124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0579 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4093  hypothetical protein  72.05 
 
 		 1390 aa  2013    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0527  hypothetical protein  73.58 
 
 		 1454 aa  2154    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3329  hypothetical protein  44.36 
 
 		 1419 aa  1134    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3467  hypothetical protein  72.09 
 
 		 1416 aa  2044    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0484  hypothetical protein  71.58 
 
 		 1417 aa  2030    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.814446 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3733  hypothetical protein  47.77 
 
 		 1443 aa  1394    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3643  hypothetical protein  71.1 
 
 		 1417 aa  2027    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0472  membrane protein  43.51 
 
 		 1515 aa  733    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.50538 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3817  hypothetical protein  72.91 
 
 		 1459 aa  2142    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0408  hypothetical protein  52.62 
 
 		 1436 aa  1491    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0579  hypothetical protein  100 
 
 		 1383 aa  2820    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0502  hypothetical protein  74.08 
 
 		 1441 aa  2152    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0563  hypothetical protein  52.57 
 
 		 1419 aa  1507    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72639  normal  0.280407 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3749  hypothetical protein  49.76 
 
 		 1439 aa  1416    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0523  hypothetical protein  73.76 
 
 		 1446 aa  2150    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4397  hypothetical protein  53.22 
 
 		 1392 aa  1478    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.963583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0188  hypothetical protein  28.28 
 
 		 1301 aa  540  1e-151  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00269  putative protease  28.53 
 
 		 1331 aa  503  1e-141  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2839  hypothetical protein  27.58 
 
 		 1291 aa  498  1e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002388  possible exported protein  27.41 
 
 		 1301 aa  484  1e-135  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.267234  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03680  hypothetical protein  27.11 
 
 		 1266 aa  474  1e-132  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4555  putative protease  27.25 
 
 		 1323 aa  462  9.999999999999999e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0488  hypothetical protein  25.44 
 
 		 1287 aa  424  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.135683  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3672  hypothetical protein  25.67 
 
 		 1277 aa  401  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0257  hypothetical protein  25.44 
 
 		 1276 aa  402  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0403  hypothetical protein  25.02 
 
 		 1305 aa  402  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0268  hypothetical protein  25.02 
 
 		 1276 aa  394  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4406  hypothetical protein  25.35 
 
 		 1291 aa  395  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.213897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3830  hypothetical protein  24.16 
 
 		 1284 aa  388  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.238588  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1127  membrane protein-like protein  24.28 
 
 		 1294 aa  385  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.334782  normal  0.712644 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3682  hypothetical protein  24.77 
 
 		 1265 aa  387  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3541  hypothetical protein  23.81 
 
 		 1266 aa  363  1e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03105  conserved membrane protein, predicted transporter  23.74 
 
 		 1266 aa  361  5e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0723003  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03056  hypothetical protein  23.74 
 
 		 1266 aa  361  5e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.102838  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3728  hypothetical protein  23.81 
 
 		 1266 aa  361  6e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3435  hypothetical protein  23.74 
 
 		 1266 aa  361  7e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0461  conserved hypothetical protein  23.81 
 
 		 1266 aa  360  9.999999999999999e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.049997  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0461  hypothetical protein  23.66 
 
 		 1266 aa  358  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00853598  normal  0.775435 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4562  hypothetical protein  23.66 
 
 		 1266 aa  357  7.999999999999999e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3277  hypothetical protein  23.74 
 
 		 1266 aa  355  2.9999999999999997e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.682788  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3632  hypothetical protein  24.69 
 
 		 1266 aa  353  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357405  normal  0.0273308 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3729  hypothetical protein  24.62 
 
 		 1266 aa  352  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.424475  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3560  hypothetical protein  24.62 
 
 		 1266 aa  351  5e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3561  hypothetical protein  24.56 
 
 		 1266 aa  351  5e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3667  hypothetical protein  24.62 
 
 		 1266 aa  351  5e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0470  hypothetical protein  26.62 
 
 		 1307 aa  293  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.196897  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1193  hypothetical protein  26.37 
 
 		 1307 aa  291  4e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.879408  hitchhiker  0.00193389 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1719  hypothetical protein  21.11 
 
 		 1273 aa  250  2e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1719  hypothetical protein  20.96 
 
 		 1273 aa  245  3.9999999999999997e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3330  hypothetical protein  22.37 
 
