127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4656 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_0366  hypothetical protein  54.65 
 
 
1381 aa  1463    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4655  hypothetical protein  53.99 
 
 
1441 aa  1422    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431718  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4656  hypothetical protein  100 
 
 
1425 aa  2791    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3897  hypothetical protein  54.51 
 
 
1379 aa  1395    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.663381 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4018  hypothetical protein  62.11 
 
 
1418 aa  1149    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.938248  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4831  hypothetical protein  58.99 
 
 
1420 aa  1548    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761382  normal  0.626491 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0243  putative transmembrane protein  43.29 
 
 
1472 aa  965    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.150673  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0849  hypothetical protein  53.28 
 
 
1384 aa  1403    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5159  hypothetical protein  53.53 
 
 
1394 aa  1310    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3368  hypothetical protein  63.35 
 
 
1378 aa  1657    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.48731  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3520  putative transmembrane protein  34.03 
 
 
1450 aa  669    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0199259 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0993  hypothetical protein  32.81 
 
 
1398 aa  635  1e-180  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.193482 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1029  hypothetical protein  31.82 
 
 
1419 aa  616  9.999999999999999e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2488  hypothetical protein  32.2 
 
 
1426 aa  615  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297377  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2894  putative transmembrane protein  32.26 
 
 
1426 aa  608  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2657  hypothetical protein  32.2 
 
 
1426 aa  583  1e-164  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3330  hypothetical protein  31.62 
 
 
1307 aa  571  1e-161  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000315008 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3970  hypothetical protein  31.12 
 
 
1430 aa  559  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.231617 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2507  hypothetical protein  30.79 
 
 
1419 aa  547  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380036  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0728  hypothetical protein  31.18 
 
 
1428 aa  535  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0711  hypothetical protein  31.79 
 
 
1399 aa  525  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.463012  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0257  hypothetical protein  32 
 
 
1399 aa  523  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.866424  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0741  hypothetical protein  32 
 
 
1399 aa  522  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77418  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2643  hypothetical protein  31.94 
 
 
1399 aa  522  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.73761 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3829  hypothetical protein  31.47 
 
 
1399 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0659  hypothetical protein  31.84 
 
 
1398 aa  510  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1218  hypothetical protein  32.22 
 
 
1341 aa  508  9.999999999999999e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0577669  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0634  hypothetical protein  31.76 
 
 
1398 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.913326  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1298  hypothetical protein  31.63 
 
 
1397 aa  498  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438344  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2335  hypothetical protein  31.87 
 
 
1368 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3332  hypothetical protein  31.94 
 
 
1397 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3288  hypothetical protein  31.94 
 
 
1397 aa  496  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0218679  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3321  hypothetical protein  31.94 
 
 
1397 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2216  hypothetical protein  31.87 
 
 
1372 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0519007  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0490  hypothetical protein  31.87 
 
 
1397 aa  492  1e-137  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1109  hypothetical protein  31.87 
 
 
1397 aa  492  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.823265  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1744  hypothetical protein  26.98 
 
 
1284 aa  481  1e-134  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0306491 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1057  hypothetical protein  28.65 
 
 
1264 aa  469  9.999999999999999e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0510  hypothetical protein  30.29 
 
 
1261 aa  446  1e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1776  membrane protein-like protein  23.42 
 
 
1384 aa  373  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1493  membrane protein-like protein  22.02 
 
 
1379 aa  345  2.9999999999999997e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0488  hypothetical protein  20.91 
 
 
1287 aa  221  8.999999999999998e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.135683  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03680  hypothetical protein  22.62 
 
 
1266 aa  218  5.9999999999999996e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2839  hypothetical protein  23.17 
 
 
1291 aa  217  9.999999999999999e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2656  hypothetical protein  23.35 
 
 
1288 aa  215  4.9999999999999996e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37084  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002388  possible exported protein  23.28 
 
 
1301 aa  214  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.267234  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0257  hypothetical protein  23.01 
 
 
1276 aa  213  3e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0380  hypothetical protein  25.04 
 
 
1265 aa  211  6e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4467  hypothetical protein  23.45 
 
 
1271 aa  207  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00502079  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0268  hypothetical protein  22.57 
 
