124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A3561 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03105  conserved membrane protein, predicted transporter  81.14 
 
 		 1266 aa  2142    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0723003  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0461  conserved hypothetical protein  81.14 
 
 		 1266 aa  2139    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.049997  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3672  hypothetical protein  51.06 
 
 		 1277 aa  1274    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03056  hypothetical protein  81.14 
 
 		 1266 aa  2142    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.102838  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3830  hypothetical protein  51.06 
 
 		 1284 aa  1297    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.238588  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3560  hypothetical protein  99.84 
 
 		 1266 aa  2560    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3729  hypothetical protein  99.61 
 
 		 1266 aa  2556    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.424475  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4562  hypothetical protein  81.06 
 
 		 1266 aa  2139    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3682  hypothetical protein  77.57 
 
 		 1265 aa  2065    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0403  hypothetical protein  50.65 
 
 		 1305 aa  1319    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3435  hypothetical protein  80.98 
 
 		 1266 aa  2136    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3728  hypothetical protein  81.22 
 
 		 1266 aa  2142    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4406  hypothetical protein  54.37 
 
 		 1291 aa  1429    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.213897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0257  hypothetical protein  53.44 
 
 		 1276 aa  1392    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1193  hypothetical protein  50.42 
 
 		 1307 aa  1314    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.879408  hitchhiker  0.00193389 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0470  hypothetical protein  50.57 
 
 		 1307 aa  1314    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.196897  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0461  hypothetical protein  81.14 
 
 		 1266 aa  2141    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00853598  normal  0.775435 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3541  hypothetical protein  81.22 
 
 		 1266 aa  2144    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0268  hypothetical protein  52.35 
 
 		 1276 aa  1365    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3277  hypothetical protein  81.14 
 
 		 1266 aa  2139    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.682788  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3561  hypothetical protein  100 
 
 		 1266 aa  2561    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3632  hypothetical protein  99.76 
 
 		 1266 aa  2557    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357405  normal  0.0273308 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3667  hypothetical protein  99.84 
 
 		 1266 aa  2560    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002388  possible exported protein  28.47 
 
 		 1301 aa  511  1e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.267234  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03680  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1266 aa  512  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0488  hypothetical protein  27.67 
 
 		 1287 aa  506  9.999999999999999e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.135683  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2839  hypothetical protein  27.61 
 
 		 1291 aa  463  1e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0188  hypothetical protein  25.04 
 
 		 1301 aa  423  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3733  hypothetical protein  25.88 
 
 		 1443 aa  399  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3749  hypothetical protein  25.99 
 
 		 1439 aa  390  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4555  putative protease  24.3 
 
 		 1323 aa  388  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0563  hypothetical protein  25.49 
 
 		 1419 aa  371  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72639  normal  0.280407 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00269  putative protease  25.27 
 
 		 1331 aa  368  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0408  hypothetical protein  25.56 
 
 		 1436 aa  365  2e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4397  hypothetical protein  24.83 
 
 		 1392 aa  362  2e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.963583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3467  hypothetical protein  24.9 
 
 		 1416 aa  362  4e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0484  hypothetical protein  25.13 
 
 		 1417 aa  358  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.814446 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3643  hypothetical protein  24.39 
 
 		 1417 aa  354  5.9999999999999994e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0579  hypothetical protein  24.56 
 
 		 1383 aa  351  5e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4093  hypothetical protein  24.38 
 
 		 1390 aa  347  1e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0527  hypothetical protein  24.5 
 
 		 1454 aa  337  1e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0502  hypothetical protein  24.68 
 
 		 1441 aa  337  1e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0523  hypothetical protein  24.35 
 
 		 1446 aa  335  4e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3817  hypothetical protein  24.35 
 
 		 1459 aa  332  2e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1127  membrane protein-like protein  22.9 
 
 		 1294 aa  315  3.9999999999999997e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.334782  normal  0.712644 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0472  membrane protein  27.28 
 
 		 1515 aa  279  3e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.50538 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3330  hypothetical protein  24.06 
 
 		 1307 aa  247  9.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000315008 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1719  hypothetical protein  21.98 
 
 		 1273 aa  245  3e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1744  hypothetical protein  22.6 
 
 		 1284 aa  242  2.9999999999999997e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0306491 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1719  hypothetical protein  21.79 
 
