124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_58090 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0938  hypothetical protein  51.69 
 
 		 1273 aa  1224    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349009  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4467  hypothetical protein  53.93 
 
 		 1271 aa  1312    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00502079  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4158  hypothetical protein  53.98 
 
 		 1271 aa  1329    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0843  hypothetical protein  54.82 
 
 		 1267 aa  1343    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.560634  normal  0.938035 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12700  hypothetical protein  52.87 
 
 		 1277 aa  1236    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58090  hypothetical protein  100 
 
 		 1276 aa  2528    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0861  membrane protein-like protein  56.64 
 
 		 1273 aa  1351    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.835961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0978  hypothetical protein  51.85 
 
 		 1271 aa  1231    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5090  hypothetical protein  94.28 
 
 		 1275 aa  2322    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.340947  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0945  hypothetical protein  51.77 
 
 		 1271 aa  1228    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4277  hypothetical protein  51.69 
 
 		 1269 aa  1235    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3187  exonuclease VII, small subunit  23.93 
 
 		 1380 aa  367  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1942  membrane protein-like protein  25.08 
 
 		 1272 aa  303  1e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.307785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0410  hypothetical protein  28.18 
 
 		 1309 aa  288  5e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103346 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2235  hypothetical protein  25.45 
 
 		 1290 aa  279  3e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1744  hypothetical protein  23.18 
 
 		 1284 aa  265  3e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0306491 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2656  hypothetical protein  24.32 
 
 		 1288 aa  260  1e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37084  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1719  hypothetical protein  22.56 
 
 		 1273 aa  256  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1719  hypothetical protein  22 
 
 		 1273 aa  254  5.000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3330  hypothetical protein  24.69 
 
 		 1307 aa  247  9.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000315008 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0268  hypothetical protein  23.95 
 
 		 1276 aa  241  8e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2270  membrane protein-like protein  24.3 
 
 		 1304 aa  238  5.0000000000000005e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0257  hypothetical protein  23.44 
 
 		 1276 aa  237  9e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3830  hypothetical protein  24.18 
 
 		 1284 aa  226  2e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.238588  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002388  possible exported protein  20.85 
 
 		 1301 aa  226  3e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.267234  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3672  hypothetical protein  23.98 
 
 		 1277 aa  224  7e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4406  hypothetical protein  23.13 
 
 		 1291 aa  220  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.213897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2839  hypothetical protein  22.2 
 
 		 1291 aa  219  2e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3561  hypothetical protein  23.45 
 
 		 1266 aa  219  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3729  hypothetical protein  23.45 
 
 		 1266 aa  219  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.424475  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4397  hypothetical protein  22.72 
 
 		 1392 aa  219  2.9999999999999998e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.963583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3560  hypothetical protein  23.45 
 
 		 1266 aa  218  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3667  hypothetical protein  23.45 
 
 		 1266 aa  218  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3632  hypothetical protein  23.34 
 
 		 1266 aa  218  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357405  normal  0.0273308 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2899  hypothetical protein  24.64 
 
 		 1283 aa  218  5.9999999999999996e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0510  hypothetical protein  25.29 
 
 		 1261 aa  210  1e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1218  hypothetical protein  24.43 
 
 		 1341 aa  210  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0577669  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3682  hypothetical protein  22.77 
 
 		 1265 aa  208  6e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0849  hypothetical protein  22.99 
 
 		 1384 aa  207  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1057  hypothetical protein  22.92 
 
 		 1264 aa  203  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0188  hypothetical protein  22.43 
 
 		 1301 aa  203  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1988  membrane protein-like protein  24.64 
 
 		 1300 aa  202  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3541  hypothetical protein  21.86 
 
 		 1266 aa  202  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03105  conserved membrane protein, predicted transporter  21.78 
 
 		 1266 aa  201  7e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0723003  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03056  hypothetical protein  21.78 
 
 		 1266 aa  201  7e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.102838  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4562  hypothetical protein  21.84 
 
 		 1266 aa  199  3e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3435  hypothetical protein  21.84 
 
 		 1266 aa  199  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03680  hypothetical protein  19.86 
 
 		 1266 aa  198  7e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3728  hypothetical protein  21.76 
 
 		 1266 aa  198  7e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2723  membrane protein-like  32.05 
 
