122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00269 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0188  hypothetical protein  37.81 
 
 		 1301 aa  917    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00269  putative protease  100 
 
 		 1331 aa  2707    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4555  putative protease  28.01 
 
 		 1323 aa  546  1e-154  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0579  hypothetical protein  29.19 
 
 		 1383 aa  537  1e-151  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3643  hypothetical protein  27.81 
 
 		 1417 aa  498  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3467  hypothetical protein  27.49 
 
 		 1416 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3733  hypothetical protein  27.52 
 
 		 1443 aa  496  9.999999999999999e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0563  hypothetical protein  28.59 
 
 		 1419 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72639  normal  0.280407 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4397  hypothetical protein  27.78 
 
 		 1392 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.963583  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4093  hypothetical protein  28.04 
 
 		 1390 aa  491  1e-137  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0484  hypothetical protein  27.59 
 
 		 1417 aa  493  1e-137  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.814446 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0502  hypothetical protein  28.03 
 
 		 1441 aa  493  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0527  hypothetical protein  27.96 
 
 		 1454 aa  489  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3817  hypothetical protein  27.73 
 
 		 1459 aa  488  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0523  hypothetical protein  27.58 
 
 		 1446 aa  488  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0408  hypothetical protein  26.52 
 
 		 1436 aa  463  9.999999999999999e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3749  hypothetical protein  27.48 
 
 		 1439 aa  462  9.999999999999999e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03680  hypothetical protein  25.86 
 
 		 1266 aa  438  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002388  possible exported protein  24.91 
 
 		 1301 aa  432  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.267234  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2839  hypothetical protein  25.93 
 
 		 1291 aa  422  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3329  hypothetical protein  25.33 
 
 		 1419 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0488  hypothetical protein  24.27 
 
 		 1287 aa  401  9.999999999999999e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.135683  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1127  membrane protein-like protein  24.53 
 
 		 1294 aa  387  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.334782  normal  0.712644 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4406  hypothetical protein  25.04 
 
 		 1291 aa  390  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.213897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3632  hypothetical protein  25.64 
 
 		 1266 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357405  normal  0.0273308 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3561  hypothetical protein  25.6 
 
 		 1266 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3729  hypothetical protein  25.55 
 
 		 1266 aa  380  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.424475  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3560  hypothetical protein  25.57 
 
 		 1266 aa  380  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0257  hypothetical protein  24.62 
 
 		 1276 aa  379  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3667  hypothetical protein  25.57 
 
 		 1266 aa  380  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0268  hypothetical protein  24.05 
 
 		 1276 aa  369  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3672  hypothetical protein  24.32 
 
 		 1277 aa  358  2.9999999999999997e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0461  hypothetical protein  24.98 
 
 		 1266 aa  355  2e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00853598  normal  0.775435 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3541  hypothetical protein  25.02 
 
 		 1266 aa  355  2e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03105  conserved membrane protein, predicted transporter  24.98 
 
 		 1266 aa  355  4e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0723003  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03056  hypothetical protein  24.98 
 
 		 1266 aa  355  4e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.102838  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3435  hypothetical protein  24.9 
 
 		 1266 aa  353  8e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3277  hypothetical protein  24.73 
 
 		 1266 aa  352  3e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.682788  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3728  hypothetical protein  24.87 
 
 		 1266 aa  350  1e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0461  conserved hypothetical protein  25.04 
 
 		 1266 aa  349  2e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.049997  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3830  hypothetical protein  23.65 
 
 		 1284 aa  349  2e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.238588  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4562  hypothetical protein  24.9 
 
 		 1266 aa  348  3e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3682  hypothetical protein  24.68 
 
 		 1265 aa  348  5e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0470  hypothetical protein  23.38 
 
 		 1307 aa  342  2.9999999999999998e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.196897  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1193  hypothetical protein  23.23 
 
 		 1307 aa  341  5e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.879408  hitchhiker  0.00193389 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0403  hypothetical protein  23.23 
 
 		 1305 aa  338  5e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0472  membrane protein  26.8 
 
 		 1515 aa  278  6e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.50538 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0380  hypothetical protein  22.45 
 
 		 1265 aa  224  7e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2270  membrane protein-like protein  21.38 
 
 		 1304 aa  222  3.9999999999999997e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1719  hypothetical protein  21.35 
 
