125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0472 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4093  hypothetical protein  45.33 
 
 		 1390 aa  740    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0527  hypothetical protein  45.79 
 
 		 1454 aa  743    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3467  hypothetical protein  45.73 
 
 		 1416 aa  736    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0484  hypothetical protein  45.73 
 
 		 1417 aa  734    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.814446 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3733  hypothetical protein  39.46 
 
 		 1443 aa  662    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3643  hypothetical protein  45.96 
 
 		 1417 aa  735    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0472  membrane protein  100 
 
 		 1515 aa  3052    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.50538 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3817  hypothetical protein  45.79 
 
 		 1459 aa  745    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0408  hypothetical protein  47.64 
 
 		 1436 aa  773    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0579  hypothetical protein  43.51 
 
 		 1383 aa  733    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0502  hypothetical protein  45.56 
 
 		 1441 aa  742    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0563  hypothetical protein  42.3 
 
 		 1419 aa  730    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72639  normal  0.280407 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3749  hypothetical protein  39.34 
 
 		 1439 aa  706    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0523  hypothetical protein  45.56 
 
 		 1446 aa  741    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4397  hypothetical protein  43.35 
 
 		 1392 aa  709    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.963583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3329  hypothetical protein  37.79 
 
 		 1419 aa  570  1e-161  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0188  hypothetical protein  27.96 
 
 		 1301 aa  340  9.999999999999999e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2839  hypothetical protein  29.33 
 
 		 1291 aa  312  4e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002388  possible exported protein  28.36 
 
 		 1301 aa  298  4e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.267234  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3682  hypothetical protein  27.26 
 
 		 1265 aa  296  2e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4555  putative protease  26.3 
 
 		 1323 aa  293  1e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03680  hypothetical protein  28.02 
 
 		 1266 aa  288  5e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4406  hypothetical protein  27.29 
 
 		 1291 aa  288  5.999999999999999e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.213897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0257  hypothetical protein  26.42 
 
 		 1276 aa  283  2e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3729  hypothetical protein  27.28 
 
 		 1266 aa  280  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.424475  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0403  hypothetical protein  26.49 
 
 		 1305 aa  279  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3541  hypothetical protein  27.01 
 
 		 1266 aa  279  3e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03105  conserved membrane protein, predicted transporter  27.01 
 
 		 1266 aa  278  4e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0723003  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4562  hypothetical protein  27.01 
 
 		 1266 aa  278  4e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3435  hypothetical protein  26.75 
 
 		 1266 aa  278  4e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1193  hypothetical protein  26.49 
 
 		 1307 aa  278  4e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.879408  hitchhiker  0.00193389 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03056  hypothetical protein  27.01 
 
 		 1266 aa  278  4e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.102838  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3277  hypothetical protein  26.9 
 
 		 1266 aa  278  4e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.682788  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3560  hypothetical protein  27.28 
 
 		 1266 aa  278  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3667  hypothetical protein  27.28 
 
 		 1266 aa  278  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3561  hypothetical protein  27.28 
 
 		 1266 aa  278  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0461  hypothetical protein  27.01 
 
 		 1266 aa  278  5e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00853598  normal  0.775435 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3632  hypothetical protein  27.28 
 
 		 1266 aa  278  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357405  normal  0.0273308 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0470  hypothetical protein  26.49 
 
 		 1307 aa  278  8e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.196897  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3728  hypothetical protein  26.64 
 
 		 1266 aa  276  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0461  conserved hypothetical protein  26.64 
 
 		 1266 aa  275  6e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.049997  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0268  hypothetical protein  26.03 
 
 		 1276 aa  273  2e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0488  hypothetical protein  25.36 
 
 		 1287 aa  270  1e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.135683  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3830  hypothetical protein  25.23 
 
 		 1284 aa  259  2e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.238588  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00269  putative protease  26.1 
 
 		 1331 aa  256  2.0000000000000002e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3672  hypothetical protein  25.74 
 
 		 1277 aa  254  7e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1127  membrane protein-like protein  24.43 
 
 		 1294 aa  247  9.999999999999999e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.334782  normal  0.712644 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2270  membrane protein-like protein  24.4 
 
 		 1304 aa  165  6e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3330  hypothetical protein  26.95 
 
