136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3330 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3330  hypothetical protein  100 
 
 		 1307 aa  2611    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000315008 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1057  hypothetical protein  34.83 
 
 		 1264 aa  656    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1744  hypothetical protein  34.16 
 
 		 1284 aa  717    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0306491 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1218  hypothetical protein  38.73 
 
 		 1341 aa  776    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0577669  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0510  hypothetical protein  34.72 
 
 		 1261 aa  622  1e-176  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0366  hypothetical protein  30.51 
 
 		 1381 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4831  hypothetical protein  30.16 
 
 		 1420 aa  550  1e-155  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761382  normal  0.626491 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3897  hypothetical protein  30.27 
 
 		 1379 aa  548  1e-154  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.663381 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4656  hypothetical protein  31.16 
 
 		 1425 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4655  hypothetical protein  29.5 
 
 		 1441 aa  533  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5159  hypothetical protein  30.77 
 
 		 1394 aa  528  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3368  hypothetical protein  30.53 
 
 		 1378 aa  528  1e-148  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.48731  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0849  hypothetical protein  29.75 
 
 		 1384 aa  504  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2507  hypothetical protein  27.11 
 
 		 1419 aa  488  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3970  hypothetical protein  28.51 
 
 		 1430 aa  480  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.231617 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2488  hypothetical protein  28.62 
 
 		 1426 aa  478  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2894  putative transmembrane protein  28.33 
 
 		 1426 aa  472  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0243  putative transmembrane protein  30.72 
 
 		 1472 aa  472  1.0000000000000001e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.150673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0728  hypothetical protein  27.72 
 
 		 1428 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2657  hypothetical protein  28.06 
 
 		 1426 aa  457  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0993  hypothetical protein  28.51 
 
 		 1398 aa  452  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.193482 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0257  hypothetical protein  28.28 
 
 		 1399 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.866424  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0741  hypothetical protein  28.23 
 
 		 1399 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77418  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0711  hypothetical protein  28.28 
 
 		 1399 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.463012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1029  hypothetical protein  27.44 
 
 		 1419 aa  429  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3829  hypothetical protein  28.13 
 
 		 1399 aa  421  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2643  hypothetical protein  27.99 
 
 		 1399 aa  415  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.73761 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1298  hypothetical protein  28.06 
 
 		 1397 aa  412  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438344  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0634  hypothetical protein  27.81 
 
 		 1398 aa  412  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.913326  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0659  hypothetical protein  27.73 
 
 		 1398 aa  413  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3288  hypothetical protein  27.9 
 
 		 1397 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0218679  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2335  hypothetical protein  27.84 
 
 		 1368 aa  405  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3332  hypothetical protein  27.9 
 
 		 1397 aa  406  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0490  hypothetical protein  27.84 
 
 		 1397 aa  405  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1109  hypothetical protein  27.84 
 
 		 1397 aa  405  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.823265  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3321  hypothetical protein  27.9 
 
 		 1397 aa  405  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2216  hypothetical protein  27.84 
 
 		 1372 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0519007  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3520  putative transmembrane protein  27.74 
 
 		 1450 aa  393  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0199259 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1776  membrane protein-like protein  25.04 
 
 		 1384 aa  379  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4018  hypothetical protein  30.25 
 
 		 1418 aa  367  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.938248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1493  membrane protein-like protein  24.77 
 
 		 1379 aa  365  4e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1719  hypothetical protein  23.25 
 
 		 1273 aa  326  2e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1719  hypothetical protein  23.09 
 
 		 1273 aa  318  6e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2270  membrane protein-like protein  25.78 
 
 		 1304 aa  311  4e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2656  hypothetical protein  26 
 
 		 1288 aa  308  4.0000000000000004e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37084  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0843  hypothetical protein  23.78 
 
 		 1267 aa  291  4e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.560634  normal  0.938035 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1988  membrane protein-like protein  27.04 
 
 		 1300 aa  289  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0410  hypothetical protein  26.47 
 
 		 1309 aa  286  2.0000000000000002e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103346 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2899  hypothetical protein  25.89 
 
 		 1283 aa  276  2.0000000000000002e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4158  hypothetical protein  24.65 
 
 		 1271 aa  275  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3435  hypothetical protein  25.06 
 
