123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0488 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0488  hypothetical protein  100 
 
 		 1287 aa  2612    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.135683  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002388  possible exported protein  48.27 
 
 		 1301 aa  1271    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.267234  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2839  hypothetical protein  47.67 
 
 		 1291 aa  1248    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03680  hypothetical protein  49.88 
 
 		 1266 aa  1281    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4406  hypothetical protein  28.48 
 
 		 1291 aa  543  9.999999999999999e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.213897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1193  hypothetical protein  28.19 
 
 		 1307 aa  541  9.999999999999999e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.879408  hitchhiker  0.00193389 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0470  hypothetical protein  28.26 
 
 		 1307 aa  540  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.196897  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0403  hypothetical protein  27.97 
 
 		 1305 aa  537  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3729  hypothetical protein  27.99 
 
 		 1266 aa  524  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.424475  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3632  hypothetical protein  27.91 
 
 		 1266 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357405  normal  0.0273308 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3561  hypothetical protein  27.99 
 
 		 1266 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3560  hypothetical protein  27.91 
 
 		 1266 aa  522  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3667  hypothetical protein  27.91 
 
 		 1266 aa  522  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0257  hypothetical protein  26.11 
 
 		 1276 aa  513  1e-144  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0268  hypothetical protein  26.11 
 
 		 1276 aa  513  1e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0461  conserved hypothetical protein  26.78 
 
 		 1266 aa  505  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.049997  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3728  hypothetical protein  26.78 
 
 		 1266 aa  505  1e-141  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0461  hypothetical protein  26.78 
 
 		 1266 aa  504  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00853598  normal  0.775435 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3541  hypothetical protein  26.63 
 
 		 1266 aa  505  1e-141  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3277  hypothetical protein  26.73 
 
 		 1266 aa  504  1e-141  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.682788  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03105  conserved membrane protein, predicted transporter  26.71 
 
 		 1266 aa  503  1e-140  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0723003  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3672  hypothetical protein  26.99 
 
 		 1277 aa  503  1e-140  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3435  hypothetical protein  26.78 
 
 		 1266 aa  502  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03056  hypothetical protein  26.71 
 
 		 1266 aa  503  1e-140  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.102838  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4562  hypothetical protein  26.63 
 
 		 1266 aa  500  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3682  hypothetical protein  26.48 
 
 		 1265 aa  488  1e-136  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3830  hypothetical protein  25.87 
 
 		 1284 aa  486  1e-135  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.238588  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0563  hypothetical protein  26.33 
 
 		 1419 aa  456  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72639  normal  0.280407 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0188  hypothetical protein  25.64 
 
 		 1301 aa  443  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0579  hypothetical protein  25.72 
 
 		 1383 aa  438  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4397  hypothetical protein  24.96 
 
 		 1392 aa  439  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.963583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1127  membrane protein-like protein  25.58 
 
 		 1294 aa  434  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.334782  normal  0.712644 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0502  hypothetical protein  25.49 
 
 		 1441 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0408  hypothetical protein  24.34 
 
 		 1436 aa  429  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0527  hypothetical protein  25.42 
 
 		 1454 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3749  hypothetical protein  25.93 
 
 		 1439 aa  429  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3733  hypothetical protein  23.67 
 
 		 1443 aa  424  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0523  hypothetical protein  25.27 
 
 		 1446 aa  425  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4093  hypothetical protein  25.83 
 
 		 1390 aa  421  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3817  hypothetical protein  25.26 
 
 		 1459 aa  423  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3643  hypothetical protein  25.45 
 
 		 1417 aa  415  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3467  hypothetical protein  24.77 
 
 		 1416 aa  412  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0484  hypothetical protein  25.17 
 
 		 1417 aa  412  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.814446 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4555  putative protease  25.48 
 
 		 1323 aa  406  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00269  putative protease  24.52 
 
 		 1331 aa  401  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3329  hypothetical protein  24.63 
 
 		 1419 aa  386  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0472  membrane protein  25.65 
 
 		 1515 aa  275  4.0000000000000004e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.50538 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1744  hypothetical protein  21.3 
 
 		 1284 aa  246  3e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0306491 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3330  hypothetical protein  22.14 
 
 		 1307 aa  244  7e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000315008 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0380  hypothetical protein  21.5 
 
