121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0978 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0938  hypothetical protein  98.98 
 
 		 1273 aa  2503    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349009  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4467  hypothetical protein  63.83 
 
 		 1271 aa  1645    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00502079  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12700  hypothetical protein  50.8 
 
 		 1277 aa  1201    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4158  hypothetical protein  64.22 
 
 		 1271 aa  1647    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0843  hypothetical protein  64.33 
 
 		 1267 aa  1662    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.560634  normal  0.938035 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58090  hypothetical protein  51.56 
 
 		 1276 aa  1202    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0861  membrane protein-like protein  52.74 
 
 		 1273 aa  1268    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.835961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0978  hypothetical protein  100 
 
 		 1271 aa  2528    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5090  hypothetical protein  51.44 
 
 		 1275 aa  1192    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.340947  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0945  hypothetical protein  93.71 
 
 		 1271 aa  2338    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4277  hypothetical protein  86.29 
 
 		 1269 aa  2202    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3187  exonuclease VII, small subunit  24.09 
 
 		 1380 aa  345  4e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2235  hypothetical protein  25.62 
 
 		 1290 aa  297  1e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1942  membrane protein-like protein  24.38 
 
 		 1272 aa  296  1e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.307785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3330  hypothetical protein  24.55 
 
 		 1307 aa  276  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000315008 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1744  hypothetical protein  22.79 
 
 		 1284 aa  259  2e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0306491 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2270  membrane protein-like protein  25.36 
 
 		 1304 aa  255  4.0000000000000004e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0410  hypothetical protein  27.86 
 
 		 1309 aa  244  7e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103346 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1719  hypothetical protein  21.68 
 
 		 1273 aa  244  1e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1719  hypothetical protein  21.73 
 
 		 1273 aa  243  2e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2656  hypothetical protein  22.64 
 
 		 1288 aa  238  4e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37084  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0849  hypothetical protein  24.24 
 
 		 1384 aa  234  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3682  hypothetical protein  23.31 
 
 		 1265 aa  232  3e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002388  possible exported protein  21.29 
 
 		 1301 aa  230  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.267234  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3729  hypothetical protein  23.33 
 
 		 1266 aa  229  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.424475  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3632  hypothetical protein  23.24 
 
 		 1266 aa  228  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357405  normal  0.0273308 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3667  hypothetical protein  23.24 
 
 		 1266 aa  228  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3560  hypothetical protein  23.24 
 
 		 1266 aa  228  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3561  hypothetical protein  23.24 
 
 		 1266 aa  227  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03680  hypothetical protein  21.25 
 
 		 1266 aa  219  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2899  hypothetical protein  24.39 
 
 		 1283 aa  219  4e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0510  hypothetical protein  24.59 
 
 		 1261 aa  218  7e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0268  hypothetical protein  22.17 
 
 		 1276 aa  217  9e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0257  hypothetical protein  22.15 
 
 		 1276 aa  208  5e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4397  hypothetical protein  21.76 
 
 		 1392 aa  207  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.963583  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3672  hypothetical protein  22.32 
 
 		 1277 aa  206  3e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1988  membrane protein-like protein  25 
 
 		 1300 aa  204  8e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4555  putative protease  21.38 
 
 		 1323 aa  204  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4406  hypothetical protein  23.4 
 
 		 1291 aa  204  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.213897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3520  putative transmembrane protein  24.24 
 
 		 1450 aa  204  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0199259 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0380  hypothetical protein  24.86 
 
 		 1265 aa  202  3e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3368  hypothetical protein  23.75 
 
 		 1378 aa  200  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.48731  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1218  hypothetical protein  24.48 
 
 		 1341 aa  199  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0577669  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1057  hypothetical protein  21.87 
 
 		 1264 aa  198  5.000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2839  hypothetical protein  21.55 
 
 		 1291 aa  198  5.000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3897  hypothetical protein  23.28 
 
 		 1379 aa  195  5e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.663381 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0579  hypothetical protein  20.37 
 
 		 1383 aa  192  2.9999999999999997e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3435  hypothetical protein  22.04 
 
 		 1266 aa  192  4e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03105  conserved membrane protein, predicted transporter  21.89 
 
 		 1266 aa  189  3e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0723003  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03056  hypothetical protein  21.89 
 
 		 1266 aa  189  3e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.102838  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0461  hypothetical protein  21.97 
 
