121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2723 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2723  membrane protein-like  100 
 
 
1236 aa  2455    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.439608  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4158  hypothetical protein  25.72 
 
 
1271 aa  299  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0861  membrane protein-like protein  26.55 
 
 
1273 aa  298  3e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.835961  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58090  hypothetical protein  32.05 
 
 
1276 aa  196  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5090  hypothetical protein  32.34 
 
 
1275 aa  196  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.340947  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4467  hypothetical protein  32.84 
 
 
1271 aa  191  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00502079  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0843  hypothetical protein  31.14 
 
 
1267 aa  186  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.560634  normal  0.938035 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4277  hypothetical protein  31.55 
 
 
1269 aa  171  8e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0938  hypothetical protein  34.93 
 
 
1273 aa  170  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349009  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0978  hypothetical protein  35.06 
 
 
1271 aa  170  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12700  hypothetical protein  29.86 
 
 
1277 aa  169  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0945  hypothetical protein  34.19 
 
 
1271 aa  166  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0512  hypothetical protein  20.43 
 
 
1153 aa  163  2e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.350168  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1645  hypothetical protein  20.51 
 
 
1153 aa  162  5e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000756943  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3330  hypothetical protein  22.66 
 
 
1307 aa  157  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000315008 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3187  exonuclease VII, small subunit  27.98 
 
 
1380 aa  155  4e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1719  hypothetical protein  23 
 
 
1273 aa  154  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2235  hypothetical protein  34.56 
 
 
1290 aa  149  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1719  hypothetical protein  22.5 
 
 
1273 aa  145  5e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1127  membrane protein-like protein  21.79 
 
 
1294 aa  133  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.334782  normal  0.712644 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0410  hypothetical protein  28.05 
 
 
1309 aa  132  3e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.103346 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1942  membrane protein-like protein  27.48 
 
 
1272 aa  131  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.307785  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4397  hypothetical protein  25.56 
 
 
1392 aa  128  6e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.963583  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3749  hypothetical protein  25.78 
 
 
1439 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2656  hypothetical protein  24.79 
 
 
1288 aa  117  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37084  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3682  hypothetical protein  22.25 
 
 
1265 aa  115  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0563  hypothetical protein  24.23 
 
 
1419 aa  114  9e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72639  normal  0.280407 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0408  hypothetical protein  23.63 
 
 
1436 aa  112  5e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3643  hypothetical protein  26.67 
 
 
1417 aa  110  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247251  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2136  hypothetical protein  30.29 
 
 
1141 aa  109  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0257  hypothetical protein  22.67 
 
 
1276 aa  108  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1988  membrane protein-like protein  31.71 
 
 
1300 aa  108  9e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0579  hypothetical protein  25.93 
 
 
1383 aa  107  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4093  hypothetical protein  26.3 
 
 
1390 aa  106  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1744  hypothetical protein  34.91 
 
 
1284 aa  106  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0306491 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3467  hypothetical protein  25.93 
 
 
1416 aa  105  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0484  hypothetical protein  25.93 
 
 
1417 aa  105  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.814446 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0472  membrane protein  25.21 
 
 
1515 aa  104  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.50538 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0268  hypothetical protein  22.2 
 
 
1276 aa  103  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0527  hypothetical protein  25.56 
 
 
1454 aa  103  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3733  hypothetical protein  22.89 
 
 
1443 aa  103  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1218  hypothetical protein  28.15 
 
 
1341 aa  103  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0577669  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0523  hypothetical protein  25.56 
 
 
1446 aa  102  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3277  hypothetical protein  22.22 
 
 
1266 aa  102  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.682788  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3817  hypothetical protein  25.56 
 
 
1459 aa  102  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3435  hypothetical protein  21.78 
 
 
1266 aa  102  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0502  hypothetical protein  25.56 
 
 
1441 aa  102  6e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03105  conserved membrane protein, predicted transporter  21.73 
 
 
1266 aa  101  9e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0723003  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03056  hypothetical protein  21.73 
 
 
1266 aa  101  9e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.102838  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3541  hypothetical protein  21.95 
 
 
1266 aa  100  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0461  hypothetical protein  21.85 
 
