128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4406 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03105  conserved membrane protein, predicted transporter  55.06 
 
 
1266 aa  1452    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0723003  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0461  conserved hypothetical protein  55.29 
 
 
1266 aa  1459    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.049997  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03056  hypothetical protein  55.06 
 
 
1266 aa  1452    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.102838  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3561  hypothetical protein  54.37 
 
 
1266 aa  1434    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4562  hypothetical protein  55.06 
 
 
1266 aa  1454    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190737  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3632  hypothetical protein  54.52 
 
 
1266 aa  1432    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357405  normal  0.0273308 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3560  hypothetical protein  54.45 
 
 
1266 aa  1431    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0268  hypothetical protein  59.38 
 
 
1276 aa  1613    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3672  hypothetical protein  55.12 
 
 
1277 aa  1461    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3682  hypothetical protein  54.45 
 
 
1265 aa  1446    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0257  hypothetical protein  59.14 
 
 
1276 aa  1615    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0403  hypothetical protein  60.81 
 
 
1305 aa  1659    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3435  hypothetical protein  55.41 
 
 
1266 aa  1459    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3728  hypothetical protein  55.17 
 
 
1266 aa  1457    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4406  hypothetical protein  100 
 
 
1291 aa  2617    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.213897  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1193  hypothetical protein  60.64 
 
 
1307 aa  1654    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.879408  hitchhiker  0.00193389 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0470  hypothetical protein  60.72 
 
 
1307 aa  1654    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.196897  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0461  hypothetical protein  55.37 
 
 
1266 aa  1460    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00853598  normal  0.775435 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3541  hypothetical protein  55.02 
 
 
1266 aa  1453    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3729  hypothetical protein  54.52 
 
 
1266 aa  1433    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.424475  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3277  hypothetical protein  55.09 
 
 
1266 aa  1454    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.682788  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3830  hypothetical protein  55.59 
 
 
1284 aa  1506    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.238588  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3667  hypothetical protein  54.45 
 
 
1266 aa  1431    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002388  possible exported protein  28.95 
 
 
1301 aa  553  1e-155  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.267234  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2839  hypothetical protein  30.21 
 
 
1291 aa  550  1e-155  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03680  hypothetical protein  28.94 
 
 
1266 aa  549  1e-154  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0488  hypothetical protein  28.4 
 
 
1287 aa  534  1e-150  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.135683  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4555  putative protease  26.17 
 
 
1323 aa  424  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3733  hypothetical protein  26.23 
 
 
1443 aa  404  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0579  hypothetical protein  25.5 
 
 
1383 aa  398  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3467  hypothetical protein  26.09 
 
 
1416 aa  395  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0188  hypothetical protein  25.93 
 
 
1301 aa  391  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3643  hypothetical protein  25.94 
 
 
1417 aa  393  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247251  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0484  hypothetical protein  26.06 
 
 
1417 aa  388  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.814446 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0408  hypothetical protein  26.14 
 
 
1436 aa  384  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0527  hypothetical protein  25.57 
 
 
1454 aa  383  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0502  hypothetical protein  25.46 
 
 
1441 aa  382  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3749  hypothetical protein  25.48 
 
 
1439 aa  380  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0523  hypothetical protein  25.46 
 
 
1446 aa  382  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4093  hypothetical protein  25.21 
 
 
1390 aa  379  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00269  putative protease  24.83 
 
 
1331 aa  377  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3817  hypothetical protein  25.34 
 
 
1459 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4397  hypothetical protein  25.47 
 
 
1392 aa  376  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.963583  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1127  membrane protein-like protein  23.67 
 
 
1294 aa  360  9.999999999999999e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.334782  normal  0.712644 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0563  hypothetical protein  25.48 
 
 
1419 aa  359  1.9999999999999998e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72639  normal  0.280407 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0472  membrane protein  27.4 
 
 
1515 aa  289  2.9999999999999996e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.50538 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3329  hypothetical protein  27.16 
 
 
1419 aa  264  8e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1744  hypothetical protein  23.88 
 
 
1284 aa  262  4e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0306491 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3330  hypothetical protein  24.18 
 
 
1307 aa  255  4.0000000000000004e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000315008 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4467  hypothetical protein  22.62 
 