 		 1266 aa  189  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00853598  normal  0.775435 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2894  putative transmembrane protein  23.16 
 
 		 1426 aa  189  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3728  hypothetical protein  22.12 
 
 		 1266 aa  187  8e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0461  conserved hypothetical protein  21.98 
 
 		 1266 aa  187  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.049997  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3541  hypothetical protein  21.88 
 
 		 1266 aa  186  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3277  hypothetical protein  22.21 
 
 		 1266 aa  186  3e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.682788  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3749  hypothetical protein  22.58 
 
 		 1439 aa  185  4.0000000000000006e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3733  hypothetical protein  21.21 
 
 		 1443 aa  185  6e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2723  membrane protein-like  33.73 
 
 		 1236 aa  182  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.439608  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4562  hypothetical protein  21.74 
 
 		 1266 aa  181  5.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0488  hypothetical protein  19.5 
 
 		 1287 aa  181  9e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.135683  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0188  hypothetical protein  21.92 
 
 		 1301 aa  180  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2488  hypothetical protein  23.48 
 
 		 1426 aa  179  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297377  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2657  hypothetical protein  23.75 
 
 		 1426 aa  178  5e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5159  hypothetical protein  23.76 
 
 		 1394 aa  177  8e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0411  hypothetical protein  22.84 
 
 		 1274 aa  177  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.68904  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01889  hypothetical protein  24.55 
 
 		 1306 aa  177  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0366  hypothetical protein  22.83 
 
 		 1381 aa  173  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0471  hypothetical protein  22.71 
 
 		 1286 aa  173  2e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.356031  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0993  hypothetical protein  22.77 
 
 		 1398 aa  172  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.193482 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1127  membrane protein-like protein  20.41 
 
 		 1294 aa  171  6e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.334782  normal  0.712644 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4831  hypothetical protein  22.81 
 
 		 1420 aa  163  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761382  normal  0.626491 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3329  hypothetical protein  22.26 
 
 		 1419 aa  162  5e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1029  hypothetical protein  23.32 
 
 		 1419 aa  161  9e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0408  hypothetical protein  22.43 
 
 		 1436 aa  160  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3643  hypothetical protein  21.33 
 
 		 1417 aa  158  8e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0563  hypothetical protein  23.06 
 
 		 1419 aa  156  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72639  normal  0.280407 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3467  hypothetical protein  21.33 
 
 		 1416 aa  154  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0512  hypothetical protein  20.65 
 
 		 1153 aa  154  1e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.350168  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0243  putative transmembrane protein  23.69 
 
 		 1472 aa  153  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.150673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4656  hypothetical protein  23.38 
 
 		 1425 aa  152  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4655  hypothetical protein  22.74 
 
 		 1441 aa  152  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2136  hypothetical protein  24.45 
 
 		 1141 aa  150  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1645  hypothetical protein  20.42 
 
 		 1153 aa  150  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000756943  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4018  hypothetical protein  24.15 
 
 		 1418 aa  150  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.938248  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4093  hypothetical protein  20.98 
 
 		 1390 aa  148  8.000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0484  hypothetical protein  21.15 
 
 		 1417 aa  146  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.814446 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3817  hypothetical protein  20.46 
 
 		 1459 aa  142  6e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0470  hypothetical protein  21.86 
 
 		 1307 aa  141  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.196897  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0403  hypothetical protein  21.86 
 
 		 1305 aa  140  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1193  hypothetical protein  21.86 
 
 		 1307 aa  140  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.879408  hitchhiker  0.00193389 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0527  hypothetical protein  20.21 
 
 		 1454 aa  140  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1493  membrane protein-like protein  21.52 
 
 		 1379 aa  137  9e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0523  hypothetical protein  19.4 
 
 		 1446 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00269  putative protease  18.71 
 
 		 1331 aa  135  5e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0502  hypothetical protein  19.95 
 
 		 1441 aa  135  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0705  membrane protein-like protein  22.71 
 
 		 1224 aa  127  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.113545  hitchhiker  0.00000969857 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1776  membrane protein-like protein  19.81 
 
 		 1384 aa  126  3e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1735  membrane protein-like protein  22.97 
 
 		 1346 aa  122  4.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0711  hypothetical protein  22.76 
 
 		 1399 aa  121  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.463012  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>