 
1266 aa  100  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00853598  normal  0.775435 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4406  hypothetical protein  25.98 
 
 
1291 aa  99.4  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.213897  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00269  putative protease  22.89 
 
 
1331 aa  99.4  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03680  hypothetical protein  24.09 
 
 
1266 aa  98.6  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4562  hypothetical protein  21.85 
 
 
1266 aa  98.2  8e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190737  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3728  hypothetical protein  21.83 
 
 
1266 aa  97.8  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0461  conserved hypothetical protein  21.71 
 
 
1266 aa  96.7  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.049997  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3830  hypothetical protein  25.19 
 
 
1284 aa  96.7  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.238588  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3672  hypothetical protein  22.42 
 
 
1277 aa  94.4  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0403  hypothetical protein  26.09 
 
 
1305 aa  94.4  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002388  possible exported protein  22.47 
 
 
1301 aa  94  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.267234  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0411  hypothetical protein  25 
 
 
1274 aa  93.2  3e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.68904  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3632  hypothetical protein  27.88 
 
 
1266 aa  93.2  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357405  normal  0.0273308 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0510  hypothetical protein  24.72 
 
 
1261 aa  92.4  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0470  hypothetical protein  26.22 
 
 
1307 aa  92.4  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.196897  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3729  hypothetical protein  27.51 
 
 
1266 aa  91.7  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.424475  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3667  hypothetical protein  27.51 
 
 
1266 aa  91.7  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3561  hypothetical protein  27.51 
 
 
1266 aa  92  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3560  hypothetical protein  27.51 
 
 
1266 aa  91.7  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0471  hypothetical protein  24.64 
 
 
1286 aa  91.7  9e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.356031  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2839  hypothetical protein  24.06 
 
 
1291 aa  91.3  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4555  putative protease  22.97 
 
 
1323 aa  90.5  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1193  hypothetical protein  26.22 
 
 
1307 aa  90.9  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.879408  hitchhiker  0.00193389 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1505  membrane protein-like  25.09 
 
 
1283 aa  90.1  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000453243  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1735  membrane protein-like protein  28.16 
 
 
1346 aa  89.7  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5159  hypothetical protein  28.1 
 
 
1394 aa  89.4  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2899  hypothetical protein  25.53 
 
 
1283 aa  87  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2270  membrane protein-like protein  27.43 
 
 
1304 aa  85.9  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0188  hypothetical protein  23.2 
 
 
1301 aa  85.5  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01889  hypothetical protein  24.56 
 
 
1306 aa  84.3  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0380  hypothetical protein  29.41 
 
 
1265 aa  83.6  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3329  hypothetical protein  22.56 
 
 
1419 aa  83.6  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2894  putative transmembrane protein  22.32 
 
 
1426 aa  83.6  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4655  hypothetical protein  29.71 
 
 
1441 aa  81.6  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431718  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2488  hypothetical protein  22.63 
 
 
1426 aa  80.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297377  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0488  hypothetical protein  19.46 
 
 
1287 aa  80.1  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.135683  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3897  hypothetical protein  27.43 
 
 
1379 aa  77.8  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.663381 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0366  hypothetical protein  24.43 
 
 
1381 aa  75.1  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0243  putative transmembrane protein  27.49 
 
 
1472 aa  75.5  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.150673  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1029  hypothetical protein  30 
 
 
1419 aa  74.7  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1057  hypothetical protein  31.87 
 
 
1264 aa  74.3  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4831  hypothetical protein  26.19 
 
 
1420 aa  74.7  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761382  normal  0.626491 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0634  hypothetical protein  22.14 
 
 
1398 aa  73.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.913326  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0659  hypothetical protein  22.14 
 
 
1398 aa  72.8  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0849  hypothetical protein  21.98 
 
 
1384 aa  72.4  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4656  hypothetical protein  26.74 
 
 
1425 aa  70.9  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3368  hypothetical protein  29.65 
 
 
1378 aa  70.5  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.48731  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0993  hypothetical protein  26.47 
 
 
1398 aa  69.3  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.193482 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4018  hypothetical protein  29.65 
 
 
1418 aa  69.3  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.938248  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2643  hypothetical protein  22.12 
 
 
1399 aa  68.9  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.73761 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>