 		 1266 aa  273  1e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03105  conserved membrane protein, predicted transporter  24.77 
 
 		 1266 aa  272  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0723003  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03056  hypothetical protein  24.77 
 
 		 1266 aa  272  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.102838  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0461  hypothetical protein  24.98 
 
 		 1266 aa  271  4e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00853598  normal  0.775435 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3541  hypothetical protein  24.81 
 
 		 1266 aa  271  4e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4277  hypothetical protein  24.69 
 
 		 1269 aa  272  4e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0938  hypothetical protein  24.61 
 
 		 1273 aa  270  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349009  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0461  conserved hypothetical protein  24.9 
 
 		 1266 aa  270  2e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.049997  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3830  hypothetical protein  24.77 
 
 		 1284 aa  270  2e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.238588  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3728  hypothetical protein  24.83 
 
 		 1266 aa  267  8.999999999999999e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4562  hypothetical protein  24.69 
 
 		 1266 aa  266  1e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0978  hypothetical protein  24.47 
 
 		 1271 aa  265  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0257  hypothetical protein  24.17 
 
 		 1276 aa  263  1e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3277  hypothetical protein  24.75 
 
 		 1266 aa  263  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.682788  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0268  hypothetical protein  24.02 
 
 		 1276 aa  257  8e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0471  hypothetical protein  25.82 
 
 		 1286 aa  258  8e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.356031  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4467  hypothetical protein  24.37 
 
 		 1271 aa  257  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00502079  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0380  hypothetical protein  26.17 
 
 		 1265 aa  256  2.0000000000000002e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0945  hypothetical protein  24.19 
 
 		 1271 aa  256  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0411  hypothetical protein  26.24 
 
 		 1274 aa  253  2e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.68904  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0188  hypothetical protein  22.64 
 
 		 1301 aa  252  3e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0861  membrane protein-like protein  23.86 
 
 		 1273 aa  252  4e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.835961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4406  hypothetical protein  24.11 
 
 		 1291 aa  252  4e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.213897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1193  hypothetical protein  24.28 
 
 		 1307 aa  248  6.999999999999999e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.879408  hitchhiker  0.00193389 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3632  hypothetical protein  24.14 
 
 		 1266 aa  247  9e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357405  normal  0.0273308 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3667  hypothetical protein  24.14 
 
 		 1266 aa  247  9e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3560  hypothetical protein  24.14 
 
 		 1266 aa  247  9e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3561  hypothetical protein  24.06 
 
 		 1266 aa  247  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3729  hypothetical protein  24.06 
 
 		 1266 aa  246  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.424475  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3682  hypothetical protein  23.43 
 
 		 1265 aa  246  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0579  hypothetical protein  22.37 
 
 		 1383 aa  244  1e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0470  hypothetical protein  24.09 
 
 		 1307 aa  244  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.196897  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12700  hypothetical protein  24.12 
 
 		 1277 aa  242  2.9999999999999997e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3672  hypothetical protein  24.5 
 
 		 1277 aa  240  1e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01889  hypothetical protein  25.08 
 
 		 1306 aa  240  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0403  hypothetical protein  24.39 
 
 		 1305 aa  239  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58090  hypothetical protein  24.38 
 
 		 1276 aa  237  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4397  hypothetical protein  23.22 
 
 		 1392 aa  237  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.963583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0488  hypothetical protein  21.8 
 
 		 1287 aa  234  1e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.135683  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5090  hypothetical protein  24.31 
 
 		 1275 aa  231  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.340947  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4555  putative protease  21.53 
 
 		 1323 aa  223  1.9999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3749  hypothetical protein  22 
 
 		 1439 aa  222  3.9999999999999997e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2839  hypothetical protein  21.75 
 
 		 1291 aa  209  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3467  hypothetical protein  25.58 
 
 		 1416 aa  202  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0527  hypothetical protein  24.42 
 
 		 1454 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03680  hypothetical protein  20.51 
 
 		 1266 aa  201  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0484  hypothetical protein  25.45 
 
 		 1417 aa  200  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.814446 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1735  membrane protein-like protein  23.51 
 
 		 1346 aa  199  3e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3643  hypothetical protein  24.71 
 
 		 1417 aa  197  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002388  possible exported protein  20.49 
 
 		 1301 aa  197  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.267234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>