128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0471 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0471  hypothetical protein  100 
 
 
1286 aa  2540    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.356031  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0411  hypothetical protein  97.41 
 
 
1274 aa  2354    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.68904  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01889  hypothetical protein  53.74 
 
 
1306 aa  1241    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2899  hypothetical protein  50.12 
 
 
1283 aa  1187    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2656  hypothetical protein  26.24 
 
 
1288 aa  283  1e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37084  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1719  hypothetical protein  22.21 
 
 
1273 aa  282  3e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3330  hypothetical protein  25.98 
 
 
1307 aa  278  6e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000315008 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1719  hypothetical protein  22.15 
 
 
1273 aa  270  1e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0510  hypothetical protein  26.49 
 
 
1261 aa  266  3e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2270  membrane protein-like protein  26.16 
 
 
1304 aa  265  6e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0410  hypothetical protein  25.91 
 
 
1309 aa  249  3e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.103346 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1988  membrane protein-like protein  25.39 
 
 
1300 aa  246  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1744  hypothetical protein  22.42 
 
 
1284 aa  245  3.9999999999999997e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0306491 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2136  hypothetical protein  28.74 
 
 
1141 aa  220  1e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1057  hypothetical protein  23.81 
 
 
1264 aa  212  4e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1218  hypothetical protein  25.08 
 
 
1341 aa  204  8e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0577669  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4406  hypothetical protein  23.89 
 
 
1291 aa  202  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.213897  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1735  membrane protein-like protein  23.21 
 
 
1346 aa  202  5e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0366  hypothetical protein  24.41 
 
 
1381 aa  198  7e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0843  hypothetical protein  23.71 
 
 
1267 aa  195  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.560634  normal  0.938035 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3672  hypothetical protein  23.61 
 
 
1277 aa  195  4e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0380  hypothetical protein  25.52 
 
 
1265 aa  194  8e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1193  hypothetical protein  22.99 
 
 
1307 aa  194  9e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.879408  hitchhiker  0.00193389 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0470  hypothetical protein  22.84 
 
 
1307 aa  192  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.196897  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0257  hypothetical protein  24.2 
 
 
1276 aa  191  7e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3897  hypothetical protein  26.45 
 
 
1379 aa  190  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.663381 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0403  hypothetical protein  22.69 
 
 
1305 aa  190  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58090  hypothetical protein  24.15 
 
 
1276 aa  189  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4277  hypothetical protein  22.98 
 
 
1269 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3830  hypothetical protein  22.95 
 
 
1284 aa  187  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.238588  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0978  hypothetical protein  23.12 
 
 
1271 aa  185  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3561  hypothetical protein  22.78 
 
 
1266 aa  185  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3632  hypothetical protein  22.68 
 
 
1266 aa  184  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357405  normal  0.0273308 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3560  hypothetical protein  22.68 
 
 
1266 aa  184  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3667  hypothetical protein  22.68 
 
 
1266 aa  184  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3729  hypothetical protein  22.68 
 
 
1266 aa  184  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.424475  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0268  hypothetical protein  22.41 
 
 
1276 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4397  hypothetical protein  22.74 
 
 
1392 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.963583  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0849  hypothetical protein  25.15 
 
 
1384 aa  182  4.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4555  putative protease  22.88 
 
 
1323 aa  181  5.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3682  hypothetical protein  23.45 
 
 
1265 aa  180  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0945  hypothetical protein  22.48 
 
 
1271 aa  176  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3728  hypothetical protein  22.36 
 
 
1266 aa  174  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5159  hypothetical protein  25.64 
 
 
1394 aa  174  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3541  hypothetical protein  22.34 
 
 
1266 aa  174  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0461  conserved hypothetical protein  22.25 
 
 
1266 aa  172  4e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.049997  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0488  hypothetical protein  21.2 
 
 
1287 aa  172  4e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.135683  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4093  hypothetical protein  22.21 
 
 
1390 aa  172  5e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03105  conserved membrane protein, predicted transporter  22.29 
 
 
1266 aa  171  6e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0723003  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03056  hypothetical protein  22.29 
 
 
1266 aa  171  6e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.102838  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3277  hypothetical protein  22.68 
 