 		 1273 aa  209  3e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0510  hypothetical protein  22.91 
 
 		 1261 aa  209  4e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1744  hypothetical protein  21.67 
 
 		 1284 aa  208  4e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0306491 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1719  hypothetical protein  21.12 
 
 		 1273 aa  206  3e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2656  hypothetical protein  20.28 
 
 		 1288 aa  194  7e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37084  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1988  membrane protein-like protein  22.34 
 
 		 1300 aa  192  5e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0843  hypothetical protein  21.5 
 
 		 1267 aa  172  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.560634  normal  0.938035 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58090  hypothetical protein  21.04 
 
 		 1276 aa  163  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3330  hypothetical protein  20.98 
 
 		 1307 aa  161  9e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000315008 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5090  hypothetical protein  20.75 
 
 		 1275 aa  160  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.340947  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4158  hypothetical protein  22.3 
 
 		 1271 aa  158  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1505  membrane protein-like  22.92 
 
 		 1283 aa  154  1e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000453243  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4467  hypothetical protein  23.31 
 
 		 1271 aa  153  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00502079  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0861  membrane protein-like protein  21.3 
 
 		 1273 aa  154  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.835961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4277  hypothetical protein  19.94 
 
 		 1269 aa  149  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1057  hypothetical protein  20.49 
 
 		 1264 aa  144  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0945  hypothetical protein  19.82 
 
 		 1271 aa  140  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0978  hypothetical protein  19.24 
 
 		 1271 aa  138  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1029  hypothetical protein  20.94 
 
 		 1419 aa  137  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1776  membrane protein-like protein  21.37 
 
 		 1384 aa  137  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0938  hypothetical protein  18.98 
 
 		 1273 aa  136  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1218  hypothetical protein  20.4 
 
 		 1341 aa  136  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0577669  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0711  hypothetical protein  22.52 
 
 		 1399 aa  130  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.463012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01889  hypothetical protein  29.27 
 
 		 1306 aa  130  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0741  hypothetical protein  22.78 
 
 		 1399 aa  128  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77418  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2899  hypothetical protein  29.2 
 
 		 1283 aa  127  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0993  hypothetical protein  20.33 
 
 		 1398 aa  126  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.193482 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0257  hypothetical protein  22.78 
 
 		 1399 aa  126  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.866424  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3332  hypothetical protein  22.16 
 
 		 1397 aa  124  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3829  hypothetical protein  22.33 
 
 		 1399 aa  124  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1298  hypothetical protein  22.52 
 
 		 1397 aa  124  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438344  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3897  hypothetical protein  20.24 
 
 		 1379 aa  124  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.663381 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2335  hypothetical protein  21.99 
 
 		 1368 aa  123  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0490  hypothetical protein  22.28 
 
 		 1397 aa  123  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1109  hypothetical protein  22.28 
 
 		 1397 aa  123  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.823265  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2216  hypothetical protein  21.99 
 
 		 1372 aa  122  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0519007  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1493  membrane protein-like protein  21.72 
 
 		 1379 aa  123  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0366  hypothetical protein  20.26 
 
 		 1381 aa  122  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0410  hypothetical protein  24.66 
 
 		 1309 aa  122  3.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103346 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3288  hypothetical protein  21.77 
 
 		 1397 aa  121  7e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0218679  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12700  hypothetical protein  20.54 
 
 		 1277 aa  121  7.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3187  exonuclease VII, small subunit  20.05 
 
 		 1380 aa  121  7.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3321  hypothetical protein  22.06 
 
 		 1397 aa  121  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5159  hypothetical protein  21 
 
 		 1394 aa  121  9e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1645  hypothetical protein  28.01 
 
 		 1153 aa  119  3e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000756943  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0512  hypothetical protein  28.01 
 
 		 1153 aa  119  3.9999999999999997e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.350168  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2643  hypothetical protein  22.24 
 
 		 1399 aa  119  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.73761 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0471  hypothetical protein  25.07 
 
 		 1286 aa  116  3e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.356031  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0411  hypothetical protein  26.33 
 
 		 1274 aa  116  3e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.68904  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0849  hypothetical protein  21.14 
 
 		 1384 aa  115  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2488  hypothetical protein  20.04 
 
 		 1426 aa  112  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297377  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>