125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2894 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc2657  hypothetical protein  78.58 
 
 
1426 aa  2227    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2335  hypothetical protein  33.91 
 
 
1368 aa  660    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1029  hypothetical protein  45 
 
 
1419 aa  1147    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3332  hypothetical protein  33.86 
 
 
1397 aa  663    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1298  hypothetical protein  33.57 
 
 
1397 aa  656    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438344  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3970  hypothetical protein  32.59 
 
 
1430 aa  673    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.231617 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0993  hypothetical protein  43.79 
 
 
1398 aa  1121    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.193482 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0490  hypothetical protein  33.67 
 
 
1397 aa  662    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1109  hypothetical protein  33.67 
 
 
1397 aa  662    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.823265  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3288  hypothetical protein  33.86 
 
 
1397 aa  665    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0218679  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3321  hypothetical protein  33.86 
 
 
1397 aa  664    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2216  hypothetical protein  33.91 
 
 
1372 aa  659    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0519007  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2488  hypothetical protein  95.65 
 
 
1426 aa  2707    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297377  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2507  hypothetical protein  31.67 
 
 
1419 aa  657    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380036  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0728  hypothetical protein  32.3 
 
 
1428 aa  665    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2894  putative transmembrane protein  100 
 
 
1426 aa  2860    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3829  hypothetical protein  31.39 
 
 
1399 aa  626  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0741  hypothetical protein  31.12 
 
 
1399 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77418  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0711  hypothetical protein  31.19 
 
 
1399 aa  621  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.463012  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0257  hypothetical protein  31.05 
 
 
1399 aa  619  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.866424  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0659  hypothetical protein  30.95 
 
 
1398 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0634  hypothetical protein  30.88 
 
 
1398 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.913326  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2643  hypothetical protein  31.69 
 
 
1399 aa  602  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.73761 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0366  hypothetical protein  31.97 
 
 
1381 aa  597  1e-169  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4831  hypothetical protein  32.57 
 
 
1420 aa  587  1e-166  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761382  normal  0.626491 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3897  hypothetical protein  30.99 
 
 
1379 aa  584  1.0000000000000001e-165  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.663381 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4656  hypothetical protein  31.53 
 
 
1425 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0849  hypothetical protein  31.32 
 
 
1384 aa  574  1.0000000000000001e-162  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3368  hypothetical protein  32.97 
 
 
1378 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.48731  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4655  hypothetical protein  30.29 
 
 
1441 aa  546  1e-154  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431718  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0243  putative transmembrane protein  31.75 
 
 
1472 aa  529  1e-148  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.150673  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1776  membrane protein-like protein  27.21 
 
 
1384 aa  501  1e-140  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1493  membrane protein-like protein  27.06 
 
 
1379 aa  484  1e-135  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3330  hypothetical protein  28.54 
 
 
1307 aa  478  1e-133  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000315008 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1218  hypothetical protein  30.35 
 
 
1341 aa  462  9.999999999999999e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0577669  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1744  hypothetical protein  26.53 
 
 
1284 aa  444  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0306491 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3520  putative transmembrane protein  27.99 
 
 
1450 aa  436  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0199259 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1057  hypothetical protein  27.24 
 
 
1264 aa  420  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0510  hypothetical protein  28.19 
 
 
1261 aa  411  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4018  hypothetical protein  30.45 
 
 
1418 aa  350  1e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.938248  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0461  hypothetical protein  24.41 
 
 
1266 aa  225  4e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00853598  normal  0.775435 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03105  conserved membrane protein, predicted transporter  24.41 
 
 
1266 aa  224  8e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0723003  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03056  hypothetical protein  24.41 
 
 
1266 aa  224  8e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.102838  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3541  hypothetical protein  24.16 
 
 
1266 aa  224  9e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3435  hypothetical protein  24.34 
 
 
1266 aa  224  9.999999999999999e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3277  hypothetical protein  24.45 
 
 
1266 aa  223  1.9999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.682788  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4406  hypothetical protein  24.15 
 
 
1291 aa  223  3e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.213897  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3728  hypothetical protein  24.34 
 
 
1266 aa  221  1e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4562  hypothetical protein  24.34 
 
