129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4555 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4555  putative protease  100 
 
 		 1323 aa  2686    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0188  hypothetical protein  29.6 
 
 		 1301 aa  570  1e-161  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0563  hypothetical protein  28.31 
 
 		 1419 aa  526  1e-147  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72639  normal  0.280407 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00269  putative protease  27.89 
 
 		 1331 aa  523  1e-146  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0408  hypothetical protein  27.94 
 
 		 1436 aa  487  1e-136  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3749  hypothetical protein  28.03 
 
 		 1439 aa  485  1e-135  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4397  hypothetical protein  27.3 
 
 		 1392 aa  481  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.963583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3733  hypothetical protein  27.12 
 
 		 1443 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0579  hypothetical protein  27.25 
 
 		 1383 aa  462  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0502  hypothetical protein  26.95 
 
 		 1441 aa  443  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4093  hypothetical protein  26.59 
 
 		 1390 aa  438  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0527  hypothetical protein  26.65 
 
 		 1454 aa  435  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3643  hypothetical protein  25.57 
 
 		 1417 aa  435  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3329  hypothetical protein  26.38 
 
 		 1419 aa  431  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3817  hypothetical protein  26.34 
 
 		 1459 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0523  hypothetical protein  26.53 
 
 		 1446 aa  432  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3467  hypothetical protein  25.68 
 
 		 1416 aa  426  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002388  possible exported protein  25.17 
 
 		 1301 aa  424  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.267234  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0484  hypothetical protein  26.11 
 
 		 1417 aa  421  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.814446 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4406  hypothetical protein  26.27 
 
 		 1291 aa  421  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.213897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2839  hypothetical protein  24.62 
 
 		 1291 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3672  hypothetical protein  24.46 
 
 		 1277 aa  405  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03680  hypothetical protein  25.16 
 
 		 1266 aa  406  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3830  hypothetical protein  23.87 
 
 		 1284 aa  399  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.238588  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0488  hypothetical protein  25.5 
 
 		 1287 aa  393  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.135683  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0461  conserved hypothetical protein  24.35 
 
 		 1266 aa  387  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.049997  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3561  hypothetical protein  24.3 
 
 		 1266 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03105  conserved membrane protein, predicted transporter  24.39 
 
 		 1266 aa  384  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0723003  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3667  hypothetical protein  24.24 
 
 		 1266 aa  386  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3632  hypothetical protein  24.24 
 
 		 1266 aa  386  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357405  normal  0.0273308 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3560  hypothetical protein  24.24 
 
 		 1266 aa  386  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3729  hypothetical protein  24.24 
 
 		 1266 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.424475  normal  0.178844 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03056  hypothetical protein  24.39 
 
 		 1266 aa  384  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.102838  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0403  hypothetical protein  23.26 
 
 		 1305 aa  384  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3728  hypothetical protein  24.35 
 
 		 1266 aa  386  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3541  hypothetical protein  24.47 
 
 		 1266 aa  385  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3435  hypothetical protein  24.31 
 
 		 1266 aa  382  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1193  hypothetical protein  22.94 
 
 		 1307 aa  382  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.879408  hitchhiker  0.00193389 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0257  hypothetical protein  23.54 
 
 		 1276 aa  381  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4562  hypothetical protein  24.31 
 
 		 1266 aa  379  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0470  hypothetical protein  23.24 
 
 		 1307 aa  379  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.196897  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0461  hypothetical protein  24.24 
 
 		 1266 aa  379  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00853598  normal  0.775435 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3277  hypothetical protein  23.97 
 
 		 1266 aa  375  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.682788  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0268  hypothetical protein  23.44 
 
 		 1276 aa  372  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3682  hypothetical protein  23.67 
 
 		 1265 aa  371  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1127  membrane protein-like protein  23.49 
 
 		 1294 aa  338  5e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.334782  normal  0.712644 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0472  membrane protein  26.3 
 
 		 1515 aa  294  8e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.50538 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4467  hypothetical protein  22.85 
 
 		 1271 aa  237  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00502079  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4158  hypothetical protein  22.6 
 
 		 1271 aa  226  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1719  hypothetical protein  21.75 
 
 		 1273 aa  225  3e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1744  hypothetical protein  22.25 
 