 		 1273 aa  241  4e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4467  hypothetical protein  22.96 
 
 		 1271 aa  237  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00502079  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2270  membrane protein-like protein  23.94 
 
 		 1304 aa  235  3e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0410  hypothetical protein  23.7 
 
 		 1309 aa  228  8e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103346 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4277  hypothetical protein  23.21 
 
 		 1269 aa  227  9e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0945  hypothetical protein  23.99 
 
 		 1271 aa  226  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4158  hypothetical protein  23.15 
 
 		 1271 aa  221  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3329  hypothetical protein  25.54 
 
 		 1419 aa  220  1e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0978  hypothetical protein  23.21 
 
 		 1271 aa  216  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0938  hypothetical protein  23.2 
 
 		 1273 aa  213  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5090  hypothetical protein  23.58 
 
 		 1275 aa  212  4e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.340947  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2899  hypothetical protein  23.79 
 
 		 1283 aa  211  6e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0510  hypothetical protein  23.78 
 
 		 1261 aa  207  8e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0366  hypothetical protein  22.75 
 
 		 1381 aa  206  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0843  hypothetical protein  22.66 
 
 		 1267 aa  205  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.560634  normal  0.938035 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58090  hypothetical protein  22.75 
 
 		 1276 aa  202  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0380  hypothetical protein  23.13 
 
 		 1265 aa  201  6e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2656  hypothetical protein  21.9 
 
 		 1288 aa  200  1.0000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37084  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2235  hypothetical protein  23.91 
 
 		 1290 aa  199  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0861  membrane protein-like protein  23.57 
 
 		 1273 aa  200  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.835961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12700  hypothetical protein  23.32 
 
 		 1277 aa  195  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5159  hypothetical protein  23.92 
 
 		 1394 aa  192  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3897  hypothetical protein  22.98 
 
 		 1379 aa  188  6e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.663381 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2657  hypothetical protein  23.49 
 
 		 1426 aa  187  8e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2894  putative transmembrane protein  23.91 
 
 		 1426 aa  187  9e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4831  hypothetical protein  24.05 
 
 		 1420 aa  187  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761382  normal  0.626491 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2488  hypothetical protein  23.45 
 
 		 1426 aa  186  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0849  hypothetical protein  24.41 
 
 		 1384 aa  185  5.0000000000000004e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1988  membrane protein-like protein  23.42 
 
 		 1300 aa  183  2e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3187  exonuclease VII, small subunit  21.89 
 
 		 1380 aa  180  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1942  membrane protein-like protein  20.57 
 
 		 1272 aa  178  6e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.307785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3368  hypothetical protein  23.73 
 
 		 1378 aa  178  7e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.48731  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01889  hypothetical protein  22.74 
 
 		 1306 aa  171  1e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1029  hypothetical protein  23.14 
 
 		 1419 aa  169  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0471  hypothetical protein  22.43 
 
 		 1286 aa  168  5.9999999999999996e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.356031  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1735  membrane protein-like protein  24 
 
 		 1346 aa  164  7e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0411  hypothetical protein  22.43 
 
 		 1274 aa  159  4e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.68904  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0993  hypothetical protein  22.78 
 
 		 1398 aa  157  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.193482 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2507  hypothetical protein  23.06 
 
 		 1419 aa  155  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1493  membrane protein-like protein  21.53 
 
 		 1379 aa  155  5.9999999999999996e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2136  hypothetical protein  23.99 
 
 		 1141 aa  152  4e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0243  putative transmembrane protein  23.08 
 
 		 1472 aa  149  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.150673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0512  hypothetical protein  21 
 
 		 1153 aa  144  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.350168  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1645  hypothetical protein  21 
 
 		 1153 aa  144  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000756943  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1057  hypothetical protein  21.35 
 
 		 1264 aa  143  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3520  putative transmembrane protein  22.33 
 
 		 1450 aa  140  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0199259 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1505  membrane protein-like  21.64 
 
 		 1283 aa  138  6.0000000000000005e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000453243  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1776  membrane protein-like protein  21.26 
 
 		 1384 aa  137  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0705  membrane protein-like protein  22.19 
 
 		 1224 aa  134  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.113545  hitchhiker  0.00000969857 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0634  hypothetical protein  24.64 
 
 		 1398 aa  131  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.913326  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0659  hypothetical protein  24.52 
 
 		 1398 aa  129  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>