 
1271 aa  249  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00502079  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4158  hypothetical protein  22.64 
 
 
1271 aa  244  6e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0410  hypothetical protein  25.19 
 
 
1309 aa  244  1e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.103346 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2656  hypothetical protein  22.29 
 
 
1288 aa  233  2e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37084  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0861  membrane protein-like protein  24.01 
 
 
1273 aa  229  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.835961  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12700  hypothetical protein  22.81 
 
 
1277 aa  228  5.0000000000000005e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1719  hypothetical protein  21.97 
 
 
1273 aa  227  1e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0945  hypothetical protein  24.07 
 
 
1271 aa  223  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4277  hypothetical protein  23.69 
 
 
1269 aa  222  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0380  hypothetical protein  22.94 
 
 
1265 aa  222  5e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0510  hypothetical protein  23.97 
 
 
1261 aa  221  5e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2657  hypothetical protein  24.65 
 
 
1426 aa  221  6e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1719  hypothetical protein  21.6 
 
 
1273 aa  221  8.999999999999998e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2894  putative transmembrane protein  25.41 
 
 
1426 aa  220  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2488  hypothetical protein  24.49 
 
 
1426 aa  215  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297377  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2899  hypothetical protein  23.81 
 
 
1283 aa  210  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58090  hypothetical protein  22.88 
 
 
1276 aa  210  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0843  hypothetical protein  21.52 
 
 
1267 aa  209  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.560634  normal  0.938035 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1218  hypothetical protein  23.9 
 
 
1341 aa  204  7e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0577669  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5090  hypothetical protein  22.53 
 
 
1275 aa  203  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.340947  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0938  hypothetical protein  23.87 
 
 
1273 aa  202  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349009  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0978  hypothetical protein  23.61 
 
 
1271 aa  198  6e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0471  hypothetical protein  24.02 
 
 
1286 aa  192  4e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.356031  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3897  hypothetical protein  22.53 
 
 
1379 aa  191  7e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.663381 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5159  hypothetical protein  22.27 
 
 
1394 aa  189  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0411  hypothetical protein  24.36 
 
 
1274 aa  189  3e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.68904  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1735  membrane protein-like protein  24.8 
 
 
1346 aa  189  4e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1776  membrane protein-like protein  22.97 
 
 
1384 aa  187  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01889  hypothetical protein  23.62 
 
 
1306 aa  187  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1029  hypothetical protein  22.45 
 
 
1419 aa  185  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1988  membrane protein-like protein  23.55 
 
 
1300 aa  180  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0993  hypothetical protein  22.5 
 
 
1398 aa  180  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.193482 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4655  hypothetical protein  22.04 
 
 
1441 aa  177  9e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431718  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4831  hypothetical protein  23.17 
 
 
1420 aa  175  5.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761382  normal  0.626491 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1645  hypothetical protein  22 
 
 
1153 aa  173  2e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000756943  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2507  hypothetical protein  22.11 
 
 
1419 aa  173  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380036  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0512  hypothetical protein  22 
 
 
1153 aa  172  3e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.350168  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0849  hypothetical protein  22.72 
 
 
1384 aa  172  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2136  hypothetical protein  24.97 
 
 
1141 aa  169  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2235  hypothetical protein  23.36 
 
 
1290 aa  169  4e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0243  putative transmembrane protein  22.6 
 
 
1472 aa  168  5e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.150673  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3829  hypothetical protein  23.03 
 
 
1399 aa  168  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1493  membrane protein-like protein  21.82 
 
 
1379 aa  167  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1057  hypothetical protein  21.97 
 
 
1264 aa  164  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0634  hypothetical protein  22.59 
 
 
1398 aa  164  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.913326  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0257  hypothetical protein  22.67 
 
 
1399 aa  161  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.866424  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0659  hypothetical protein  22.38 
 
 
1398 aa  161  8e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0741  hypothetical protein  22.67 
 
 
1399 aa  161  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77418  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0711  hypothetical protein  22.67 
 
 
1399 aa  159  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.463012  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2270  membrane protein-like protein  25.23 
 
 
1304 aa  159  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1505  membrane protein-like  22.01 
 
 
1283 aa  156  2.9999999999999998e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000453243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>