 
1266 aa  220  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190737  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0461  conserved hypothetical protein  24.27 
 
 
1266 aa  219  4e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.049997  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3682  hypothetical protein  23.96 
 
 
1265 aa  213  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2270  membrane protein-like protein  24.46 
 
 
1304 aa  204  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2656  hypothetical protein  24.4 
 
 
1288 aa  201  1.0000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37084  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0403  hypothetical protein  23.12 
 
 
1305 aa  200  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1719  hypothetical protein  22.54 
 
 
1273 aa  199  3e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0470  hypothetical protein  23.09 
 
 
1307 aa  199  5.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.196897  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1988  membrane protein-like protein  23.41 
 
 
1300 aa  198  6e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0268  hypothetical protein  23.13 
 
 
1276 aa  194  8e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1719  hypothetical protein  22.58 
 
 
1273 aa  194  1e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1193  hypothetical protein  23.06 
 
 
1307 aa  192  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.879408  hitchhiker  0.00193389 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0257  hypothetical protein  23.16 
 
 
1276 aa  191  7e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3561  hypothetical protein  23.91 
 
 
1266 aa  189  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3729  hypothetical protein  23.91 
 
 
1266 aa  188  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.424475  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3560  hypothetical protein  23.91 
 
 
1266 aa  188  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3667  hypothetical protein  23.91 
 
 
1266 aa  188  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3672  hypothetical protein  23.49 
 
 
1277 aa  187  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3632  hypothetical protein  23.91 
 
 
1266 aa  187  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357405  normal  0.0273308 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4277  hypothetical protein  22.81 
 
 
1269 aa  187  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0978  hypothetical protein  23.08 
 
 
1271 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002388  possible exported protein  21.78 
 
 
1301 aa  182  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.267234  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0938  hypothetical protein  23.07 
 
 
1273 aa  179  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349009  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3830  hypothetical protein  24.25 
 
 
1284 aa  179  3e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.238588  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0488  hypothetical protein  22.32 
 
 
1287 aa  176  1.9999999999999998e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.135683  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03680  hypothetical protein  22.09 
 
 
1266 aa  174  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0188  hypothetical protein  20.66 
 
 
1301 aa  172  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2839  hypothetical protein  22.66 
 
 
1291 aa  171  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0410  hypothetical protein  22.95 
 
 
1309 aa  170  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.103346 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3467  hypothetical protein  21.57 
 
 
1416 aa  169  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3643  hypothetical protein  21.91 
 
 
1417 aa  164  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247251  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0484  hypothetical protein  21.8 
 
 
1417 aa  162  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.814446 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4093  hypothetical protein  21.84 
 
 
1390 aa  160  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2136  hypothetical protein  24.82 
 
 
1141 aa  160  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4467  hypothetical protein  22.07 
 
 
1271 aa  159  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00502079  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0945  hypothetical protein  23.09 
 
 
1271 aa  159  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0408  hypothetical protein  21.47 
 
 
1436 aa  152  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0380  hypothetical protein  22.31 
 
 
1265 aa  151  7e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3733  hypothetical protein  20.26 
 
 
1443 aa  151  8e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0579  hypothetical protein  20.92 
 
 
1383 aa  151  8e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4397  hypothetical protein  20.58 
 
 
1392 aa  150  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.963583  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2235  hypothetical protein  25.84 
 
 
1290 aa  148  6e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0843  hypothetical protein  22.33 
 
 
1267 aa  148  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.560634  normal  0.938035 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0563  hypothetical protein  20.85 
 
 
1419 aa  145  7e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72639  normal  0.280407 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0527  hypothetical protein  21.49 
 
 
1454 aa  144  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4158  hypothetical protein  21.46 
 
 
1271 aa  142  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0502  hypothetical protein  21.04 
 
 
1441 aa  142  6e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3817  hypothetical protein  21.23 
 
 
1459 aa  141  7e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0523  hypothetical protein  21 
 
 
1446 aa  140  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1505  membrane protein-like  21.53 
 
 
1283 aa  138  6.0000000000000005e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000453243  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1735  membrane protein-like protein  21.64 
 
 
1346 aa  138  9e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4555  putative protease  21.19 
 
 
1323 aa  137  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>