 		 1307 aa  244  1e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000315008 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1744  hypothetical protein  22.28 
 
 		 1284 aa  243  2e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0306491 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0380  hypothetical protein  22.48 
 
 		 1265 aa  241  1e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4158  hypothetical protein  21.99 
 
 		 1271 aa  239  3e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1735  membrane protein-like protein  22.6 
 
 		 1346 aa  234  7.000000000000001e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4467  hypothetical protein  21.03 
 
 		 1271 aa  228  4e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00502079  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0410  hypothetical protein  22.3 
 
 		 1309 aa  225  4e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103346 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0510  hypothetical protein  24.22 
 
 		 1261 aa  223  1.9999999999999999e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2656  hypothetical protein  21.75 
 
 		 1288 aa  216  2.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37084  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0843  hypothetical protein  21.46 
 
 		 1267 aa  214  9e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.560634  normal  0.938035 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2270  membrane protein-like protein  21.51 
 
 		 1304 aa  211  8e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1218  hypothetical protein  22.29 
 
 		 1341 aa  209  4e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0577669  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12700  hypothetical protein  21.05 
 
 		 1277 aa  204  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4277  hypothetical protein  20.98 
 
 		 1269 aa  203  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1057  hypothetical protein  21.37 
 
 		 1264 aa  194  9e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0849  hypothetical protein  21.41 
 
 		 1384 aa  184  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0938  hypothetical protein  20.52 
 
 		 1273 aa  179  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4831  hypothetical protein  22.48 
 
 		 1420 aa  179  5e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761382  normal  0.626491 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3897  hypothetical protein  20.7 
 
 		 1379 aa  174  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.663381 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0978  hypothetical protein  20.37 
 
 		 1271 aa  174  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1942  membrane protein-like protein  21.63 
 
 		 1272 aa  171  8e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.307785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2899  hypothetical protein  22.22 
 
 		 1283 aa  171  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0945  hypothetical protein  20.25 
 
 		 1271 aa  170  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5159  hypothetical protein  20.19 
 
 		 1394 aa  163  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01889  hypothetical protein  22.44 
 
 		 1306 aa  159  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1029  hypothetical protein  20.42 
 
 		 1419 aa  155  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0243  putative transmembrane protein  22.73 
 
 		 1472 aa  154  8.999999999999999e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.150673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2894  putative transmembrane protein  20.55 
 
 		 1426 aa  151  8e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3829  hypothetical protein  22.54 
 
 		 1399 aa  147  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2643  hypothetical protein  22.2 
 
 		 1399 aa  145  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.73761 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1645  hypothetical protein  20.7 
 
 		 1153 aa  145  7e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000756943  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0741  hypothetical protein  22.67 
 
 		 1399 aa  144  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77418  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0512  hypothetical protein  20.7 
 
 		 1153 aa  144  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.350168  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0659  hypothetical protein  22.51 
 
 		 1398 aa  144  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0993  hypothetical protein  19.86 
 
 		 1398 aa  142  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.193482 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0634  hypothetical protein  22.51 
 
 		 1398 aa  143  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.913326  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0257  hypothetical protein  22.55 
 
 		 1399 aa  142  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.866424  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0411  hypothetical protein  20.95 
 
 		 1274 aa  140  1e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.68904  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2657  hypothetical protein  21.36 
 
 		 1426 aa  140  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0711  hypothetical protein  22.32 
 
 		 1399 aa  139  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.463012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0471  hypothetical protein  20.28 
 
 		 1286 aa  136  3e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.356031  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2507  hypothetical protein  21.92 
 
 		 1419 aa  136  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0861  membrane protein-like protein  21.83 
 
 		 1273 aa  133  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.835961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3187  exonuclease VII, small subunit  19.49 
 
 		 1380 aa  132  6e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3970  hypothetical protein  21.13 
 
 		 1430 aa  132  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.231617 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3520  putative transmembrane protein  27.33 
 
 		 1450 aa  122  6e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0199259 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3368  hypothetical protein  25.21 
 
 		 1378 aa  121  9e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.48731  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4018  hypothetical protein  25.21 
 
 		 1418 aa  120  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.938248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4656  hypothetical protein  24.36 
 
 		 1425 aa  120  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0728  hypothetical protein  20.51 
 
 		 1428 aa  119  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4655  hypothetical protein  20.82 
 
 		 1441 aa  115  8.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431718  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>