124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A3632 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03105  conserved membrane protein, predicted transporter  80.98 
 
 
1266 aa  2138    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0723003  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0461  conserved hypothetical protein  80.98 
 
 
1266 aa  2136    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.049997  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3830  hypothetical protein  51.14 
 
 
1284 aa  1296    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.238588  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03056  hypothetical protein  80.98 
 
 
1266 aa  2138    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.102838  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3560  hypothetical protein  99.92 
 
 
1266 aa  2560    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3729  hypothetical protein  99.68 
 
 
1266 aa  2556    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.424475  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4562  hypothetical protein  80.9 
 
 
1266 aa  2135    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190737  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3672  hypothetical protein  51.14 
 
 
1277 aa  1273    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3682  hypothetical protein  77.57 
 
 
1265 aa  2061    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0403  hypothetical protein  50.69 
 
 
1305 aa  1320    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3435  hypothetical protein  80.82 
 
 
1266 aa  2133    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3728  hypothetical protein  81.06 
 
 
1266 aa  2138    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4406  hypothetical protein  54.52 
 
 
1291 aa  1429    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.213897  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0257  hypothetical protein  53.44 
 
 
1276 aa  1389    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1193  hypothetical protein  50.46 
 
 
1307 aa  1315    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.879408  hitchhiker  0.00193389 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0470  hypothetical protein  50.61 
 
 
1307 aa  1314    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.196897  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0461  hypothetical protein  80.98 
 
 
1266 aa  2138    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00853598  normal  0.775435 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3541  hypothetical protein  81.06 
 
 
1266 aa  2140    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0268  hypothetical protein  52.35 
 
 
1276 aa  1362    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3277  hypothetical protein  80.98 
 
 
1266 aa  2136    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.682788  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3561  hypothetical protein  99.76 
 
 
1266 aa  2557    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3632  hypothetical protein  100 
 
 
1266 aa  2563    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357405  normal  0.0273308 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3667  hypothetical protein  99.92 
 
 
1266 aa  2560    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03680  hypothetical protein  28.73 
 
 
1266 aa  514  1e-144  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002388  possible exported protein  28.47 
 
 
1301 aa  511  1e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.267234  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0488  hypothetical protein  27.59 
 
 
1287 aa  507  9.999999999999999e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.135683  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2839  hypothetical protein  27.61 
 
 
1291 aa  462  9.999999999999999e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0188  hypothetical protein  25.12 
 
 
1301 aa  423  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3733  hypothetical protein  25.79 
 
 
1443 aa  396  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3749  hypothetical protein  25.97 
 
 
1439 aa  390  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4555  putative protease  24.24 
 
 
1323 aa  386  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0563  hypothetical protein  25.47 
 
 
1419 aa  370  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72639  normal  0.280407 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00269  putative protease  25.33 
 
 
1331 aa  367  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0408  hypothetical protein  25.69 
 
 
1436 aa  364  7.0000000000000005e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4397  hypothetical protein  25.04 
 
 
1392 aa  363  2e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.963583  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3467  hypothetical protein  24.81 
 
 
1416 aa  358  3.9999999999999996e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0484  hypothetical protein  25.04 
 
 
1417 aa  355  4e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.814446 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0579  hypothetical protein  24.69 
 
 
1383 aa  353  2e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3643  hypothetical protein  24.45 
 
 
1417 aa  351  4e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247251  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4093  hypothetical protein  24.43 
 
 
1390 aa  344  5.999999999999999e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0502  hypothetical protein  24.81 
 
 
1441 aa  338  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0527  hypothetical protein  24.64 
 
 
1454 aa  338  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0523  hypothetical protein  24.48 
 
 
1446 aa  335  3e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3817  hypothetical protein  24.48 
 
 
1459 aa  333  1e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1127  membrane protein-like protein  23.12 
 
 
1294 aa  314  4.999999999999999e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.334782  normal  0.712644 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0472  membrane protein  27.28 
 
 
1515 aa  279  3e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.50538 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3330  hypothetical protein  24.14 
 
 
1307 aa  247  8e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000315008 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1719  hypothetical protein  21.91 
 
 
1273 aa  244  5e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1719  hypothetical protein  21.71 
 
 
1273 aa  242  2.9999999999999997e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1744  hypothetical protein  22.44 
 