 		 1265 aa  238  5.0000000000000005e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2270  membrane protein-like protein  20.91 
 
 		 1304 aa  228  6e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0510  hypothetical protein  21.42 
 
 		 1261 aa  220  2e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1218  hypothetical protein  21.72 
 
 		 1341 aa  219  2.9999999999999998e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0577669  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4158  hypothetical protein  21.21 
 
 		 1271 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0993  hypothetical protein  21.65 
 
 		 1398 aa  216  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.193482 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4656  hypothetical protein  21.11 
 
 		 1425 aa  216  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4467  hypothetical protein  21.08 
 
 		 1271 aa  215  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00502079  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3897  hypothetical protein  21.63 
 
 		 1379 aa  214  9e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.663381 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3187  exonuclease VII, small subunit  21.53 
 
 		 1380 aa  213  1e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2656  hypothetical protein  21.14 
 
 		 1288 aa  211  5e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37084  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0366  hypothetical protein  21.39 
 
 		 1381 aa  209  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5159  hypothetical protein  20.35 
 
 		 1394 aa  207  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0861  membrane protein-like protein  20.51 
 
 		 1273 aa  207  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.835961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4277  hypothetical protein  20.29 
 
 		 1269 aa  203  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1988  membrane protein-like protein  23.39 
 
 		 1300 aa  202  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0243  putative transmembrane protein  22.53 
 
 		 1472 aa  201  6e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.150673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12700  hypothetical protein  20.5 
 
 		 1277 aa  201  7.999999999999999e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1735  membrane protein-like protein  23.09 
 
 		 1346 aa  199  2.0000000000000003e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0849  hypothetical protein  22.09 
 
 		 1384 aa  196  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2235  hypothetical protein  21.67 
 
 		 1290 aa  192  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3368  hypothetical protein  21.06 
 
 		 1378 aa  190  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.48731  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0843  hypothetical protein  20.05 
 
 		 1267 aa  190  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.560634  normal  0.938035 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0938  hypothetical protein  19.43 
 
 		 1273 aa  189  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0945  hypothetical protein  19.56 
 
 		 1271 aa  188  7e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3970  hypothetical protein  22.75 
 
 		 1430 aa  187  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.231617 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0978  hypothetical protein  19.63 
 
 		 1271 aa  184  7e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1719  hypothetical protein  20.42 
 
 		 1273 aa  183  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2894  putative transmembrane protein  22.52 
 
 		 1426 aa  182  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1029  hypothetical protein  21.73 
 
 		 1419 aa  181  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1719  hypothetical protein  20.03 
 
 		 1273 aa  180  2e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2488  hypothetical protein  22.23 
 
 		 1426 aa  179  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297377  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2657  hypothetical protein  22.17 
 
 		 1426 aa  177  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1057  hypothetical protein  21.95 
 
 		 1264 aa  176  1.9999999999999998e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4655  hypothetical protein  20.11 
 
 		 1441 aa  174  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4831  hypothetical protein  19.32 
 
 		 1420 aa  172  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761382  normal  0.626491 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58090  hypothetical protein  18.89 
 
 		 1276 aa  171  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3520  putative transmembrane protein  21.57 
 
 		 1450 aa  167  9e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0199259 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2899  hypothetical protein  20.79 
 
 		 1283 aa  167  9e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1505  membrane protein-like  24.44 
 
 		 1283 aa  167  1.0000000000000001e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000453243  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2507  hypothetical protein  21.81 
 
 		 1419 aa  166  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3288  hypothetical protein  23.39 
 
 		 1397 aa  165  6e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0218679  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3321  hypothetical protein  23.39 
 
 		 1397 aa  165  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2136  hypothetical protein  23.7 
 
 		 1141 aa  164  1e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2643  hypothetical protein  23.68 
 
 		 1399 aa  163  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.73761 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0728  hypothetical protein  22.08 
 
 		 1428 aa  163  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5090  hypothetical protein  18.34 
 
 		 1275 aa  162  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.340947  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3332  hypothetical protein  23.29 
 
 		 1397 aa  162  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1942  membrane protein-like protein  20.4 
 
 		 1272 aa  162  5e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.307785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3829  hypothetical protein  21.77 
 
 		 1399 aa  160  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1298  hypothetical protein  22.95 
 
 		 1397 aa  160  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438344  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>