125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4397 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4093  hypothetical protein  52.86 
 
 		 1390 aa  1476    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0527  hypothetical protein  52.05 
 
 		 1454 aa  1483    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3329  hypothetical protein  43.3 
 
 		 1419 aa  1091    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3467  hypothetical protein  52.95 
 
 		 1416 aa  1487    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0484  hypothetical protein  53.06 
 
 		 1417 aa  1483    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.814446 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3733  hypothetical protein  50.03 
 
 		 1443 aa  1451    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3643  hypothetical protein  52.63 
 
 		 1417 aa  1461    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0472  membrane protein  43.66 
 
 		 1515 aa  723    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.50538 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3817  hypothetical protein  55.15 
 
 		 1459 aa  1480    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0408  hypothetical protein  58.64 
 
 		 1436 aa  1678    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0579  hypothetical protein  53.15 
 
 		 1383 aa  1501    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0502  hypothetical protein  51.83 
 
 		 1441 aa  1483    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0563  hypothetical protein  66.67 
 
 		 1419 aa  1897    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72639  normal  0.280407 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3749  hypothetical protein  57.71 
 
 		 1439 aa  1641    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0523  hypothetical protein  52.13 
 
 		 1446 aa  1484    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4397  hypothetical protein  100 
 
 		 1392 aa  2816    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.963583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0188  hypothetical protein  30.4 
 
 		 1301 aa  586  1e-166  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4555  putative protease  27.52 
 
 		 1323 aa  493  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03680  hypothetical protein  26.66 
 
 		 1266 aa  478  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00269  putative protease  27.77 
 
 		 1331 aa  472  1.0000000000000001e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002388  possible exported protein  26.59 
 
 		 1301 aa  469  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.267234  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2839  hypothetical protein  26.28 
 
 		 1291 aa  462  9.999999999999999e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1127  membrane protein-like protein  25.15 
 
 		 1294 aa  439  1e-121  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.334782  normal  0.712644 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0488  hypothetical protein  25.12 
 
 		 1287 aa  437  1e-121  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.135683  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1193  hypothetical protein  24.57 
 
 		 1307 aa  394  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.879408  hitchhiker  0.00193389 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0257  hypothetical protein  25.4 
 
 		 1276 aa  391  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0403  hypothetical protein  24.55 
 
 		 1305 aa  392  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3435  hypothetical protein  25.08 
 
 		 1266 aa  393  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0470  hypothetical protein  24.42 
 
 		 1307 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.196897  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03105  conserved membrane protein, predicted transporter  24.89 
 
 		 1266 aa  389  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0723003  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0461  conserved hypothetical protein  24.98 
 
 		 1266 aa  387  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.049997  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3728  hypothetical protein  24.98 
 
 		 1266 aa  387  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0461  hypothetical protein  24.85 
 
 		 1266 aa  389  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00853598  normal  0.775435 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3541  hypothetical protein  25.19 
 
 		 1266 aa  387  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03056  hypothetical protein  24.89 
 
 		 1266 aa  389  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.102838  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4562  hypothetical protein  24.98 
 
 		 1266 aa  384  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4406  hypothetical protein  25.21 
 
 		 1291 aa  384  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.213897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3277  hypothetical protein  24.83 
 
 		 1266 aa  380  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.682788  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3632  hypothetical protein  25.34 
 
 		 1266 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357405  normal  0.0273308 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3561  hypothetical protein  25.13 
 
 		 1266 aa  377  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3729  hypothetical protein  25.27 
 
 		 1266 aa  376  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.424475  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3560  hypothetical protein  25.27 
 
 		 1266 aa  376  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0268  hypothetical protein  24.85 
 
 		 1276 aa  374  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3682  hypothetical protein  25 
 
 		 1265 aa  375  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3667  hypothetical protein  25.27 
 
 		 1266 aa  376  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3830  hypothetical protein  23.62 
 
 		 1284 aa  360  7e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.238588  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3672  hypothetical protein  24.15 
 
 		 1277 aa  354  5e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1719  hypothetical protein  22.09 
 
 		 1273 aa  271  8e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1719  hypothetical protein  21.93 
 
 		 1273 aa  264  8e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1744  hypothetical protein  21.32 
 