 
1266 aa  171  8e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.682788  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4158  hypothetical protein  24.18 
 
 
1271 aa  171  9e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03680  hypothetical protein  22.4 
 
 
1266 aa  171  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0461  hypothetical protein  22.29 
 
 
1266 aa  171  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00853598  normal  0.775435 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4467  hypothetical protein  23.69 
 
 
1271 aa  170  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00502079  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3435  hypothetical protein  22.29 
 
 
1266 aa  169  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2488  hypothetical protein  23.89 
 
 
1426 aa  167  9e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297377  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3749  hypothetical protein  22.32 
 
 
1439 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2643  hypothetical protein  26.64 
 
 
1399 aa  165  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.73761 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4562  hypothetical protein  22.41 
 
 
1266 aa  165  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190737  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2894  putative transmembrane protein  24 
 
 
1426 aa  165  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4831  hypothetical protein  26.11 
 
 
1420 aa  165  7e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761382  normal  0.626491 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3467  hypothetical protein  22.01 
 
 
1416 aa  164  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0634  hypothetical protein  26.3 
 
 
1398 aa  164  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.913326  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002388  possible exported protein  21.39 
 
 
1301 aa  164  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.267234  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3829  hypothetical protein  25.75 
 
 
1399 aa  162  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0711  hypothetical protein  25.48 
 
 
1399 aa  163  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.463012  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0938  hypothetical protein  23.08 
 
 
1273 aa  162  5e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349009  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0659  hypothetical protein  26.18 
 
 
1398 aa  162  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2657  hypothetical protein  25.03 
 
 
1426 aa  161  8e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0257  hypothetical protein  25.48 
 
 
1399 aa  160  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.866424  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0741  hypothetical protein  25.48 
 
 
1399 aa  160  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77418  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0188  hypothetical protein  21.82 
 
 
1301 aa  159  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0861  membrane protein-like protein  25.3 
 
 
1273 aa  159  4e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.835961  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3643  hypothetical protein  21.47 
 
 
1417 aa  159  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247251  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0993  hypothetical protein  23.71 
 
 
1398 aa  157  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.193482 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0484  hypothetical protein  22.46 
 
 
1417 aa  157  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.814446 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3733  hypothetical protein  21.93 
 
 
1443 aa  156  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3329  hypothetical protein  22.72 
 
 
1419 aa  154  8e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5090  hypothetical protein  24.93 
 
 
1275 aa  154  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.340947  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12700  hypothetical protein  24.42 
 
 
1277 aa  152  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0512  hypothetical protein  28.57 
 
 
1153 aa  150  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.350168  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1645  hypothetical protein  28.57 
 
 
1153 aa  150  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000756943  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3187  exonuclease VII, small subunit  21.13 
 
 
1380 aa  147  9e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4655  hypothetical protein  29.47 
 
 
1441 aa  147  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431718  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1505  membrane protein-like  20.25 
 
 
1283 aa  146  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000453243  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2507  hypothetical protein  23.37 
 
 
1419 aa  146  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380036  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1942  membrane protein-like protein  22.23 
 
 
1272 aa  145  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.307785  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1298  hypothetical protein  24 
 
 
1397 aa  144  8e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438344  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2335  hypothetical protein  24.18 
 
 
1368 aa  144  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3288  hypothetical protein  24.16 
 
 
1397 aa  144  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0218679  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3321  hypothetical protein  24.26 
 
 
1397 aa  144  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0579  hypothetical protein  20.24 
 
 
1383 aa  144  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0490  hypothetical protein  24.18 
 
 
1397 aa  144  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1109  hypothetical protein  24.18 
 
 
1397 aa  144  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.823265  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2216  hypothetical protein  24.18 
 
 
1372 aa  144  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0519007  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1127  membrane protein-like protein  19.86 
 
 
1294 aa  142  3.9999999999999997e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.334782  normal  0.712644 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1029  hypothetical protein  22.72 
 
 
1419 aa  142  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3332  hypothetical protein  24.16 
 
 
1397 aa  142  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2839  hypothetical protein  22.66 
 
 
1291 aa  142  4.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>