 
1284 aa  241  5.999999999999999e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0306491 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2270  membrane protein-like protein  23.94 
 
 
1304 aa  238  7e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4467  hypothetical protein  23 
 
 
1271 aa  237  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00502079  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0410  hypothetical protein  23.7 
 
 
1309 aa  226  2e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.103346 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0945  hypothetical protein  23.98 
 
 
1271 aa  226  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4277  hypothetical protein  23.21 
 
 
1269 aa  226  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4158  hypothetical protein  23.19 
 
 
1271 aa  221  7.999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3329  hypothetical protein  25.54 
 
 
1419 aa  221  7.999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0978  hypothetical protein  23.16 
 
 
1271 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0938  hypothetical protein  23.15 
 
 
1273 aa  214  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349009  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5090  hypothetical protein  23.47 
 
 
1275 aa  212  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.340947  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2899  hypothetical protein  23.9 
 
 
1283 aa  212  3e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0510  hypothetical protein  23.63 
 
 
1261 aa  207  1e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0366  hypothetical protein  22.75 
 
 
1381 aa  207  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0843  hypothetical protein  22.6 
 
 
1267 aa  206  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.560634  normal  0.938035 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58090  hypothetical protein  22.63 
 
 
1276 aa  202  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0380  hypothetical protein  23.13 
 
 
1265 aa  201  9e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2235  hypothetical protein  23.99 
 
 
1290 aa  201  9e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0861  membrane protein-like protein  22.8 
 
 
1273 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.835961  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2656  hypothetical protein  21.75 
 
 
1288 aa  197  1e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37084  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12700  hypothetical protein  23.36 
 
 
1277 aa  196  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5159  hypothetical protein  24.03 
 
 
1394 aa  192  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2657  hypothetical protein  23.49 
 
 
1426 aa  187  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2894  putative transmembrane protein  23.91 
 
 
1426 aa  187  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0849  hypothetical protein  24.5 
 
 
1384 aa  186  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3897  hypothetical protein  22.91 
 
 
1379 aa  184  7e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.663381 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4831  hypothetical protein  24.03 
 
 
1420 aa  184  7e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761382  normal  0.626491 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2488  hypothetical protein  23.58 
 
 
1426 aa  184  7e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297377  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1988  membrane protein-like protein  23.43 
 
 
1300 aa  184  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1942  membrane protein-like protein  20.8 
 
 
1272 aa  181  5.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.307785  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3187  exonuclease VII, small subunit  22 
 
 
1380 aa  180  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3368  hypothetical protein  23.73 
 
 
1378 aa  177  9e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.48731  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1029  hypothetical protein  23.14 
 
 
1419 aa  169  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01889  hypothetical protein  22.14 
 
 
1306 aa  168  5.9999999999999996e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0471  hypothetical protein  22.33 
 
 
1286 aa  168  6.9999999999999995e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.356031  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1735  membrane protein-like protein  24.03 
 
 
1346 aa  164  9e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0411  hypothetical protein  22.31 
 
 
1274 aa  158  6e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.68904  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1493  membrane protein-like protein  21.68 
 
 
1379 aa  156  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0993  hypothetical protein  22.72 
 
 
1398 aa  155  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.193482 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2507  hypothetical protein  23.06 
 
 
1419 aa  155  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380036  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2136  hypothetical protein  24.08 
 
 
1141 aa  154  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0243  putative transmembrane protein  23.27 
 
 
1472 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.150673  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0512  hypothetical protein  21 
 
 
1153 aa  143  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.350168  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1645  hypothetical protein  21 
 
 
1153 aa  143  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000756943  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1057  hypothetical protein  21.35 
 
 
1264 aa  143  3e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3520  putative transmembrane protein  22.33 
 
 
1450 aa  140  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0199259 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1776  membrane protein-like protein  21.42 
 
 
1384 aa  138  8e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1505  membrane protein-like  21.51 
 
 
1283 aa  136  1.9999999999999998e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000453243  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0705  membrane protein-like protein  22.19 
 
 
1224 aa  133  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.113545  hitchhiker  0.00000969857 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0634  hypothetical protein  24.64 
 
 
1398 aa  131  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.913326  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0659  hypothetical protein  24.52 
 
 
1398 aa  129  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>