypothetical protein  23.11 
 
 		 1379 aa  188  5e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.663381 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1029  hypothetical protein  23.46 
 
 		 1419 aa  188  7e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0659  hypothetical protein  23.7 
 
 		 1398 aa  185  6e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1988  membrane protein-like protein  24.35 
 
 		 1300 aa  184  7e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2643  hypothetical protein  23.6 
 
 		 1399 aa  183  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.73761 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3829  hypothetical protein  23.64 
 
 		 1399 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0257  hypothetical protein  23.68 
 
 		 1399 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.866424  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0741  hypothetical protein  23.68 
 
 		 1399 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77418  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0634  hypothetical protein  23.63 
 
 		 1398 aa  182  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.913326  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0711  hypothetical protein  23.71 
 
 		 1399 aa  181  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.463012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1298  hypothetical protein  23.13 
 
 		 1397 aa  177  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438344  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0471  hypothetical protein  23.93 
 
 		 1286 aa  177  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.356031  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0411  hypothetical protein  24.38 
 
 		 1274 aa  175  3.9999999999999995e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.68904  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5159  hypothetical protein  23.97 
 
 		 1394 aa  174  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01889  hypothetical protein  23.49 
 
 		 1306 aa  173  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3332  hypothetical protein  22.96 
 
 		 1397 aa  171  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3288  hypothetical protein  23.03 
 
 		 1397 aa  171  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0218679  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3321  hypothetical protein  22.96 
 
 		 1397 aa  171  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2216  hypothetical protein  23.05 
 
 		 1372 aa  170  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0519007  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1776  membrane protein-like protein  22.94 
 
 		 1384 aa  171  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2335  hypothetical protein  23.05 
 
 		 1368 aa  170  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0490  hypothetical protein  23.05 
 
 		 1397 aa  169  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>