 
1276 aa  207  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2270  membrane protein-like protein  25.37 
 
 
1304 aa  206  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0403  hypothetical protein  22.2 
 
 
1305 aa  202  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4158  hypothetical protein  22.8 
 
 
1271 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1719  hypothetical protein  20.15 
 
 
1273 aa  199  3e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0470  hypothetical protein  21.9 
 
 
1307 aa  198  7e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.196897  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1193  hypothetical protein  21.97 
 
 
1307 aa  197  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.879408  hitchhiker  0.00193389 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0843  hypothetical protein  22.02 
 
 
1267 aa  196  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.560634  normal  0.938035 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1719  hypothetical protein  19.94 
 
 
1273 aa  194  1e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4277  hypothetical protein  23.63 
 
 
1269 aa  192  5e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3467  hypothetical protein  22.07 
 
 
1416 aa  187  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3632  hypothetical protein  23.83 
 
 
1266 aa  186  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357405  normal  0.0273308 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3729  hypothetical protein  23.74 
 
 
1266 aa  186  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.424475  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3672  hypothetical protein  23.79 
 
 
1277 aa  186  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3561  hypothetical protein  23.64 
 
 
1266 aa  185  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3560  hypothetical protein  23.74 
 
 
1266 aa  185  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3667  hypothetical protein  23.74 
 
 
1266 aa  185  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3682  hypothetical protein  23.19 
 
 
1265 aa  184  7e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0188  hypothetical protein  20.88 
 
 
1301 aa  184  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3643  hypothetical protein  21.58 
 
 
1417 aa  183  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247251  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1988  membrane protein-like protein  24.62 
 
 
1300 aa  182  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3541  hypothetical protein  23.18 
 
 
1266 aa  183  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0579  hypothetical protein  21.63 
 
 
1383 aa  182  4.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0563  hypothetical protein  21.67 
 
 
1419 aa  181  7e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72639  normal  0.280407 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3277  hypothetical protein  23.23 
 
 
1266 aa  177  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.682788  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3728  hypothetical protein  22.99 
 
 
1266 aa  176  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0461  conserved hypothetical protein  22.99 
 
 
1266 aa  176  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.049997  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58090  hypothetical protein  22.99 
 
 
1276 aa  176  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03105  conserved membrane protein, predicted transporter  22.7 
 
 
1266 aa  175  5e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0723003  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03056  hypothetical protein  22.7 
 
 
1266 aa  175  5e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.102838  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0461  hypothetical protein  22.91 
 
 
1266 aa  175  5.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00853598  normal  0.775435 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3435  hypothetical protein  22.91 
 
 
1266 aa  174  9e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4562  hypothetical protein  22.97 
 
 
1266 aa  174  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190737  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3749  hypothetical protein  21.36 
 
 
1439 aa  172  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1735  membrane protein-like protein  22.21 
 
 
1346 aa  171  8e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4093  hypothetical protein  21.42 
 
 
1390 aa  168  5.9999999999999996e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0484  hypothetical protein  22.67 
 
 
1417 aa  168  8e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.814446 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5090  hypothetical protein  23.44 
 
 
1275 aa  167  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.340947  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0527  hypothetical protein  20.83 
 
 
1454 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2235  hypothetical protein  25.65 
 
 
1290 aa  163  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2136  hypothetical protein  26.34 
 
 
1141 aa  162  3e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0523  hypothetical protein  20.79 
 
 
1446 aa  161  7e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0861  membrane protein-like protein  24.49 
 
 
1273 aa  161  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.835961  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3733  hypothetical protein  21.27 
 
 
1443 aa  158  6e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0938  hypothetical protein  22.62 
 
 
1273 aa  157  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349009  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0945  hypothetical protein  23.95 
 
 
1271 aa  156  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12700  hypothetical protein  24.05 
 
 
1277 aa  154  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0978  hypothetical protein  22.33 
 
 
1271 aa  150  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4555  putative protease  21.34 
 
 
1323 aa  146  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0410  hypothetical protein  28.12 
 
 
1309 aa  139  5e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.103346 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4397  hypothetical protein  25.12 
 
 
1392 aa  137  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.963583  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>