126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3329 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4093  hypothetical protein  44.43 
 
 		 1390 aa  1153    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3329  hypothetical protein  100 
 
 		 1419 aa  2848    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3467  hypothetical protein  45.9 
 
 		 1416 aa  1184    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0484  hypothetical protein  45.04 
 
 		 1417 aa  1176    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.814446 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3733  hypothetical protein  45.86 
 
 		 1443 aa  1286    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3643  hypothetical protein  45.25 
 
 		 1417 aa  1179    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3817  hypothetical protein  44.01 
 
 		 1459 aa  1157    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0408  hypothetical protein  43.59 
 
 		 1436 aa  1153    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0579  hypothetical protein  44.39 
 
 		 1383 aa  1190    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0527  hypothetical protein  44.22 
 
 		 1454 aa  1159    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0502  hypothetical protein  44.15 
 
 		 1441 aa  1158    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0563  hypothetical protein  43.14 
 
 		 1419 aa  1149    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72639  normal  0.280407 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3749  hypothetical protein  43.81 
 
 		 1439 aa  1115    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0523  hypothetical protein  44.37 
 
 		 1446 aa  1158    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4397  hypothetical protein  43.44 
 
 		 1392 aa  1129    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.963583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0472  membrane protein  38.21 
 
 		 1515 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.50538 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0188  hypothetical protein  25.86 
 
 		 1301 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4555  putative protease  26.73 
 
 		 1323 aa  459  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2839  hypothetical protein  26.17 
 
 		 1291 aa  434  1e-120  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03680  hypothetical protein  25.26 
 
 		 1266 aa  414  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00269  putative protease  25.88 
 
 		 1331 aa  412  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002388  possible exported protein  25.25 
 
 		 1301 aa  407  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.267234  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1127  membrane protein-like protein  24.75 
 
 		 1294 aa  388  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.334782  normal  0.712644 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3682  hypothetical protein  24.48 
 
 		 1265 aa  347  7e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3561  hypothetical protein  25.02 
 
 		 1266 aa  335  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3632  hypothetical protein  25 
 
 		 1266 aa  335  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357405  normal  0.0273308 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3560  hypothetical protein  25 
 
 		 1266 aa  334  7.000000000000001e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3667  hypothetical protein  25 
 
 		 1266 aa  334  7.000000000000001e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3729  hypothetical protein  24.86 
 
 		 1266 aa  333  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.424475  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4406  hypothetical protein  27.48 
 
 		 1291 aa  280  2e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.213897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0488  hypothetical protein  25.74 
 
 		 1287 aa  273  2e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.135683  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0470  hypothetical protein  25.61 
 
 		 1307 aa  271  5.9999999999999995e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.196897  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0403  hypothetical protein  25.61 
 
 		 1305 aa  270  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1193  hypothetical protein  25.61 
 
 		 1307 aa  270  2e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.879408  hitchhiker  0.00193389 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0268  hypothetical protein  24.42 
 
 		 1276 aa  251  7e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3830  hypothetical protein  24.4 
 
 		 1284 aa  243  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.238588  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0257  hypothetical protein  24.01 
 
 		 1276 aa  239  4e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0461  conserved hypothetical protein  25.79 
 
 		 1266 aa  234  6e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.049997  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4562  hypothetical protein  25.28 
 
 		 1266 aa  235  6e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3728  hypothetical protein  25.17 
 
 		 1266 aa  234  7.000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3277  hypothetical protein  25.17 
 
 		 1266 aa  233  1e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.682788  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3435  hypothetical protein  25.81 
 
 		 1266 aa  233  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0461  hypothetical protein  25.9 
 
 		 1266 aa  233  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00853598  normal  0.775435 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03105  conserved membrane protein, predicted transporter  26.01 
 
 		 1266 aa  232  3e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0723003  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03056  hypothetical protein  26.01 
 
 		 1266 aa  232  3e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.102838  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3541  hypothetical protein  24.83 
 
 		 1266 aa  232  3e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1744  hypothetical protein  21.8 
 
 		 1284 aa  219  2.9999999999999998e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0306491 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3330  hypothetical protein  21.79 
 
 		 1307 aa  212  4e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000315008 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0410  hypothetical protein  22.65 
 
 		 1309 aa  212  4e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103346 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3672  hypothetical protein  23.11 
 