 		 1284 aa  226  3e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0306491 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1719  hypothetical protein  21.5 
 
 		 1273 aa  224  9.999999999999999e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3330  hypothetical protein  21.53 
 
 		 1307 aa  223  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000315008 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0410  hypothetical protein  22.74 
 
 		 1309 aa  216  2.9999999999999995e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103346 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4277  hypothetical protein  22.15 
 
 		 1269 aa  215  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0861  membrane protein-like protein  21.68 
 
 		 1273 aa  213  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.835961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0945  hypothetical protein  21.8 
 
 		 1271 aa  209  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2270  membrane protein-like protein  21.04 
 
 		 1304 aa  206  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0843  hypothetical protein  20.84 
 
 		 1267 aa  200  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.560634  normal  0.938035 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0938  hypothetical protein  21.55 
 
 		 1273 aa  192  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0978  hypothetical protein  21.38 
 
 		 1271 aa  193  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2899  hypothetical protein  20.67 
 
 		 1283 aa  181  7e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1505  membrane protein-like  23.78 
 
 		 1283 aa  181  1e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000453243  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58090  hypothetical protein  21.2 
 
 		 1276 aa  178  6e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1988  membrane protein-like protein  21.92 
 
 		 1300 aa  177  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3897  hypothetical protein  22.25 
 
 		 1379 aa  174  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.663381 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2136  hypothetical protein  22.54 
 
 		 1141 aa  173  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5159  hypothetical protein  22.15 
 
 		 1394 aa  169  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12700  hypothetical protein  21.3 
 
 		 1277 aa  169  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0471  hypothetical protein  22.68 
 
 		 1286 aa  169  2.9999999999999998e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.356031  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1057  hypothetical protein  19.52 
 
 		 1264 aa  168  8e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4655  hypothetical protein  22.15 
 
 		 1441 aa  167  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1218  hypothetical protein  19.98 
 
 		 1341 aa  164  8.000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0577669  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5090  hypothetical protein  20.73 
 
 		 1275 aa  164  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.340947  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01889  hypothetical protein  20.06 
 
 		 1306 aa  158  5.0000000000000005e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0366  hypothetical protein  22.63 
 
 		 1381 aa  148  5e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2656  hypothetical protein  20.12 
 
 		 1288 aa  148  8.000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37084  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4831  hypothetical protein  21.13 
 
 		 1420 aa  145  4e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761382  normal  0.626491 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1029  hypothetical protein  20.59 
 
 		 1419 aa  142  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0849  hypothetical protein  21.44 
 
 		 1384 aa  139  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2894  putative transmembrane protein  21.19 
 
 		 1426 aa  137  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2488  hypothetical protein  21.39 
 
 		 1426 aa  136  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3520  putative transmembrane protein  21.74 
 
 		 1450 aa  132  4.0000000000000003e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0199259 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0993  hypothetical protein  20.73 
 
 		 1398 aa  132  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.193482 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0380  hypothetical protein  19.69 
 
 		 1265 aa  130  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0705  membrane protein-like protein  21.53 
 
 		 1224 aa  126  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.113545  hitchhiker  0.00000969857 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0549  hypothetical protein  21.74 
 
 		 1210 aa  125  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2657  hypothetical protein  19.98 
 
 		 1426 aa  122  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3187  exonuclease VII, small subunit  18.67 
 
 		 1380 aa  121  7e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0512  hypothetical protein  20.64 
 
 		 1153 aa  120  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.350168  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1645  hypothetical protein  20.64 
 
 		 1153 aa  120  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000756943  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0741  hypothetical protein  21.93 
 
 		 1399 aa  119  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77418  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3829  hypothetical protein  21.47 
 
 		 1399 aa  118  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1298  hypothetical protein  22.16 
 
 		 1397 aa  119  6e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438344  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0711  hypothetical protein  21.88 
 
 		 1399 aa  118  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.463012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2643  hypothetical protein  21.92 
 
 		 1399 aa  118  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.73761 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0257  hypothetical protein  21.93 
 
 		 1399 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.866424  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0659  hypothetical protein  21.64 
 
 		 1398 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0634  hypothetical protein  21.13 
 
 		 1398 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.913326  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3321  hypothetical protein  21.74 
 
 		 1397 aa  110  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>