 		 1236 aa  197  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.439608  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0408  hypothetical protein  22.79 
 
 		 1436 aa  197  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3749  hypothetical protein  21.23 
 
 		 1439 aa  197  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0461  hypothetical protein  21.76 
 
 		 1266 aa  197  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00853598  normal  0.775435 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0461  conserved hypothetical protein  21.74 
 
 		 1266 aa  196  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.049997  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3368  hypothetical protein  23.68 
 
 		 1378 aa  196  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.48731  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3277  hypothetical protein  21.61 
 
 		 1266 aa  195  4e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.682788  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4555  putative protease  21.47 
 
 		 1323 aa  192  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1029  hypothetical protein  24.52 
 
 		 1419 aa  186  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0380  hypothetical protein  24.66 
 
 		 1265 aa  185  4.0000000000000006e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3897  hypothetical protein  23.66 
 
 		 1379 aa  184  9.000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.663381 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0512  hypothetical protein  22.89 
 
 		 1153 aa  176  2.9999999999999996e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.350168  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0471  hypothetical protein  24.13 
 
 		 1286 aa  175  3.9999999999999995e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.356031  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1645  hypothetical protein  22.6 
 
 		 1153 aa  172  3e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000756943  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0411  hypothetical protein  24.13 
 
 		 1274 aa  172  3e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.68904  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4656  hypothetical protein  22.67 
 
 		 1425 aa  171  8e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0488  hypothetical protein  19.23 
 
 		 1287 aa  169  4e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.135683  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00269  putative protease  21.32 
 
 		 1331 aa  167  9e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0993  hypothetical protein  22.76 
 
 		 1398 aa  164  9e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.193482 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4018  hypothetical protein  25.59 
 
 		 1418 aa  162  6e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.938248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2136  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1141 aa  159  3e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3733  hypothetical protein  20.61 
 
 		 1443 aa  158  6e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0563  hypothetical protein  21.84 
 
 		 1419 aa  151  7e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72639  normal  0.280407 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3329  hypothetical protein  21.33 
 
 		 1419 aa  151  8e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1193  hypothetical protein  23.51 
 
 		 1307 aa  150  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.879408  hitchhiker  0.00193389 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2657  hypothetical protein  23.36 
 
 		 1426 aa  149  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0403  hypothetical protein  23.47 
 
 		 1305 aa  148  6e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0470  hypothetical protein  23.59 
 
 		 1307 aa  148  7.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.196897  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4655  hypothetical protein  22.95 
 
 		 1441 aa  147  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3467  hypothetical protein  21.05 
 
 		 1416 aa  147  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3643  hypothetical protein  21.52 
 
 		 1417 aa  146  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247251  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2488  hypothetical protein  22.87 
 
 		 1426 aa  143  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1127  membrane protein-like protein  21.71 
 
 		 1294 aa  143  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.334782  normal  0.712644 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0243  putative transmembrane protein  23.56 
 
 		 1472 aa  142  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.150673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0484  hypothetical protein  21.21 
 
 		 1417 aa  141  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.814446 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0527  hypothetical protein  21.81 
 
 		 1454 aa  140  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3520  putative transmembrane protein  23.9 
 
 		 1450 aa  139  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0199259 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5159  hypothetical protein  23.31 
 
 		 1394 aa  139  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3817  hypothetical protein  21.16 
 
 		 1459 aa  139  5e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2894  putative transmembrane protein  22.21 
 
 		 1426 aa  135  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4831  hypothetical protein  22.41 
 
 		 1420 aa  135  5e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761382  normal  0.626491 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01889  hypothetical protein  24.93 
 
 		 1306 aa  134  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0523  hypothetical protein  21.29 
 
 		 1446 aa  131  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4093  hypothetical protein  20.41 
 
 		 1390 aa  130  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0366  hypothetical protein  23.42 
 
 		 1381 aa  130  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1776  membrane protein-like protein  20.77 
 
 		 1384 aa  127  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0728  hypothetical protein  21.35 
 
 		 1428 aa  122  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1735  membrane protein-like protein  24.4 
 
 		 1346 aa  121  9e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3970  hypothetical protein  20.9 
 
 		 1430 aa  119  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.231617 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3332  hypothetical protein  22.74 
 
 		 1397 aa  119  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2335  hypothetical protein  22.63 
 
 		 1368 aa  118  6e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>