 		 1307 aa  143  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000315008 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1218  hypothetical protein  24.5 
 
 		 1341 aa  139  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0577669  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1744  hypothetical protein  22.1 
 
 		 1284 aa  139  4e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0306491 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1735  membrane protein-like protein  23.09 
 
 		 1346 aa  135  6.999999999999999e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4467  hypothetical protein  23.19 
 
 		 1271 aa  131  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00502079  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0843  hypothetical protein  24.45 
 
 		 1267 aa  130  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.560634  normal  0.938035 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0861  membrane protein-like protein  23.52 
 
 		 1273 aa  127  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.835961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5159  hypothetical protein  25.19 
 
 		 1394 aa  125  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0380  hypothetical protein  23 
 
 		 1265 aa  124  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4158  hypothetical protein  23.53 
 
 		 1271 aa  123  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4656  hypothetical protein  25.75 
 
 		 1425 aa  123  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4277  hypothetical protein  23.13 
 
 		 1269 aa  123  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1057  hypothetical protein  25.07 
 
 		 1264 aa  120  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4831  hypothetical protein  23.32 
 
 		 1420 aa  120  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761382  normal  0.626491 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3368  hypothetical protein  25.74 
 
 		 1378 aa  119  5e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.48731  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1719  hypothetical protein  20.74 
 
 		 1273 aa  119  6e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4018  hypothetical protein  26.1 
 
 		 1418 aa  118  7.999999999999999e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.938248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0978  hypothetical protein  23.96 
 
 		 1271 aa  118  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0945  hypothetical protein  23.45 
 
 		 1271 aa  118  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0938  hypothetical protein  23.58 
 
 		 1273 aa  118  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0510  hypothetical protein  27.7 
 
 		 1261 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1719  hypothetical protein  20.47 
 
 		 1273 aa  117  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0711  hypothetical protein  25 
 
 		 1399 aa  117  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.463012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0410  hypothetical protein  24.2 
 
 		 1309 aa  116  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103346 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3970  hypothetical protein  22.41 
 
 		 1430 aa  115  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.231617 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0257  hypothetical protein  24.75 
 
 		 1399 aa  115  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.866424  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0741  hypothetical protein  24.75 
 
 		 1399 aa  115  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77418  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0243  putative transmembrane protein  25 
 
 		 1472 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.150673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2507  hypothetical protein  24.75 
 
 		 1419 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0512  hypothetical protein  20.64 
 
 		 1153 aa  114  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.350168  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1645  hypothetical protein  20.64 
 
 		 1153 aa  114  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000756943  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12700  hypothetical protein  24.25 
 
 		 1277 aa  113  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0849  hypothetical protein  23.26 
 
 		 1384 aa  109  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3897  hypothetical protein  23.92 
 
 		 1379 aa  108  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.663381 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0728  hypothetical protein  21.68 
 
 		 1428 aa  108  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2899  hypothetical protein  26.01 
 
 		 1283 aa  108  6e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2643  hypothetical protein  23.14 
 
 		 1399 aa  108  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.73761 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2656  hypothetical protein  22.12 
 
 		 1288 aa  107  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37084  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0993  hypothetical protein  22.28 
 
 		 1398 aa  107  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.193482 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3829  hypothetical protein  23.56 
 
 		 1399 aa  106  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0634  hypothetical protein  23.88 
 
 		 1398 aa  106  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.913326  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0659  hypothetical protein  23.63 
 
 		 1398 aa  105  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0366  hypothetical protein  21.8 
 
 		 1381 aa  105  7e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2723  membrane protein-like  25.21 
 
 		 1236 aa  103  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.439608  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1029  hypothetical protein  22.75 
 
 		 1419 aa  103  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1298  hypothetical protein  24.21 
 
 		 1397 aa  103  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438344  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01889  hypothetical protein  25.35 
 
 		 1306 aa  102  6e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3187  exonuclease VII, small subunit  20.48 
 
 		 1380 aa  100  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3520  putative transmembrane protein  25.17 
 
 		 1450 aa  100  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0199259 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3288  hypothetical protein  23.75 
 
 		 1397 aa  100  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0218679  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0490  hypothetical protein  23.75 
 
 		 1397 aa  99.8  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3321  hypothetical protein  23.75 
 
 		 1397 aa  99.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>