 		 1284 aa  256  2.0000000000000002e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0306491 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3330  hypothetical protein  23.3 
 
 		 1307 aa  246  3e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000315008 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0410  hypothetical protein  22.87 
 
 		 1309 aa  246  3e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103346 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1735  membrane protein-like protein  23.23 
 
 		 1346 aa  240  2e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4277  hypothetical protein  22.7 
 
 		 1269 aa  231  5e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4158  hypothetical protein  22.05 
 
 		 1271 aa  230  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0843  hypothetical protein  22.02 
 
 		 1267 aa  228  7e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.560634  normal  0.938035 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4467  hypothetical protein  21.79 
 
 		 1271 aa  227  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00502079  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0861  membrane protein-like protein  23.51 
 
 		 1273 aa  213  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.835961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2270  membrane protein-like protein  21.28 
 
 		 1304 aa  213  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0510  hypothetical protein  23.74 
 
 		 1261 aa  213  3e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58090  hypothetical protein  22.23 
 
 		 1276 aa  208  8e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1218  hypothetical protein  20.79 
 
 		 1341 aa  206  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0577669  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5090  hypothetical protein  21.99 
 
 		 1275 aa  205  6e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.340947  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0945  hypothetical protein  21.84 
 
 		 1271 aa  202  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0978  hypothetical protein  21.82 
 
 		 1271 aa  202  5e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0380  hypothetical protein  21.74 
 
 		 1265 aa  201  6e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2656  hypothetical protein  21.04 
 
 		 1288 aa  201  6e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37084  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0938  hypothetical protein  21.75 
 
 		 1273 aa  199  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1988  membrane protein-like protein  22.83 
 
 		 1300 aa  196  4e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3897  hypothetical protein  20.79 
 
 		 1379 aa  194  9e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.663381 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2899  hypothetical protein  22.7 
 
 		 1283 aa  194  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1057  hypothetical protein  20.81 
 
 		 1264 aa  182  4.999999999999999e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3829  hypothetical protein  21.72 
 
 		 1399 aa  179  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0993  hypothetical protein  20.23 
 
 		 1398 aa  177  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.193482 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1029  hypothetical protein  21.04 
 
 		 1419 aa  176  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4831  hypothetical protein  22.92 
 
 		 1420 aa  175  5e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761382  normal  0.626491 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0411  hypothetical protein  22.29 
 
 		 1274 aa  175  5e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.68904  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12700  hypothetical protein  21.43 
 
 		 1277 aa  175  6.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3187  exonuclease VII, small subunit  19.96 
 
 		 1380 aa  174  9e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0471  hypothetical protein  22.98 
 
 		 1286 aa  174  1e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.356031  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0849  hypothetical protein  22.18 
 
 		 1384 aa  173  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2643  hypothetical protein  22.88 
 
 		 1399 aa  172  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.73761 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5159  hypothetical protein  21.26 
 
 		 1394 aa  169  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3332  hypothetical protein  21.76 
 
 		 1397 aa  168  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1298  hypothetical protein  21.2 
 
 		 1397 aa  167  9e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438344  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2335  hypothetical protein  21.72 
 
 		 1368 aa  167  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0634  hypothetical protein  22.34 
 
 		 1398 aa  167  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.913326  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0490  hypothetical protein  21.72 
 
 		 1397 aa  167  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1109  hypothetical protein  21.72 
 
 		 1397 aa  167  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.823265  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4655  hypothetical protein  22.31 
 
 		 1441 aa  166  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3321  hypothetical protein  21.69 
 
 		 1397 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2216  hypothetical protein  21.72 
 
 		 1372 aa  167  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0519007  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0711  hypothetical protein  24.41 
 
 		 1399 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.463012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3288  hypothetical protein  21.62 
 
 		 1397 aa  166  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0218679  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0741  hypothetical protein  24.3 
 
 		 1399 aa  162  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77418  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0257  hypothetical protein  24.19 
 
 		 1399 aa  161  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.866424  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0243  putative transmembrane protein  21.07 
 
 		 1472 aa  156  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.150673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0659  hypothetical protein  24.33 
 
 		 1398 aa  155  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2136  hypothetical protein  24.47 
 
 		 1141 aa  154  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2488  hypothetical protein  21.14 
 
 		 1426 aa  152  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297377  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>