 		 1277 aa  211  6e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0849  hypothetical protein  22.15 
 
 		 1384 aa  191  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4467  hypothetical protein  22.75 
 
 		 1271 aa  188  6e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00502079  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4158  hypothetical protein  22.16 
 
 		 1271 aa  183  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4277  hypothetical protein  22.99 
 
 		 1269 aa  181  8e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1988  membrane protein-like protein  22.62 
 
 		 1300 aa  181  9e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0843  hypothetical protein  20.85 
 
 		 1267 aa  180  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.560634  normal  0.938035 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0945  hypothetical protein  21.11 
 
 		 1271 aa  168  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3897  hypothetical protein  22.16 
 
 		 1379 aa  164  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.663381 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12700  hypothetical protein  21.75 
 
 		 1277 aa  163  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1029  hypothetical protein  20.78 
 
 		 1419 aa  160  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3520  putative transmembrane protein  22.23 
 
 		 1450 aa  159  5.0000000000000005e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0199259 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01889  hypothetical protein  22.76 
 
 		 1306 aa  157  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3187  exonuclease VII, small subunit  19.97 
 
 		 1380 aa  155  5e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4831  hypothetical protein  22.65 
 
 		 1420 aa  155  5e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761382  normal  0.626491 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58090  hypothetical protein  21.54 
 
 		 1276 aa  154  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1719  hypothetical protein  20.97 
 
 		 1273 aa  147  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0243  putative transmembrane protein  22.87 
 
 		 1472 aa  147  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.150673  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1719  hypothetical protein  20.68 
 
 		 1273 aa  147  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5159  hypothetical protein  21.4 
 
 		 1394 aa  143  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2894  putative transmembrane protein  20.75 
 
 		 1426 aa  142  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0993  hypothetical protein  20.89 
 
 		 1398 aa  141  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.193482 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1505  membrane protein-like  22.49 
 
 		 1283 aa  133  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000453243  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2488  hypothetical protein  20.35 
 
 		 1426 aa  133  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1645  hypothetical protein  20.61 
 
 		 1153 aa  130  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000756943  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0512  hypothetical protein  20.54 
 
 		 1153 aa  129  4.0000000000000003e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.350168  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1776  membrane protein-like protein  21.42 
 
 		 1384 aa  128  9e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3321  hypothetical protein  22.77 
 
 		 1397 aa  127  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2235  hypothetical protein  21.89 
 
 		 1290 aa  126  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0380  hypothetical protein  23.03 
 
 		 1265 aa  124  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0978  hypothetical protein  21.38 
 
 		 1271 aa  123  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2643  hypothetical protein  22.63 
 
 		 1399 aa  121  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.73761 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0510  hypothetical protein  28.3 
 
 		 1261 aa  119  6e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1735  membrane protein-like protein  22.44 
 
 		 1346 aa  117  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0938  hypothetical protein  22.11 
 
 		 1273 aa  117  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349009  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2657  hypothetical protein  20.02 
 
 		 1426 aa  114  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0711  hypothetical protein  22.75 
 
 		 1399 aa  114  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.463012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3829  hypothetical protein  22.83 
 
 		 1399 aa  113  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0741  hypothetical protein  22.75 
 
 		 1399 aa  113  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77418  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0257  hypothetical protein  22.64 
 
 		 1399 aa  111  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.866424  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2723  membrane protein-like  23.68 
 
 		 1236 aa  111  9.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.439608  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0634  hypothetical protein  22.78 
 
 		 1398 aa  110  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.913326  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2899  hypothetical protein  26.26 
 
 		 1283 aa  111  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0659  hypothetical protein  22.56 
 
 		 1398 aa  110  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2656  hypothetical protein  20.52 
 
 		 1288 aa  109  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37084  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1057  hypothetical protein  25.63 
 
 		 1264 aa  107  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4656  hypothetical protein  27.41 
 
 		 1425 aa  107  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2270  membrane protein-like protein  23.58 
 
 		 1304 aa  106  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0861  membrane protein-like protein  23.89 
 
 		 1273 aa  104  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.835961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3368  hypothetical protein  26.94 
 
 		 1378 aa  104  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.48731  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1218  hypothetical protein  25.84 
 
 		 1341 aa  103  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0577669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>